Вакансия закрыта работодателем

Биоинформатик широкого профиля

Обязанности

Требования

Высшее образование (биоинформатическое, биотехнологическое, математическое, биологическое, медико-биологическое), любовь к молекулярной биологии/генетике и биоинформатике.

Опыт работы с NGS данными (WGS, WES, RNAseq, ChipSeq).

Умение работать с пакетами биоинформатических программ BWA, FastQC, SAMTools, Picard, GATK, знание основных биоинформатических форматов данных.

Знание и умение работать с геномными базами данных.

Уверенное владение одним или несколькими скриптовыми языками программирования, такими как R или Python с пакетами для анализа данных (pandas, numpy, scipy и т.д.).

Опыт в визуализации данных (matplotlib, seaborn; ggplot2).

Уверенные навыки работы в Unix-подобных системах.

Опыт совместной разработки, работа в Git.

Умение работать в Docker.

Навыки работы с базами данных, знание SQL.

Опыт работы с массовыми вычисления, знание системы очередей.

Базовые знания биологии, понимание основ генетики человека.

Навыки работы в системах управления задачами (JIRA и др.).

Умение вести самостоятельный исследовательский проект.

Опыт управления командой или преподавания.

Умение готовить документацию и инструктивные материалы.

Навыки разработки и оптимизации пайплайнов для анализа данных секвенирования.

Аналитический склад ума, умение искать нужную информацию в публикациях, анализировать и систематизировать данные.

Высокая мотивация, желание осваивать новое.

Быстрая обучаемость.

Внимательность, ответственность.

Уверенное владение техническим английским языком (уровень не ниже Upper Intermediate).

Желателен:

Опыт работы с COSMIC и TCGA.

Опыт выявления соматических мутаций.

Опыт выявления изменения копийности элементов генома и их структурных перестроек.

Опыт работы с GWAS, определением степени родства по генетическим данным и тд.

Опыт обработки данных РНК-секвенирования (в т.ч. single cell), анализа дифференциальной экспрессии генов, опыт работы с инструментами STAR, HTSeq, edgeR, kallisto, sleuth, и т.п.

Опыт поиска молекулярных путей по молекулярным данным различных типов

Знание CWL.

Глубокие знания в иммунологии и понимание принципов действия противоопухолевых препаратов.

Хорошее знание статистики и основ молекулярной биологии, генетики человека.

Знание статистических пакетов (GraphPad Prism, Statsoft Statistica, SAS, SPSS и т.д.).

Опыт проектирования веб-интерфейсов баз генетических данных.

Опыт работы с такими сервисами, как GitLab, Jenkins, Nexus и т.д.

Навыки компиляции ПО из исходного кода.

Готовность к командировкам/стажировкам в том числе за границей.

Возможность full-time работы

Общие:

  1. Навыки самостоятельной работы.
  2. Знание технического английского языка.
  3. Системный склад мышления.
  4. Инициативность.
  5. Ответственность.
  6. Организованность.
  7. Готовность работать в команде.
  8. Умение хранить служебную тайну.

Условия

м.Щукинская

Рабочий график: 5/2.

Рабочее время: с 9:00 до 17:30, включая 30 мин. на обед. (с 9:30 до 18:00)

Рабочее место: индивидуальное, полностью оборудованное, в комнате на 6 чел.

Техническое оснащение: современный мощный ноутбук с двумя мониторами.

Повышение квалификации: возможна работа над диссертацией, имеется свой диссертационный совет; возможно посещение конференций и других мероприятий по теме работы.

Перетащите файл сюда Выбрать файл ...
Отправляя отклик, я соглашаюсь с политикой обработки персональных данных