Биоинформатик-аналитик

в ИППИ РАН (посмотреть профиль)
Город Moscow, Russian Federation
Опубликовано 30.09.2019
Категория Биоинформатика
Тип вакансии Полная занятость
Удаленно
Частичная занятость
Адрес Цветной Бульвар

Обязанности

Удаленная работа в небольшом коллективе над исследовательским проектом по анализу микробиома человека с помощью метаболического профилирования при поддержке гранта РНФ.

Анализ публикаций по метагеномике микробиома человека, поиск и обработка связанных метагеномных данных (16S, WGS), в том числе с использованием специально-созданного в лаборатории конвейера для обработки 16S данных и общедоступных биоинформатических скриптов, статистическая обработка полученных профилей (таксономия, функциональные системы) для групп метагеномных образцов с доступными метаданными, поиск ассоциаций между профилями и метаданными (болезни, лекарства, особенности питания и образа жизни), в том числе с применением методов машинного обучения, а также с экспериментальными данными по метаболомике, транскриптомике и пр.

Требования

  • необходимый бэкграунд по биологии и биоинформатике (желательно знание методов метагеномики)
  • опыт работы с научной литературой и биоинформатическими базами данных (быстрое чтение/просмотр статей на английском, критический анализ работы, аннотирование базы данных основными характеристиками исследования, поиск и сбор ассоциированных данных и метаданных).
  • уверенный опыт работы в Unix, скрипты на python/pandas (как локально, так и на удаленных серверах типа AWS)
  • биостатистика в R

 

Условия

Удаленная работа над проектами в режиме спринтов, свободный график, регулярные конференц-колы (SkyPe, Hangouts).

Оформление в ИППИ РАН на постоянную работу или по совместительству после испытательного срока (с ноября-декабря).

Зарплата в диапазоне 60-80 тыс./мес.

Участие в научных метоприятиях (конференции/школы) и научных публикациях коллектива (список прошлых публикаций - https://www.ncbi.nlm.nih.gov/myncbi/dmitry.rodionov.1/bibliography/public/)

 

Перетащите файл сюда Выбрать файл ...
Отправляя отклик, я соглашаюсь с политикой обработки персональных данных