Артем П.

Биоинформатик

На данный момент рассматриваю проектную деятельность и частичную занятость

Последнее обновление резюме 11.03.2026
Адрес Новосибирск, Russian Federation
Электронная почта Заблокировано
Дата рождения 1995/11/24
Телефон 89994672382
Согласие на обработку данных Я подтверждаю, что ознакомлен(а) и даю свое согласие на обработку и передачу моих персональных данных в соответствии с <a href="https://drive.google.com/file/d/12zJUA7g0y1JCem41g5dtUCiwv0H9NbjL/view?usp=sharing">Политикой в области обработки и обеспечения безопасности персональных данных</a> и настоящим <a href="https://drive.google.com/file/d/1JtzC6jo4YwG8lUk2uH3VQQvTGmM9pGQC/view?usp=sharing">Согласием на передачу персональных данных</a>

Опыт

Курчатовский геномный центр
младший нучный сотрудник
Сен 2024 - Текущий
- Провожу сборку и анализ пан-транскриптомов сельскохозяйственных растений
- Разработал программный пайплайн для автоматической сборки пан-транскриптомов и анализа их структуры и составляющих. Есть патент
Всероссийский научно-исследовательский институт защиты растений
младший нучный сотрудник
Сен 2023 - Сен 2025
- Занимался анализом изменения нуклеотидной последовательности вироида картофеля из семейства Pospoviroidae
- Провел de novo сборку транскриптома, обработку и анализ экспрессии контигов и поиск последовательностей вироидов
Новосибирский Государственный Университет (НГУ)
Преподаватель
Сен 2022 - Текущий
Веду курсы:
- Компьютерная транскриптомика
- Введение в информационную биологию
Институт цитологии и генетики СО РАН
младший научный сотрудник
Сен 2021 - Текущий
- Занимался анализом данных генотипирования путем секвенирования (GBS) для сои, пшеницы, кукурузы, ячменя и риса
- Разработал программный пайплайн для автоматической обработки данных. Применял его для обработки GBS, поиска SNP и дальнейшего анализа популяций. Есть патент
- Провел поиск и анализ длинных некодирующих РНК (днРНК) в различных сельскохозяйственных растениях
- Разработал программный пайплайн для автоматического поиска, классификации и аннотации днРНК в различных растениях. Есть патент
- Занимался автоматическим фенотипированием морфологии колоса методами машинного обучения
- Сейчас разрабатываю программу для предсказания типов РНК на основе моделей машинного обучения
Также совмещаю работу в проектах:
- Провел анализ данных GBS для мискантуса
- Сейчас занимаюсь сборкой траснкриптома мискантуса
Институт биологии южных морей
младший научный сотрудник
Сен 2018 - Сен 2019
- Разработка программного пайплайна обработки видеоматериала для изучения движения микроорганизмов
- Работа с Single Cell данными, которая включала в себя предобработку, квантификацию, анализ дифференциальной экспрессии и поиск маркерных генов

Образование


Институт Цитологии и Генетики СО РАН
Сен 2019 - Текущий
Кандидат наук: Математическая биология, биоинформатика (биологические науки)

Севастопольский государственный университет
Сен 2017 - Сен 2019
Физика, Биофизика

В чем вы сильны?

Имею опыт работы в различных направлениях биоинформатики:
- Работа с большими данными
- Расчёты на SLURM-кластере
- Все стадии работы с RNA-seq, RAD-seq, scRNA-seq данными
- Сборка геномов/транскриптомов (WGS, pan-genomics, pan-transcroptomics)
- Поиск и анализ полиморфизмов (GBS, GWAS, SNP, population analisis)
- Разработка программ основанных на методах ML и DL

Python    Английский язык    Linux    Git    Научные исследования    Научная деятельность    Информационные технологии    Написание научных статей    Организация учебного процесса    Big Data    Data Analysis    Конференции    Разработка инструкций    RNA-seq    GWAS    GBS    Транскриптомика    Геномика    Машинное обучение    Deep Learning

Расскажите о себе что-нибудь еще: публикации, конференции, хобби

Подробнее ознакомиться с моими работами можно по ссылкам:
https://scholar.google.com/citations?user=vSjgox8AAAAJ&hl=ru
https://github.com/artempronozin95