Биоинформатик для NGS в онкологии

в Атлас
Город Москва, Russian Federation
Опубликовано 01.09.2017
Категория Биоинформатика
Тип вакансии Полная занятость
Частичная занятость
Адрес ул. Малая Никитская 31, м. Баррикадная

Обязанности

Атлас — первая в России клиника персонализированной медицины и биомедицинский холдинг с международными амбициями. Мы проводим генетические тесты и интерпретируем их с помощью суперкомпьютеров IBM Watson и IBM Bluemix.

Мы расширяем онкодиагностику и ищем биоинформатика. Наш идеальный кандидат:

  • умеет обрабатывать NGS,
  • любит кодить,
  • готов анализировать соматические мутации,
  • готов разобраться в биологии биомаркеров и клинической онкологии.

Обязанности:

  • Запуск, оптимизация и проверка уже написанных протоколов анализа NGS
  • Разработка новых программ и скриптов
  • Поиск и обзор новых сторонних программ
  • Мониторинг достижений и трендов в области NGS для онкологии и медгенетики

Требования

  • Образование в области биоинформатики, математики, физики или биологии
  • Знание молекулярной биологии и генетики
  • Знание Python, Perl или Java
  • Знание Linux и Bash
  • Опыт с NGS: bwa/bowtie, samtools, bedtools, вариант коллинг, аннотация
  • Знание основ статистики в биологии
  • Опыт работы с биоинформатическими БД
  • Знание MySQL

Будет плюсом:

  • Знание медицинской онкологии или медицинской генетики
  • Знание машинного обучения
  • Опыт разработки биоинформатического ПО/пайплайнов
  • Знание R, matlab, mathematica
  • Опыт ведения репозитория

Условия

  • Офис в особняке на Малой Никитской, в трех минутах от м. Баррикадная
  • Возможна неполная занятость
  • В команде генетики, биоинформатики, программисты, маркетологи, врачи и другие веселые ребята
  • Неформальное общение с лидерами биомеда на наших вечеринках

Основные статьи сотрудников отдела:

Перетащите файл сюда Выбрать файл ...
Отправляя отклик, я соглашаюсь с политикой обработки персональных данных