Биоинформатик

в Plastilin (посмотреть профиль)
Город Москва, Russian Federation
Опубликовано 29.01.2024
Категория Биоинформатика
Тип вакансии Полная занятость
Адрес Технопарк Сколково (м. Сколково)

Обязанности

Компания Plastilin оптимизирует и ускоряет получение новых сортов сельскохозяйственных растений совместно с крупнейшими агрохолдингами. Мы делаем это за счет технологий генетического редактирования и автоматизации анализа генотипов и фенотипов.

Своей основной целью мы ставим выведение новых сортов растений, которые будут кратно превосходить имеющиеся в урожайности, питательной ценности (белковости, масличности и т.д.), устойчивости к изменениям климата и патогенам. Одно из направлений работы – анализ генетической информации о сортах, ее связи с фенотипами, составление рекомендательных схем по ведению селекционного процесса и его автоматизации за счет создания собственной платформы.

https://plastilin.team/ 

Обязанности

  • Разработка, оптимизация и автоматизация пайплайнов по обработке NGS данных
  • Поиск и интеграция новых инструментов для оптимизации работы пайплайнов, добавление новых функций
  • Создание и внедрение в анализ моделей предсказания хозяйственно-ценных признаков растений по геномным данным

Требования

  • Владение Python, R, bash
  • Опыт работы с языками для масштабирования пайплайнов (CWL, Nextflow, Snakemake etc.)
  • Понимание работы конвейера для анализа NGS данных, опыт работы с биоинформатическими инструментами для анализа геномных данных
  • Опыт работы с серверами на базе Linux
  • Свободное владение английским языком для чтения научной литературы и технической документации (уровень B2 или выше)

Плюсом будет

  • Опыт работы с облачными вычислениями (Yandex Cloud, Selectel, AWS ect.)
  • Опыт работы с Docker
  • Знание статистики, молекулярной биологии, популяционной генетики
  • Опыт проведения GWAS анализа
  • Знание SQL

Условия

  • Гибкий график (30-40 часов в неделю)
  • Возможность работать как в офисе в Москве, так и удаленно
  • Социальная защищенность - прозрачные условия трудоустройства; трудоустройство по ТК РФ, фиксированная белая зарплата (оклад + бонус)

Преимущества:

  • Участие в быстро развивающемся международном стартапе, первого в России сервиса рекомендательных систем для дизайна растений
Откликнуться                  
Перетащите файл сюда Выбрать файл ...
Отправляя отклик, я соглашаюсь с политикой обработки персональных данных

Рекомендуемые курсы для этой вакансии: