Основные направления работы лаборатории геномики прокариот Курчатовского геномного центра:

• геномика промышленных микроорганизмов
• метагеномика (включая профилирование сообществ по маркерным генам и shotgun-метагеномику)
• метагеномика единичных клеток

Более детально с работой КГЦ и научными работами можно ознакомиться здесь:

https://nrckigc.ru/

и здесь:

https://www.researchgate.net/profile/Stepan-Toshchakov

Ищем кандидата для биоинформатической обработки данных секвенирования, а именно:

• (приоритетно) анализ данных 16S-метабаркодирования в среде R; визуализация результатов, статистический анализ;
• обработка shotgun-метагеномных данных: сборка, биннинг, геномная таксономия, филогения и функциональный анализ метагеномных «корзин»; визуализация результатов анализа
• обработка данных секвенирования чистых культур промышленно значимых микроорганизмов (ВКПМ) и других интересных микробов (в т.ч. мицелиальных грибов и дрожжей), сравнительная и эволюционная геномика, филогения, геномная таксономия;
• подготовка статей/отчетов
• первичная обработка данных NGS, организация хранения данных и метаданных

...при наличии времени (что маловероятно, работы много) и желания есть возможность осваивать лабораторные методы NGS

Минимальные требования

1. Биологическое образование, желательно с уклоном в биохимию/микробиологию
2. Свободное владение командной строкой Unix.
3. Владение R.
4. Желание и способность самостоятельно (при этом, конечно, консультируясь) осваивать новые методики, учитывая, что вся литература только на английском
5. Организованность в протоколировании рабочих процессов, опыт составления отчетов
6. Соответствие научных интересов направлениям работы лаборатории

Возможные преимущества кандидата при приеме на работу

1. Опыт работы с данными 16S-метабаркодирования, знание доступных алгоритмов и баз данных, их преимуществ и недостатков; опыт работы с пакетами R vegan, phyloseq, microbiome, DeSeq и т.д.
2. Владение статистическими методами анализа данных (ординация, дисперсионный анализ и т.д.)
3. Способность к биологической интерпретации данных
4. Научные публикации

Зарплата по результатам собеседования, однако в среднем чуть выше рынка.

Доступ к вычислительным ресурсам КГЦ, рабочие станции также имеются.

В зависимости от уровня кандидата возможны различные варианты занятости, как частичная, так и полная. Возможна (хоть и не очень приветствуется) удаленная работа, территориально расположены на м. Октябрьское поле. 

Трудоустройство по ТК РФ, з/п по результатам собеседования