Биоинформатик-аналитик в области альтернативного сплайсинга

в BostonGene (посмотреть профиль)
Город Moscow, Russian Federation
Опубликовано 18.11.2019
Категория Биоинформатика
Тип вакансии Полная занятость
Адрес Шлюзовая набережная, 6/4, м.Павелецкая

Обязанности

  • Анализ литературы по альтернативному сплайсингу в опухоли;
  • разработка и валидация пайплайна по коллингу мутаций в данных RNA-seq;
  • создание базы функциональных транскриптов, влияющих на терапию;
  • участие в разработке инструмента по оценке активности молекулярных путей в образцах опухоли.

Требования

Вы:

  • Магистерская степень по биоинформатике, молекулярной биологии, информатике или схожих дисциплинах, или 2+ года работы в роли биоинформатика в науке и индустрии;
  • аналитический склад ума, умение искать нужную информацию в публикациях, анализировать и систематизировать;
  • быстро учитесь и умеете находить нужную информацию в незнакомой теме;
  • хороший командный игрок, но можете работать независимо и эффективно. Не боитесь спрашивать, когда это нужно и умеете гуглить и читать StackOverflow, biostars;
  • 2+ года опыта в Python, GNU coreutils.

Предпочтительные квалификация и опыт:

  • Знания в области RNA-seq и опыт работы с инструментами для его анализа (STAR, HTSeq, edgeR, kallisto, sleuth, ...);
  • опыт в визуализации данных (matplotlib, seaborn; ggplot2);
  • опыт работы с биоинформатическими базами данных (ncbi, UCSC, UniProt, Pfam, ENCODE, GTEx, ...);
  • опыт в статистическом анализе данных (понимание основных подходов в методах дифференциальной экспрессии, сравнения групп выборок).

Бонусом будет опыт:

  • Работы с R;
  • cовместного решения задач с программистами;
  • анализа данных опухоли человека или мыши;
  • в управлении командой, использование сервисов для управления задачами (JIRA, Asana и др.).

Условия

  • Полный рабочий день, возможен гибкий график;
  • удаленная работа не предусмотрена;
  • молодой разносторонний коллектив биоинформатиков, программистов, медиков и биологов тесно взаимодействующих друг с другом;
  • офис в 10 минутах от метро Павелецкая;
  • открытость к новым идеями, которые могут принести пользу продукту.
Перетащите файл сюда Выбрать файл ...
Отправляя отклик, я соглашаюсь с политикой обработки персональных данных