Максим Г.
биоинформатик, молекулярный биологЯ ищу работу с неполной занятостью, могу работать как над биоинформатическими, так и над биоинженерными проектами.
| Последнее обновление резюме | 29.08.2022 |
| Адрес | Москва, Russian Federation |
| Электронная почта | Заблокировано |
| Телефон | Заблокировано |
| Соцсеть или сайт | Заблокировано |
Опыт
Младший научный сотрудник
Образование
Факультет биоинженерии и биоинформатики
В чем вы сильны?
0) Увлечённость в работе, готовность к изучению новых методов, программ, интерес к биологии. Любовь к анализу данных.
1) Большой опыт работы в молекулярных лабораториях
Хорошо знаком с методами выделения ДНК и РНК. Имею большой опыт постановки ПЦР, подбора оптимальных условий амплификации, интепретации результатов на основании результатов капиллярного электрофореза и электрофореза на агарозном геле. Решал нестандартные задачи, связанные с повышением эффективности ПЦР. Умею очищать ампликоны от примесей при помощи спирта и магнитных частиц.
Есть навыки трансформации бактериальных клеток, вставки ампликонов в вектор, отбора клонов. Знаком с методами подготовки компетентных клеток.
Умею готовить транскриптомные и ампликоновые библиотеки Illumina, а также готовить образцы для секвениования по Сэнгеру.
Помимо этого, умею готовить образцы для цитометрии, интерпретировать получаемые результаты.
Хорошо понимаю химические и биологические принципы всех вышеперечисленных процедур.
2) Опыт работы над биоинформатическими проектами
Большой опыт програмирования на языке Python (в частности, в пакетах Biopython, Sklearn, matplotlib), работы в ОС Linux, на вычислительных кластерах.
Хорошо знаком с языком R и визуализацией данных. Хорошо понимаю филогенетические методы.
Есть опыт работы с транскриптомными данными полиплоидных видов, сборки транскриптомов, оценки качества.
Использую методы картирования для анализа рапределений SNP.
Знаком с методами обработки метагеномных данных.
Имею опыт поиска необходимых данных в открытых базах.
Представляю принципы работы с данными 3D-структуры белков.
3) Умение работать с литературными источниками:
Поиск статей по интересующей теме, критический анализ литературы, написание обзоров на заданные темы
Знание английского, достаточное для беглого чтения литературы и написания статей.
4) Опыт сотрудничества, живое общение и переписка с зарубежными коллегами.
Расскажите о себе что-нибудь еще: публикации, конференции, хобби
Долго и глубоко изучал биологию в школе и институте. В 2014 и 2015 годах становился призёром всероссийской олимпиады школьников по биологии.
Благодаря генетическим исследованиям, а также анализу морфологии при помощи сканирующей микроскопии, мне удалось открыть новый для республики Марий-Эл вид. Результаты описаны в статье "Isoetes lacustris (Isoetaceae)-- новый вид растений для республики Марий Эл".
Дальнейшее изучение вида позволило установить происхождение I. lacustris в результате скрещивания четырёх предковых диплоидных видов. По итогу была опубликована статья Next generation DNA sequencing reveals allopolyploid origin of decaploid Isoetes lacustris (Isoetaceae) в журнале Aquatic Botany (Scimago Q1, первый автор).
Результаты исследования таксономического разнообразия полушников Дальнего Востока я излагал на конференциях ИТИС-Б 2019 ("Генетическое разнообразие Isoetes Северо-Востока Азии"), Гидроботаника 2020 ("Genetic and morphological diversity of Isoetes species of North-East Asia"). Я рассчитываю опубликовать материалы в течение 2022 года.
В 2021 году защитил курсовую по теме "Исследование структуры генома полиплоидов I. lacustris, I. maritima и I. sinensis по результатам de-novo сборки транскриптомов".
Победитель премии выпускников Alumni prize 2021 года.
Я очень люблю историю, часто путешествую ради чувства исторической значимости места. Голубая мечта -- побывать на остатках империи Инков и посетить весь Китай от Шанхая до Лхасы.
Люблю географию, могу часами рассматривать карты. Живо представляю многие места нашей планеты, их относительное расположение.
Знаю всех птиц Европейской России, многократно организовывал зимние экспедиции для их учётов пернатых в Башкирии, Карелии, Поволжье.
Хорошо знаю растения нашей полосы. Вообще, я очень много знаю о лесах, болотах и полях и иногда ухожу из города отдохнуть на выходных. Очень нежно и трепетно люблю родную природу.
