Биоинформатик

в Atlas Biomed Group
Город Москва, Russian Federation
Опубликовано 02.04.2021
Категория Биоинформатика
Тип вакансии Полная занятость

Обязанности

Атлас – международный биомедицинский холдинг, занимающийся передовыми генетическими исследованиями в различных отраслях, в том числе в онкологии. В рамках онкологического проекта мы помогаем больным, подбирая лучшее лечение на основе молекулярного профилирования опухолей. На позиции программиста-биоинформатика вам будет предложено вести поддержку наших проектов: от разработки диагностических тест-систем до научных проектов и реализации собственных биоинформатических алгоритмов. Вы будете работать в команде  биологов, биоинформатиков, клинических онкологов, маркетологов и не только.

Требования

  • Python/Jupyter/R/SQL/docker/git/linux;
  • Знание NGS (различные технологии/основные принципы пробоподготовки/основные источники систематических и случайных ошибок) - WES/WGS/target enrichment (amplicon based/hybridization based)/RNA-seq/Methylation Sequencing;
  • Обязательные биоинформатические навыки: анализ данных ДНК-секвенирования (variant calling/CNV detection), анализ данных РНК-секвенирование (диф. экспрессия) — различные пакеты/инструменты для подобного рода анализа, их плюсы/минусы, область приложения, ограничения;
  • Знание основных форматов данных: .sam/.bam, .fastq, .bed, .wig;
  • Базы данных/инструментарий (из обязательного): genome browser/ensembl/IGV(tablet)/samtools/GATK/bedtools;
  • Знание основ/принципов машинного обучения — чем глубже, тем лучше;
  • Написание скриптов на языке Python для анализа биологических данных — настройка пайплайна "с нуля под ключ";
  • Написание оригинального ПО на Python/алгоритмическое программирование.

Обязательно:

  • ненулевой математический бэкгранд (желательно профильное высшее образование) + статистика;
  • ненулевой биологический бэкграунд (курсы/профильное высшее образоваине) (молбиол/генетика, плюсом будет онкология).
  • Плюсом будет понимание принципов разработки диагностических тест-систем/медицинской генетики/клинической онкологии.

Условия

  • Уютный офис-особняк в центре Москвы, 5 минут пешком от м. Баррикадная (сейчас работаем в основном удаленно);
  • Молодая и дружная команда профессионалов;
  • Full-time (готовы обсуждать гибкий график);
  • Достойная заработная плата.
Перетащите файл сюда Выбрать файл ...
Отправляя отклик, я соглашаюсь с политикой обработки персональных данных