Атлас — первая в России клиника персонализированной медицины и биомедицинский холдинг с международными амбициями. Мы проводим генетические тесты и интерпретируем их с помощью суперкомпьютеров IBM Watson и IBM Bluemix.

Мы расширяем онкодиагностику и ищем биоинформатика. Наш идеальный кандидат:

• умеет обрабатывать NGS,
• любит кодить,
• готов анализировать соматические мутации,
• готов разобраться в биологии биомаркеров и клинической онкологии.

Обязанности:

• Запуск, оптимизация и проверка уже написанных протоколов анализа NGS
• Разработка новых программ и скриптов
• Поиск и обзор новых сторонних программ
• Мониторинг достижений и трендов в области NGS для онкологии и медгенетики

• Образование в области биоинформатики, математики, физики или биологии
• Знание молекулярной биологии и генетики
• Знание Python, Perl или Java
• Знание Linux и Bash
• Опыт с NGS: bwa/bowtie, samtools, bedtools, вариант коллинг, аннотация
• Знание основ статистики в биологии
• Опыт работы с биоинформатическими БД
• Знание MySQL

Будет плюсом:

• Знание медицинской онкологии или медицинской генетики
• Знание машинного обучения
• Опыт разработки биоинформатического ПО/пайплайнов
• Знание R, matlab, mathematica
• Опыт ведения репозитория

не указано

• Офис в особняке на Малой Никитской, в трех минутах от м. Баррикадная
• Полная или половинчатая занятость
• В команде генетики, биоинформатики, программисты, маркетологи, врачи и другие веселые ребята
• Неформальное общение с лидерами биомеда на наших вечеринках

Основные статьи сотрудников отдела:

• RANDTRAN: random transcriptome sequence generator that accounts for partition specific features in eukaryotic mRNA datasets
• Computational approaches to study the effects of small genomic variations
• Towards standardization of next-generation sequencing of FFPE samples for clinical oncology: intrinsic obstacles and possible solutions
• Non-random fragmentation patterns in circulating cell-free DNA reflect epigenetic regulation
• A reliable method to concentrate circulating DNA