Маргарита Л.
начинающий биоинформатик и опытный лаборант
| Последнее обновление резюме | 21.04.2025 |
| Адрес | Москва, Russian Federation |
| Электронная почта | Заблокировано |
| Телефон | Заблокировано |
| Соцсеть или сайт | Заблокировано |
В чем вы сильны?
За время учёбы и работы в лабораториях я освоила различные методы молекулярной биологии и работы с данными: биоинженерные методы (дизайн плазмиды, трансформацию, работу с Cas9, выделение плазмиды, нуклеиновых кислот, белка и др), разные методы молекулярной биологии (аналитичские ПЦР с подбором условий, подбор и валидация праймеров, real-time и мультиплекс ПЦР), блоттинг, разные методы электрофоретического разделения молекул, подготовку ДНК, мРНК и микроРНК библиотек для секвинирования, single-cell and FISH), иммунологические методы, работу с первичными клеточными культурами млекопитающих, бактериальными и дрожжевыми культурами, cell sorting and sample preparation for it, isolation of various organelles on an ultracentrifuge, sample preparation of brain samples for electron microscopy, various molecular methods, статистическую обработку данных на R и Python, работа с серверами, сборка и аннотация геномов. Последний мой проект в лаборатории посвящен изучению профилей экспрессии и регулярной (микроРНК-мРНК) сети, ассоциированных с мутациями и клинико-патологическими особенностями параганглиом головы и шеи. Его я выполняла полностью самостоятельно, включая выделение РНК из FFPE-блоков и подготовку microRNA-библиотек 98 образцов и сейчас доделываю анализ данных, который я делала в основном на языке R c использованием пайплайна miRge, Cutadapt, Bowtie и базы данных miRBase, метода TMM (trimmed mean of M-values) с подсчетом CPM (counts per million) и учетом коэффициентов нормализации с использованием пакета edgeR, mirPath v.3 Diana Tools и базы данных TarBase 7.0 и KEGG, а также метода ConsensusClusterPlus. Также участвовала в написании других обзоров и статей, имею публикации в соавторстве. Сейчас готовлюсь к защите дипломной работы на Кафедре молекулярной биологии МГУ, и также надеюсь на публикацию статьи по итогам моей дипломной работы.
Расскажите о себе что-нибудь еще: публикации, конференции, хобби
Я участвовала с командой от кафедры биоинженерии МГУ в IGEM до его закрытия в России. Дважды участвовала с командой в Международной биологической универсиаде. Принимала участие с постером и тезисами в 3м Студенческом биохимическом форуме и Национальном Конгрессе по регенеративной медицине. Выступала с докладом на XVIII Международной (XXVII Всероссийской) Пироговской научной медицинской конференции. Заняла 3е место в конкурсе Молодых учёных ИМБ РАН в 2023 году. По результатам своей работы в лаборатории Филиппа Хайовича я выступала с тезисами на конференции LIFT Школа молодого нейротехнологами. Планирую добиваться успеха на конференциях и в этом году.
Я закончила программу от Цифровой кафедры «Специалист по анализу данных».В прошлом году для дополнительного изучения биоинформатики я ходила на пары по статистике и работе в R с магистрами кафедры микробиологии МГУ, прошла межфакультетские курсы МГУ по Python и машинному обучению. В прошлом семестре я посещала спецкурсы по эндокринологии, физиологии и анатомии ЦНС и поведению животных и человека на кафедре физиологии сверх своей пограммы.
Список моих публикаций:
Статьи:
- Snezhkina, A.; Fedorova, M.; Kobelyatskaya, A.; Markova, D.; Lantsova, M.; Ikonnikova, A.; Emelyanova, M.; Kalinin, D.; Pudova, E.; Melnikova, N.; et al. The SDHD:p.H102R Variant Is Frequent in Russian Patients with Head and Neck Paragangliomas and Associated with Loss of 11p15.5 Region and Hypermethylation of H19-DMR. Int. J. Mol. Sci. 2023, 24, 628. https://doi.org/10.3390/ijms24010628 2. Pudova, E.A.; Kobelyatskaya, A.A.; Katunina, I.V.; Snezhkina, A.V.; Fedorova, M.S.; Pavlov, V.S.; Bakhtogarimov, I.R.; Lantsova, M.S.; Kokin, S.P.; Nyushko, K.M.; et al. Lymphatic Dissemination in Prostate Cancer: Features of the Transcriptomic Profile and Prognostic Models. Int. J. Mol. Sci. 2023, 24, 2418. https://doi.org/10.3390/ijms24032418
- Fedorova, M., Snezhkina, A., Kalinin, D., Pudova, E., Lantsova, M., Krasnov, G., Pavlov, V., Kudryavtseva, A. Intratumoral Microbiome in Head and Neck Paragangliomas. Int. J. Mol. Sci. 2024, том 25, 9180. https://doi.org/3390/ijms25179180
- BulavkinaV., Kudryavtsev A.A., Goncharova M.A.,Lantsova M.S., Shuvalova A.I., Kovalev M.A., Kudryavtseva A.V. Multifaceted Nothobranchius. Biochemistry Moscow, 2022, том87, №12, с. 1928–1946. https://doi.org/10.1134/S0006297922120136
- Gladysh N.S., Kovalev M.A., Lantsova M.S., Popchenko M.I., Bolsheva N.L., Starkova A.M., Bulavkina E.V., Karpov D.S., Kudryavtsev A.A., Kudryavtseva A.V.Molecular and genetic mechanisms of sex determination in poplar. Molecular Biology, 2024, том 58, № 2, с. 204-219. https://doi.org/31857/S0026898424020021
Тезисы:
- Comparative analisis of the lipid profile of five brain regions of the human and primate brains, LantsovaS.,Osetrova M.S., Efimova O.I., Anikanov N.A., Mitina A.I., Senko D.A., Stekolshchikova E.A., Khrameeva E.E., Khaytovich F.E., LIFT Школа молодого нейротехнолога, Москва, 2024, том 1, с. 77-79, DOI: 10.24412/CL-37228-2024-77-79
- Высокая частота варианта SDHD:p.H102R и гаплотип мутации у российских пациентов с параганглимой головы и шеи, XVIII Международная (XXVII Всероссийская) Пироговская научная медицинская конференция https://pirogovka.rsmu.ru/fileadmin/templates/DOC/Conferences/Pirogovka/Pirogovka_sbornik_2023.pdf
- 2023 Иммунохимические исследования тропонина I в сердечной ткани позвоночных фауны Звенигородской биологической станции с использованием моноклональных антител различной эпитопной специфичности; Васенок Д.С., Владыкина М.В., Киреева Э.И., Климова Я.А., Кондрашев Г.И., Коряко Ф.О., Ланцова М.С., Тетюркина М.А., Носов Г.А., Костюк А.И., Владыченская Е.А., Серебряная Д.В. в сборнике Флора и фауна Западного Подмосковья, 2023, издательство Товарищество науч. изд. КМК (М.), том 14, с. 246-255
