Биоинформатик, Single-cell Sequencing

в ImmunoMind (посмотреть профиль)
Город Москва / Удаленно, Russian Federation
Опубликовано 12.11.2020
Категория Биоинформатика
Тип вакансии Полная занятость
Удаленно

Обязанности

Хештеги: single-cell биоинформатика, 90,000 - 190,000, полностью удаленно, вычислительная иммунология для помощи пациентам, молодая биотех-компания из стартап-акселератора при университете Беркли с международными коллаборациями.

Подробнее о компании и процессе найма: здесь.

Кратко:

  • Что делать? Помогать в разработке ультра-быстрой библиотеки (на GPU и кластерах) для анализа single-cell sequencing данных с текущим фокусом на транскриптомике в раке, аутоиммунных и орфанных заболеваниях, а также пайплайнов для разработки лекарств и поиска их побочных эффектов.
  • Кого ищем? Человека с опытом в HTS и омиксной биоинформатике с интересом и желанием развиваться в сторону управления командой биоинформатиков.
  • Куда расти? Старший биоинформатик по single-cell, тимлид команды биоинформатиков, директор по single-cell биоинформатике. Смежные области, куда можно развиваться: продуктовый менеджмент, immunogenomics биоинформатика, Machine Learning / Deep Learning / Data Science.

 

Компания. ImmunoMind - биотехнологический стартап из Беркли, Калифорния в сфере вычислительной иммунологии. Наша миссия – объединить иммунологию и ИИ чтобы сделать разработку персонализированных лекарств доступной большему числу фарма и биотех компаний. Мы прошли через топ-5 акселератор Кремниевой Долины Berkeley SkyDeck (1% рейт приема). Наш продукт - платформа для быстрого и сверх-точного анализа данных иммунной системы для разработки лекарств и поиска их побочных эффектов в раке, аутоиммунных и орфанных заболеваниях.

Что нужно делать? Помогать в разработке ультра-быстрой библиотеки (на GPU и кластерах) для анализа single-cell sequencing данных с текущим фокусом на транскриптомике в раке, аутоиммунных и орфанных заболеваниях, а также пайплайнов для разработки лекарств и поиска их побочных эффектов. Мы ищем опытного биоинформатика с опытом в HTS и омиксных технологиях с интересом и желанием развиваться в сторону управления командой биоинформатиков.

Задачи:

  • Анализ данных single-cell RNA sequencing экспериментов для поиска новых мишеней для лекарств и их побочных эффектов
  • Анализ публикаций и разработка пайплайнов на основе лучших практик
  • Составление спецификации биоинформатических алгоритмов и методов анализа для инженеров и разработчиков
  • Описание результатов исследований в виде научных статей и блог-постов
  • Коммуникация с клиентами, коллабораторами и членами сообщества

Требования

  • Критичные требования:
    • Уверенное владение R/Python для биоинформатики
    • Опыт работы с биоинформатическими базами данных NCBI, EMBL-EBI, MSigDB
    • Опыт завершённого проекта по анализу данных эксперимента с RNA sequencing – от fasta до результатов
    • Вы ответственны и держите обещания. Если что-то не получается или есть сложности - смело говорите об этом.
    • У вас есть мотивация решать сложные задачи в биомедицине.
  • Плюсом будет опыт и умение разработки чистого, документированного, производительного и покрытого тестами кода.

Условия

  • Полностью удаленная работа, используем GitHub / Notion / Slack / Zoom для коммуникации и менеджмента.
  • Большой фокус на индивидуальном подходе к коллегам: регулярные встречи и планирование карьерного развития.
  • Вилка: 90,000 - 190,000, опционная программа.
Перетащите файл сюда Выбрать файл ...
Отправляя отклик, я соглашаюсь с политикой обработки персональных данных