Вакансия закрыта работодателем

Биоинформатик с опытом работы с human small RNA

Обязанности

Держатели гранта РНФ ищут опытного биоинформатика для обработки данных NGS малой РНК сперматозоидов и лейкоцитов человека с имеющейся мотивацией написания статей. Цель проекта — изучение профиля малой некодирующей РНК сперматозоидов и лейкоцитов, его связи с хроническим перипубертатным воздействием химических веществ и качеством семени в проспективной когорте молодых мужчин, наблюдаемых с восьмилетнего возраста.

Также у проекта есть экспериментальный компонент, где изучается малая РНК сперматозоидов и печени крыс.

Руководитель проекта — Олег Сергеев, MD, PhD.

Примерные задачи на три месяца:

  • работа с данными малой РНК библиотек, полученных с помощью набора Biooscientific и секвенированных на NextSeq 500;
  • триммирование, картирование на геном, фильтрация рРНК, аннотирование и анализ распределения чтений по группам малой РНК (микроРНК, piwiРНК. тРНК и др);
  • анализ профиля экспрессии различных малых РНК в различных типах клеток (лейкоциты, сперматозоиды, печень);
  • прочие обсчеты, связанные с микроРНК;
  • подготовка драфта статьи

В последующем – участие в разработке биостатистических и биоинформатических подходов для поиска зависимости профиля экспрессии малых РНК от интересуемых предикторов (химические токсиканты и факторы образа жизни)

Требования

  • Опыт в анализе малых РНК
  • Желателен опыт работы с малой РНК сперматозоидов
  • Знание английского и русского языка на уровне возможности вести обсуждение в международной команде и написания публикаций
  • Навыки написания собственных скриптов и кодов
  • Отслеживание появлений новых версий ПО
  • Знание основных биологических баз данных и умение работать с ними

Условия

  • Работа удаленная, но занятость полная,
  • Работа в междисциплинарном научном коллективе, обсуждение на русском и английском языках,
  • Зарплата 110 к₽ в первые 3 месяца, затем – в зависимости от дальнейшего направления работ и степени вовлеченности сотрудника.
Перетащите файл сюда Выбрать файл ...
Отправляя отклик, я соглашаюсь с политикой обработки персональных данных