Биоинформатик/database разработчик

в Insilico Medicine
Город Москва, Russian Federation
Опубликовано 01.02.2021
Категория Биоинформатика
Тип вакансии Полная занятость

Обязанности

Международная компания Insilico Medicine применяет современные модели машинного обучения для поиска новых лекарств, делает веб-сервисы и инфраструктуру для построения экспериментов и работы с биомедицинскими данными.

Мы ищем программиста с  опытом в биоинформатике, умеющим разбираться в  биологических онтологиях (гены, болезни, биологические процессы).

Основные задачи:

  • поддержка баз данных онтологий различных биологических сущностей (генов, болезней, физиологически активных веществ, биологических процессов и др.);
  • интеграция сторонних онтологий, объединение внешних баз с внутренней базой;
  • программирование интерфейсов для быстрого доступа к базе данных, агрегирования статистики, взаимодействия с другими сервисами компании;
  • взаимодействие с командой разработчиков для создания биоинформатических сервисов на основе базы данных онтологий;
  • взаимодействие с командой  анализа текстов и обработкой естественного языка, разработка пайплайнов для контроля качества модулей на основе анализа текстов, выработка критериев для интеграции новых данных в базу;
  • использование внутренних и сторонних биоинформатических сервисов для анализа механизмов заболеваний, поиска биомаркеров, терапевтически значимых молекулярных мишеней и физиологически активных веществ для проверки качества данных во внутренней базе онтологий;
  • отчеты, патенты, статьи по результатам работы.

Требования

опыт использования Python для задач, связанных с обработкой и визуализацией биологических данных;

  • опыт работы с базами данных MongoDB, PostgreSQL/MySQL, Elasticsearch;
  • плюсом будет  опыт  участия в проектах, связанных с биоинформатикой, ML и статистикой;
  • плюсом будет знание основных Linux-сервисов, опыт программирования Bash, JavaScript/TypeScript/Node.js;
  • отлично, если вы умеете работать в команде, планировать эксперимент, использовать сервисы для управления задачами, документацией (JIRA, Asana и др.);
  • английский не ниже Intermediate;
  • профильное образование.

Условия

  • международная компания и коллектив;
  • офис в технопарке Сколково;
  • конкурентная по рынку и своевременная зарплата, бонусы;
  • полная занятость (40 часов в неделю), гибкий график;
  • перспективы профессионального роста, обучения, публикаций.

Также мы ищем Биоинформатика/Менеджера базы омиксных данных

Перетащите файл сюда Выбрать файл ...
Отправляя отклик, я соглашаюсь с политикой обработки персональных данных