Лаборатория искусственного интеллекта в геномике и инженерной биологии (AIGEN Lab) Биологического факультета МГУ имени М.В. Ломоносова, созданная под руководством ведущего ученым Сергея Анатольевича Шмакова в рамках масштабного мегагранта РНФ на 2026–2030 годы. Наша команда работает на стыке ИИ, сравнительной метагеномики и синтетической биологии, занимаясь компьютерным дизайном, структурным моделированием и экспериментальной валидацией принципиально новых, патентно-чистых молекулярных инструментов редактирования геномов и эпигеномов. Для реализации этого междисциплинарного проекта и проведения высокопроизводительных вычислительных исследований мы ищем амбициозных магистрантов и аспирантов, готовых разрабатывать новые подходы машинного обучения, решать сложные биоинформатические задачи и создавать прорывные генетические технологии совместно с лидерами биотехнологического рынка, среди которых:

• Биоинформатический анализ метагеномов, мобильных генетических элементов и систем защиты прокариот.
• Использование и создание новых алгоритмов машинного обучения и вычислительных методов для поиска и характеризации новых систем редактирования геномов (CRISPR-Cas, TnpB).
• Разработка и тестирование программного комплекса/платформы для дизайна белков под заданные параметры (специфичность, компактность).
• Компьютерное моделирование биомолекулярных взаимодействий (белок-белок, белок-нуклеиновая кислота).
• Обработка данных вычислительной биологии и подготовка баз данных и открытых веб-порталов.
• Подготовка материалов и публикация научных работ лаборатории в ведущих международных журналах.

• Статус студента магистратуры или аспиранта (либо планирование поступления в ближайшее время) по направлениям: биоинформатика, вычислительная/молекулярная биология, биофизика, прикладная математика или компьютерные науки (CS).
• Базовые навыки программирования на Python или R, знание Linux и основ работы с Git.
• Понимание ключевых концепций молекулярной биологии, генетики или структурной биоинформатики.
• Опыт работы с ДНК и белковыми последовательностями или CRISPR-системами будет весомым преимуществом.
• Желание развиваться в науке, решать междисциплинарные задачи и публиковаться в высокоуровневых журналах.

Конкурентная заработная плата по результатам собеседования.

• Официальное трудоустройство по договору в ФГБОУ ВО «МГУ имени М.В. Ломоносова» (Биологический факультет).
• Гибкий рабочий график, возможность комфортно совмещать исследования с учебой в университете и сдачей сессий.
• Работа в Москве на территории главного кампуса МГУ.
• Уникальный шанс выполнять свою реальную магистерскую дипломную работу или кандидатскую диссертацию на базе актуальных проектов лаборатории.
• Работа под руководством ведущего ученого Сергея Шмакова (PhD, ex-NIH/NCBI) в сильной и дружной молодой команде.
• Доступ к суперкомпьютерной инфраструктуре МГУ.
• Возможность увидеть, как ваши вычислительные предсказания отправляются на реальную экспериментальную лабораторию.
• Налаженное взаимодействие и контакты с лидерами индустрии, что дает отличные перспективы для дальнейшей карьеры в коммерческом биотехе.