Кситест — лидер геномной селекции в России и СНГ, единственная компания с международной аккредитацией ICAR. Мы повышаем продуктивность и здоровье сельскохозяйственных животных с помощью геномных оценок племенной ценности. Среди наших клиентов — крупнейшие агрохолдинги страны.

Мы ищем сильного специалиста в команду, отвечающую за аналитическое ядро продукта: пайплайны обработки данных, модели прогноза, математическую оптимизацию и исследовательские задачи.

Вам предстоит участвовать во всех частях разработки продукта — от проектирования пайплайнов и моделей до контроля качества результатов, которые получают клиенты. У вас будет прямое влияние на решения, определяющие развитие исследовательской части продукта, и возможность формировать планы и видение этого направления.

Чем предстоит заниматься:

• Проектировать и развивать пайплайны обработки генотипов, загрузки фенотипов, расчёт племенных оценок.
• Поддерживать и улучшать модельное ядро: BLUP / ssGBLUP, оценка дисперсионных компонент, селекционные индексы.
• Развивать инфраструктуру данных: миграция промежуточного хранилища на колоночные СУБД (ClickHouse), проектирование схем, обеспечение идемпотентности и воспроизводимости пайплайнов.
• Вести исследовательскую работу: проверка гипотез по улучшению точности оценок, новые модели, новые признаки.
• Работать с задачами математической оптимизации (подбор пар, минимизация инбридинга, формирование племенного ядра).
• Обеспечивать контроль качества на всех этапах: от сырых данных до финальных индексов, которые видит клиент.

Почему стоит рассмотреть вакансию

• Уникальный домен. Геномная селекция — одна из немногих областей, где модели и инженерия данных напрямую меняют реальный мир: продуктивность стад, здоровье животных, экономику целых регионов.
• Влияние на продукт. Возможность формировать видение и планы исследовательской части продукта, а не просто выполнять задачи по списку.
• Нетривиальные задачи. Смешанные модели на десятках тысяч животных, комбинаторная оптимизация подбора пар, импутация генотипов, мультитрейтовые корреляции.

Обязательно:

• 5+ лет опыта в разработке систем обработки данных на Python.
• Опыт проектирования и поддержки промышленных пайплайнов (загрузка, трансформация, модели, аналитика) — не только ноутбуки и прототипы.
• Сильный SQL (оконные функции, CTE, оптимизация запросов, работа со схемами).
• Опыт работы с колоночными или аналитическими СУБД (ClickHouse, Vertica, BigQuery, DuckDB).
• Уверенное владение статистикой, машинным обучением или математической оптимизацией в промышленном контексте.
• Опыт миграции или рефакторинга существующих пайплайнов без остановки работающей системы.
• Самостоятельность: способность разобраться в чужом коде, в незнакомом домене, принять решение и довести до результата.

Большой плюс:

• Опыт в биоинформатике, количественной генетике или смежных областях (медицинская генетика, популяционная генетика).
• Знание BLUP/GBLUP, анализа родословных, работы с SNP-данными.
• Опыт с вероятностными моделями (байесовский вывод, MCMC, EM-алгоритм).
• Опыт в доменах с высокой ценой ошибки, где неточность в данных имеет реальные последствия.
  

  Стек и контекст

  • Python (pandas, NumPy, SciPy, SQLAlchemy, boto3) — основной язык всех пайплайнов.
  • PostgreSQL — продуктовая БД, сложные аналитические SQL-запросы.
  • ClickHouse — целевая СУБД для аналитического хранилища.
  • Apache Airflow — оркестрация пайплайнов.
  • MiXBLUP — движок смешанных моделей для расчёта племенных оценок.
  • PLINK, KING, Beagle — биоинформатические инструменты для анализа генотипов.
  • TensorFlow Probability, cvxpy, MOSEK — вероятностные модели и оптимизация.
  • S3 — хранение генотипных данных.

  Не обязательно знать всё из списка. Обязательно — уметь быстро разбираться в незнакомых инструментах и доменах.

Как проходит отбор

1. Рассмотрение заявки.

2. Техническое интервью (90 мин): два кейса — системный дизайн аналитического пайплайна и исследовательская задача с погружением в домен.

3. Встреча с руководителем компании (30 мин).

Откликайтесь, если хотите развивать аналитическое ядро компании, которая меняет сельское хозяйство с помощью генетики.

Формат: гибрид (офис в центре Москвы + удалёнка)

График: 5/2

Зарплата: по результатам собеседования.