Навыки:

- Работа в "мокрой" биологии: выделение ДНК, постановка ПЦР, ГЭФ, экстракция ДНК из геля
- Анализ данных NGS (Illumina, Nanopore, PacBio)
- Язык программирования R
- Язык программирования Python
- Работа в linux
- Знание bash
- Сборка и аннотация генома (бактериального/эукариотического)
- Ручная корректировка аннотации
- Сборка и аннотация метагенома
- Сборка и анализ транскриптома
- Анализ данных 16S рРНК секвенирования
- Анализ диф. экспрессии генов
- Знание английского языка

Закончила бакалавриат и магистратуру на кафедре информационной биологии (биоинформатики) факультета Естественных наук в НГУ. С 2017 года работаю биоинформатиком в лаборатории ИЦиГ. Участвовала в хакатоне по биоиформатике в Санкт-Петербурге в 2018 году.

Список научных публикаций с моим соавторством:
1. AV Zadorozhny; ЕY Pavlova; AА Shipova; TN Goryachkovskaya; SE Peltek. Клонирование и экспрессия гена маннаназы Thermothielavioides terrestris в Komagataella phaffii. Письма в Вавиловский журнал генетики и селекции 8 (2022)
2. DN Smirnov; SV Shekhovtsov; AA Shipova; GR Gazizova; EI Shagimardanova; NA Bulakhova; EN Meshcheryakova; TV Poluboyarova; EE Khrameeva; SE Peltek; DI Berman. De novo assembly and analysis of the transcriptome of the Siberian wood frog Rana amurensis. Vavilovskii Zhurnal Genet Selektsii 26, 109–116 (2022)
3. AV Bryanskaya; AA Shipova; AS Rozanov; OA Kolpakova; EV Lazareva; YE Uvarova; VM Efimov; SM Zhmodik; OP Taran; TN Goryachkovskaya; SE Peltek. Diversity and Metabolism of Microbial Communities in a Hypersaline Lake along a Geochemical Gradient. Biology (Basel) 11, 605 (2022)
IF= 4.2
4. SV Shekhovtsov; AA Shipova; NA Bulakhova; DI Berman. Differentiation within the Drawida ghilarovi complex (Moniligastridae: Annelida) revealed by multigene transcriptomic dataset analysis. Eur J Soil Biol 111, 103411 (2022)
IF= 4.2
5. AV Bryanskaya; AA Shipova; AS Rozanov; OA Volkova; EV Lazareva; YE Uvarova; TN Goryachkovskaya; SE Peltek. Metagenomics dataset used to characterize microbiome in water and sediments of the lake Solenoe (Novosibirsk region, Russia). Data Br 34, 106709 (2021)
6. AV Korzhuk; IN Myagkaya; AS Rozanov; NI Ershov; B ool Y Saryg-ool; VI Malov; MA Gustaytis; AA Shipova; EV Lazareva; SE Peltek. Metagenomics data of microbial communities of natural organic matter from the dispersion train of sulfide tailings. Data Br 35, 106720 (2021)
7. AS Rozanov; IN Myagkaya; AV Korzhuk; NI Ershov; IS Kirichenko; MA Gustaytis; B ool Y Saryg-ool; VI Malov; AA Shipova; EV Lazareva; SE Peltek. Metagenomics data of microbial communities in bacterial mats and bottom sediments in water bodies within the Kurai Mercury Province (Gorny Altai, Russia). Data Br 36, 107099 (2021)
8. AS Rozanov; AV Korzhuk; VN Shlyakhtun; AA Shipova; SE Peltek. Metagenomic data on prokaryotic diversity of Kunashir island geothermal spring. Data Br 32, 106244 (2020)
9. SV Shekhovtsov; AA Shipova; TV Poluboyarova; GV Vasiliev; EV Golovanova; AP Geraskina; NA Bulakhova; T Szederjesi; SE Peltek. Species Delimitation of the Eisenia nordenskioldi Complex (Oligochaeta, Lumbricidae) Using Transcriptomic Data. Front Genet 11, 598196 (2020)
IF=3.7
10. AS Rozanov; AA Shipova; AV Korzhuk; AV Bryanskaya; SE Peltek. Draft Genome Sequence of Halorubrum sp. Strain 48-1-W from a Saline Lake in the Novosibirsk Region, Russia. Microbiol Resour Announc 8 (2019)
11. AS Rozanov; AA Shipova; AV Bryanskaya; SE Peltek. Metagenome-Assembled Genome Sequence of Phormidium sp. Strain SL48-SHIP, Isolated from the Microbial Mat of Salt Lake Number 48 (Novosibirsk Region, Russia). Microbiol Resour Announc 8 (2019)
12. AA Shipova; AV Korzhuk; V Shlyahtun; AV Bryanskaya; AS Rozanov; SE Peltek. Metagenome-Assembled Genome of Halomonas sp. Isolate SL48-SHIP-3 from the Microbial Mat of Salt Lake Number 48 (Novosibirsk Region, Russia). Microbiol Resour Announc 8 (2019)
13. AS Rozanov; AA Shipova; AV Bryanskaya; LA Tekutieva; OM Son; SE Peltek. Draft genome sequence of Bacillus altitudinis strain KL4, isolated from bottom sediments in Lake Krotovaya Lyaga (Novosibirsk Region, Russia). Genome Announc 6 (2018)
14. AS Rozanov; AV Korzhuk; AA Shipova; AV Bryanskaya; SE Peltek. Draft genome sequence of Bacillus altitudinis Strain KU-skv2(2), isolated from a microbial mat on an anthropogenic pipe from Caldera Uzon (Kamchatka, Russia). Genome Announc 6 (2018)

Патенты с моим соавторством:
1. Брянская АВ, Горячковская ТН, Уварова ЮЕ, Бочков ДВ, Шипова АА, Банникова СВ, Пельтек СЕ. Штамм бактерий bacillus licheniformis 47018, обладающий способностью продуцировать термостабильную альфа-амилазу. Патент № 2788850 C1 (2023)
2. Брянская АВ, Уварова ЮЕ, Шляхтун ВН, Слынько НМ, Татарова ЛЕ, Шипова АА, Горячковская ТН, Пельтек СЕ. Штамм бактерий Bacillus megaterium 83_ICG, обладающий способностью продуцировать пробиотические и антимикробные вещества класса органических кислот. Патент № 2557086 (2021)