Научный сотрудник (биоинформатик)

в МФТИ (посмотреть профиль)
Город Москва, Russian Federation
Опубликовано 10.05.2023
Категория Биоинформатика
Тип вакансии Полная занятость
Постдок или научный сотрудник

Обязанности

Мы ищем коллегу в новою Лабораторию Системной Геномики и Мобиломики Растений МФТИ (заведующий лабораторией - к.б.н., PhD Киров И.В.), созданную совместно с ФГБНУ ВНИИСБ. Цель проекта связана  с изучением влияния новых инсерций мобильных элементов генома на транскриптомный и эпигенетический ландшафт. Используя уникальную технологию, мы активируем мобильные элементы генома растений и создаём популяции сельскохозяйственных и модельных растений с пулом новых инсерций транспозонов в геноме (интервью для PCR.news). Ваша работа будет связана с биоинформатическим анализом и интерпретацией данных нанопорового и Illumina секвенирования ДНК и РНК.

В обязанности будет входить:

  • Создание пайплайнов для работы с данными NGS и Oxford Nanopore.
  • RNAseq анализ.
  • Анализ метилирования ДНК по данным нанопорового секвенирования.
  • ​Анализ структурных вариаций генома. 
  • ​Анализ комплексности транскриптома по данным нанопорового секвенирования.
  • Визуализация данных, обучение сотрудников, презентации по итогам работы.
  • Написание научных статей в рейтинговых журналах (Q1-Q2).
  • Активное участие в научных мероприятиях института.

Требования

  • Степень кандидата наук или PhD.
  • Ответственность, исполнительность и дружелюбность.
  • Желание учиться и делиться знаниями.
  • Уверенное владение Linux.
  • Python/R для решения биологических задач.
  • Знание английского на уровне чтения и написания статей.
  • Опыт работы в Git.
  • Опыт написания статей Q1.
  • Не менее 3 статей в журналах Q1 за последние три года, где вы первый автор или автор для переписки.

Зарплата

Зарплата от 100 000 рублей, в зависимости от вашего опыта и количества задач, которые вы можете успешно решать параллельно.

Условия

  1. Молодой и дружный коллектив.
  2. Участие в различных научных мероприятиях.
  3. Соавторство в публикациях Q1.
  4. Высокопроизводительные сервера.
  5. Хорошее современное оборудование.
  6. Возможность реализовывать свои идеи в рамках текущих проектов
  7. Новый офис и вкусный кофе.

Рекомендуемые курсы для этой вакансии: