В лабораторию РНК и нейродегенерации (MDC, Берлин) требуется мотивированный аспирант или постдок/научный сотрудник. ALS является нейродегенеративным заболеванием, поражающим моторные нейроны, т.е. нейроны, которые контролируют сокращение скелетных мышц. Несмотря на неоднородную этиологию, для ALS характерны нарушения метаболизма РНК. Успешный кандидат будет работать с индуцированными плюрипотентными стволовыми клетками (hiPSC) полученными из фибробластов ALS пациентов и моторными нейронами, чтобы исследовать, как изменения в метаболизме РНК способствуют механизму нейродегенерации. Проект включает набор методов: омика (NGS, Ribo-seq, CLIP-seq), CRISPR/Cas, флуоресцентная микроскопия, а также сотрудничество с международными партнерами.

Идеальный кандидат должен иметь степень мастера (для позиции аспиранта) или кандидата наук (для позиции постдока) в области биологии, биохимии, химии или смежных дисциплин. Требуется опыт работы с клеточными культурами (поддержание в культуре, трансфекция, генерация стабильных клеточных линий) и знание базовых методов молекулярной биологии (клонирование, выделение ДНК, ПЦР, электрофорез, вестерн-блоттинг), отличные коммуникативные и организационные навыки, а также знание английского. Опыт работы с hiPSC и РНК методами являются преимуществом.

не указано

Чтобы подать заявку, пожалуйста, отправьте свое мотивационное письмо, резюме и контактные данные как минимум двух рекомендателей в одном пдф файле на адрес marina(dot)chekulaeva(at)mdc-berlin(dot)de. 

Рекомендуемая литература:

1. von Kuegelgen N$, Mendonsa S$, Dantsuji S$, Ron M$, Kirchner M, Zerna N, Bujanic L, Mertins P, Ulitsky I# and Chekulaeva M# (2021). Massively parallel identification of zipcodes in primary cortical neurons. BioRxiv https://doi.org/1101/2021.10.21.465275
2. Mendonsa S, von Kuegelgen N, Bujanic L and Chekulaeva M (2021). Charcot–Marie–Tooth mutation in glycyl-tRNA synthetase stalls ribosomes in a pre-accommodation state and activates integrated stress response. Nucleic Acids Research. https://doi.org/10.1093/nar/gkab730
3. Ciolli Mattioli C., Rom A., Franke V., Imami K., Arrey G., Terne M., Woehler A., Akalin A., Ulitsky I., and Chekulaeva M. (2018). Alternative 3′ UTRs direct localization of functionally diverse protein isoforms in neuronal compartments. Nucleic Acids Research, https://doi.org/10.1093/nar/gky1270
4. Zappulo, A.*, van den Bruck, D.*, Ciolli Mattioli, C.*, Franke, V.*, Imami, K., McShane, E., Moreno-Estelles, M., Calviello, L., Filiipchyk, A., Peguero-Sanchez, E., Mueller, T., Woehler, A., Birchmeier, C., Merino, E., Rajewsky, N., Ohler. , Mazzoni, E., Selbach, M., Akalin, A., and Chekulaeva, M. (2017). RNA localization is a key determinant of neurite-enriched proteome. Nature Communications, http://dx.doi.org/10.1038/s41467-017-00690-6