Компания Plastilin оптимизирует и ускоряет получение новых сортов сельскохозяйственных растений совместно с крупнейшими агрохолдингами. Мы делаем это за счет технологий генетического редактирования и автоматизации анализа генотипов и фенотипов.

Своей основной целью мы ставим выведение новых сортов растений, которые будут кратно превосходить имеющиеся в урожайности, питательной ценности (белковости, масличности и т.д.), устойчивости к изменениям климата и патогенам. Одно из направлений работы – анализ генетической информации о сортах, ее связи с фенотипами, составление рекомендательных схем по ведению селекционного процесса и его автоматизации за счет создания собственной платформы.

https://plastilin.team/ 

Обязанности

• Разработка, оптимизация и автоматизация пайплайнов по обработке NGS данных
• Поиск и интеграция новых инструментов для оптимизации работы пайплайнов, добавление новых функций
• Создание и внедрение в анализ моделей предсказания хозяйственно-ценных признаков растений по геномным данным

• Владение Python, R, bash
• Опыт работы с языками для масштабирования пайплайнов (CWL, Nextflow, Snakemake etc.)
• Понимание работы конвейера для анализа NGS данных, опыт работы с биоинформатическими инструментами для анализа геномных данных
• Опыт работы с серверами на базе Linux
• Свободное владение английским языком для чтения научной литературы и технической документации (уровень B2 или выше)

Плюсом будет

• Опыт работы с облачными вычислениями (Yandex Cloud, Selectel, AWS ect.)
• Опыт работы с Docker
• Знание статистики, молекулярной биологии, популяционной генетики
• Опыт проведения GWAS анализа
• Знание SQL

• Гибкий график (30-40 часов в неделю)
• Возможность работать как в офисе в Москве, так и удаленно
• Социальная защищенность - прозрачные условия трудоустройства; трудоустройство по ТК РФ, фиксированная белая зарплата (оклад + бонус)

Преимущества:

• Участие в быстро развивающемся международном стартапе, первого в России сервиса рекомендательных систем для дизайна растений