Биоинформатик

в НИИ эпидемиологии и микробиологии им. Пастера (посмотреть профиль)
Город Санкт-Петербург, Russian Federation
Опубликовано 15.11.2022
Категория Биоинформатика
Адрес ул. Мира, д.14 м. Горьковская

Обязанности

В новую группу молекулярно-генетического мониторинга НИИ эпидемиологии и микробиологии им. Пастера требуется биоинформатик с опытом работы.

Работа направлена на изучение генетических особенностей и эволюции SARS-Cov-2 и других вирусов. Лаборатория оснащена самым передовым оборудованием, участвует в

международных проектах.

 

Чем предстоит заниматься

  • Обработка данных NGS;
  • Разработка алгоритмов и сборка биоинформатических пайплайнов;
  • Работа с БД, депонирование последовательностей;
  • Поиск новых подходов анализа NGS-данных;
  • Участие в написании статей

Требования

Необходимые навыки:

  • Свободное владение Linux;
  • Уверенное использование Python для задач, связанных с обработкой и визуализацией биологических данных;
  • Написание и адаптация существующих shell-скриптов (bash, sh);
  • Формализация биологических задач и поиск подходов к их решению;
  • Разработка протоколов исследований, определение требований к входным данным, выбор критериев оценки качества результатов;
  • Четкое понимание основных форматов представления биологических данных: FASTA, FASTQ, SAM, BAM, BED, VCF, PDB (и др.). Знание основных программ для их обработки (samtools, bedtools, vcftools, bcftools, picard-tools, SnpEff, SnpSift, GATK, FastQC и др.);
  • Понимание основных платформ NGS, комбинирование получаемых данных для получения лучшего результата.

Желательные навыки:

  • Дополнительные языки программирования (R, Perl);
  • Навыки картирования и сборки данных секвенирования;
  • Опыт работы с системами контроля версий (git);
  • Приветствуется желание развиваться в научной сфере, в том числе в области изучения эволюции вирусов;
  • Уровень английского языка (устный/письменный) - не ниже intermediate.

Специальности: биоинформатика, биостатистика, медицинская кибернетика, биофизика, биохимия.

Зарплата

Зарплата зависит от вашего опыта и обсуждается с успешно прошедшим собеседование кандидатом.

Условия

  • Полная занятость;
  • Работа в офисе, м. Горьковская;
  • Молодой, активный и дружный коллектив;
  • Официальное оформление по ТК РФ;
  • Испытательный срок - 3 месяца;
  • Возможность заниматься научной работой, участвовать в образовательных программах и конференциях, в том числе международных, публиковать результаты научной деятельности;
  • Профессиональный рост.

 

Откликнуться                  
Перетащите файл сюда Выбрать файл ...
Отправляя отклик, я соглашаюсь с политикой обработки персональных данных

Рекомендуемые курсы для этой вакансии: