Эмиль К.
Начинающий биоинформатик с опытом мокрой/сухой биологииЗаинтересован преимущественно в удалённой работе в областях: -биоинформатики
-работы с геномами
-анализа, обработки и визуализации данных на R/Python
-написании обзоров, статей, тезисов, грантов
-выступлении на научно-популярных и научных площадках
| Последнее обновление резюме | 17.01.2021 |
| Адрес | Нижний Новгород, Russian Federation |
| Электронная почта | Заблокировано |
| Телефон | Заблокировано |
| Соцсеть или сайт | Заблокировано |
Опыт
Стажирующийся студент
Стажирующийся студент
Образование
Кандидат
Студент 4 курса специалитета
В чем вы сильны?
- Работа в лаборатории: основные манипуляции, микроскопия (электронная, конфокальная, FLIM), ПЦР (RT), гель-электрофорез, криотомия, микротомия, иммуногистохимия, работа с клеточными культурами.
- Кодинг, статистика и обработка данных, работа с данными: R, Python, ggplot2, plotly, ggpubr, pandas, numpy, обработка seq (DeSeq2, Trinity, PAGODA, Galaxy, Ugene); работа с векторами, In-Silico PCR, анализ прочтений (blast, Ugene), SPCImage, imageJ, Zen, Imaris; Flowjo и др. Работаю в Jupyter Notebook и Rstudio.
- Работа с базами данных и геномными браузерами – Galaxy, NCBI, datasets, pklab, UCSC, EBI, UniProt, String.
- Английский язык - C2.
Расскажите о себе что-нибудь еще: публикации, конференции, хобби
Публикации и конференции:
·Malignant Schwann cell precursors mediate intratumoral plasticity in human neuroblastoma – Nature Genetics (accepted) / biorxiv. doi: 10.1101/2020.05.04.077057 + Abstract in Pediatric Blood & Cancer (SIOP Award Session). doi: 10.1002/pbc.28742
2020
·Label-free sorting of iPS cells during neuronal differentiation using FLIM and multiphoton fluorescence microscopy – Neuronal Imaging and Sensing 2020. doi: 10.1117/12.2544797
2020
·Probing metabolic alteration of differentiating induced pluripotent stem cells using label-free FLIM – Imaging, Manipulation, and Analysis of Biomolecules, Cells, and Tissues XVIII. doi: 10.1117/12.2544821
2020
·Cancer stem cells metabolism studies in HCT116 chemoresistant lines. – Международная конференция Cancer Stem Cells: Impact on Treatment. – Устное выступление.
2020
·Malignant Schwann Cell Precursors Mediate Intratumoral Plasticity in Human Neuroblastoma. - 52 Конгресс Международного Общества Педиатрической Онкологии (SIOP). – Презентация работы на наградной сессии.
2020
·Изучение сценариев эмбриогенеза каротидного тела. – VI Всероссийская конференция молодых учёных с международным участием VolgaMedScience. – Устное выступление, 1 место.
2020
Гранты:
·Разработка метода персонализированой предиктивной оценки эффективности противоопухолевой терапии. – УМНИК №67070 – руководитель.
2020–2022
·Комплексный структурно-функциональный анализ метаболической активности, рН, ультраструктуры цитоскелета и вязкости цитоплазматической мембраны в индуцированных плюрипотентных стволовых клетках человека при направленных дифференцировках. – Грант РНФ 17-75-20178 – исполнитель.
2020-2022
·Клональный состав опухоль-инфильтрирующих Т-лимфоцитов как прогностический и предиктивный маркер при лечении онкологических заболеваний. - Грант Правительства РФ № 14.W03.31.0005 – исполнитель.
2017– 2021
Олимпиады и турниры:
·Федеральный Турнир Трёх Наук – 1 место в личном зачёте, 3 место в командном зачёте на ПФО; 1 место в личном зачёте на федеральном финале.
2020
·Конкурс молодых учёных на международной олимпиаде студентов-медиков «Самарканд 2020» - 1 место.
2020
·Шестая Всероссийская студенческая олимпиада по нормальной физиологии, посвященная памяти академика К.В. Судакова – 2 место.
2019
·Всероссийская олимпиада студентов «Биохимик» – 2 место в личном зачёте, 2 место в командном зачёте.
2019
Другие награды:
·Стипендия Президента РФ.
2020
·Победитель в номинации «Интеллект года» в конкурсе «Студент года-2020».
2020
·Сертификаты “Introduction to Genomic Technologies”, “Statistics for Genomic Data Science”, “Python for Genomic Data Science” от Johns Hopkins University.
2020
·Выступление на международном проекте Science Slam - всероссийском Science Slam Medicine - в качества слэмера, 1 место; на Science Slam в Нижнем Новгороде.
2019-2020
·Сертификаты на Stepik по направлениям биологии, медицины и программирования.
2019-2020
·Стипендия Президента РФ.
2019
·Повышенная Государственная Академическая Стипендия, Стипендия ректората ПИМУ.
С 2018
Внеакадемическая деятельность:
- Лектор и приглашённый спикер научного и научно-популярного формата на различных площадках (Парк Науки ННГУ, Science Slam, Восход, ПРО Human).
- Член Российского Союза Молодёжи. Действующий волонтёр-медик, волонтёр COVID-19.
- Член судейской комиссии Всероссийского Турнира Юных Биологов.
- Действующий член Российского Общества Клинической Онкологии.
- Веду свой литературный блог. Участник конкурсов фотографии.