Анна Ч.

Биолог-аналитик, аннотатор, куратор

Здравствуйте! Интересует позиция биолога-аналитика, куратора, аннотатора, желательно удаленно. Кандидат биологических наук (онкология - иммунология), закончила МГУ им. Ломоносова, работала в США и Франции (postdoctoral fellow), в последнее время работаю аннотатором, куратором, биологом-аналитиком (Thomson Reuters, RanchoBiosciences). Опыт курирования транскриптомных, протеомных и геномных исследований, молекулярных  взаимодействий, анализа литературных данных в области молекулярной генетики, связи генотипа с фенотипом, аннотирования генных вариантов. Работа с базами данных PubMed, EntrezGene, GEO, SNPdb, ClinVar, dbVar, SNPedia, HUGO, BLAST, SwissProt, Uniprot, KEGG, онтологиями MeSH, OMIM, SNOMED CT и т.д., COSMIC, Mutalyzer, COREMINE Medical, STRING, THPA, GGClient.

Заранее спасибо,

С уважением, Анна

Последнее обновление резюме 30.01.2016
Адрес Королев, Russian Federation
Электронная почта Заблокировано
Телефон Заблокировано

Опыт

RanchoBiosciences
Сurator, biologist – analyst
Июн 2014 - Текущий
Analysis of scientific data in biology and medicine. Curation of transcriptomic, proteomic, genomic studies, molecular interactions, analysis of genotype-phenotype associations, analysis of gene polymorphisms, gene variants association with diseases and phenotypic traits, gene variant annotation. Work with databases and public resourses: PubMed, EntrezGene, GEO, SNPdb, ClinVar, dbVar, SNPedia, HUGO, BLAST, SwissProt, Uniprot, KEGG, ontologies MeSH, OMIM, SNOMED CT etc., COSMIC, Mutalyzer, COREMINE Medical, STRING, THPA
Thomson Reuters
Biologist – analyst, annotator
Май 2011 - Ноя 2015
Curation of transcriptomic, proteomic, genomic studies, molecular interactions. Databases: PubMed, EntrezGene, BLAST, SwissProt, Uniprot, KEGG, GGClient.
Russian Academy of Sciences, Institute of Gene Biology, Laboratory of Gene Therapy
Scientific Researcher
Сен 2005 - Янв 2012
Institute Curie, Paris, France
Post Doctoral Fellow
Апр 2003 - Янв 2005

Образование

Russian Academy of Medical Sciences, Institute of Carcinogenesis, Cancer Research Center
Post- Graduate Student
Июн 1993 - Июл 1997
PhD Oncology-Immunology
Moscow State University
Faculty of Biology
Сен 1988 - Июл 1993
Dipl. with honor

Расскажите о себе что-нибудь еще: публикации, конференции, хобби

PUBLICATIONS

1.Kronin VV, Anosova NG, Brondz BD, Chernysheva AD, Krivoshein YS, Popov IA

Mikrobiol Z 1993; 55(5):51-5. Induction of alloantigen-specific cytotoxic and suppressor activities of lymphocytes by intravenous immunization of mice when donor and recipient differ in class II MHC molecule.

 

2.Anosova NG, Kronin VV, Chernysheva AD, Brondz BD, Krivoshein YS, Popov IA

Biol Mem 1994; 7:435-42. A comparative investigation of the cross-reactivity of T-lymphocytes with cytotoxic and suppressive activities specific of the epitopes of membrane histocompatibility class II molecules.

 

3.Brondz BD, Kazanskii DB, Chernysheva AD, Ivanov VS, Ostrovskii AG, Erokhin VP

Mol Biol (Mosk) 1994; 28(5):1113-20. [Use of peptides of major histocompatibility type I molecules for induction of specific T-suppressors in vivo in an allogenic system and extending the life of a murine skin transplant].

 

4.Kazanskii DB, Agranovich IM, Shtil' AA, Azhipa OIa, Chernysheva AD, Apasov SG, Brondz BD

Mol Biol (Mosk) 1995; 29(1):168-79. [Isolation, study of activity, and characteristics of an immunosuppressive liver factor causing apoptosis of EL-4 thymoma cells in vitro].

 

5.Brondz BD, Kazanskii DB, Chernysheva AD, Ivanov VS, Ostrovskii AG, Erokhin VP

Vestn Ross Akad Med Nauk 1995; 4: 38-42. [Use of histocompatibility class I molecule peptides for in vivo induction of specific T-suppressors in allogenic systems and prolongation of mouse skin graft life].

 

6.Kazansky DB, Agranovich IM, Azhipa OY, Shtil AA, Anosova NG, Chernyshova AD, Brondz BD

Immunol Lett 1995; 45(1-2):5-11. Immunosuppressive factor from liver induces apoptosis in thymoma EL-4 cells but not normal MHC class II-specific T lymphocytes.

 

7.Brondz BD, Kazansky DB, Chernyshova AD, Ivanov VS

Immunology 1995; 86(2):219-23. Peptides of a major histocompatibility complex class I (Kb) molecule cause prolongation of skin graft survival and induce specific down-regulatory T cells demonstrable in the mixed lymphocyte reaction.

 

8.Brondz BD, Kazanskii DB, Chernysheva AD, Pavlova TN, Ivanov VS

Mol Biol (Mosk) 1996; 30(1):156-62. [Differences in recognition of peptides of the MHC H-2Kb molecule between cytotoxic T-lymphocytes, memory cells, and T-suppressor cells, specific for alloantigen H-2Kb].

 

9.Kazansky DB, Chernyshova AD, Agranovich IM, Shtil AA, Anosova NG, Azhipa OY, Brondz BD

Eur Cytokine Netw 1996; 7(3):588. Immunosuppressive factor from liver: implication in peripheral selection of T-cells.

 

10.Chernysheva AD, Brondz BD, Anosova NG, Boiko RZ, Aizenberg LV, and Kazanskii DB

Mol Biol (Mosk) 1996; 30(3):721-8. [Functional characteristics of liver T-lymphocytes in the allogenic response to mutant MHC class I and II molecules].

 

11.Kazanskii DB, Chernysheva AD, Sernova NV, Petrishchev VN, Pobezinskii LA, Agafonova EL, Chervonskii AV

Mol Biol (Mosk) 1998; 32(4):692-702. [The nature of epitopes, recognized by T-lymphocytes in the allogenic immune response].

 

12.Kazanskii DB, Chernysheva AD, Sernova NV, Abronina IF, Anosova NG, Rodin DV, Pobezinskii LA, Agafonova EL

Mol Biol (Mosk) 1998; 32(6):1036-43. [Functional properties of hepatic T-lymphocytes from mice immunized with an alloantigen in vivo].

 

13.Kazanskii DB, Petrishchev VN, Shtil' AA, Chernysheva AD, Sernova NV, Abronina IF, Pobezinskii LA, Agafonova EL

Bioorg Khim 1999; 25(2):117-28. [Use of heat shock of antigen-presenting cells for functional testing of allospecificity memory T-cells].

 

  1. Anna D. Chernysheva, Kyriakos A. Kirou, and Mary K. Crow. J Immunol 2002 169: 1241-1250 [T Cell Proliferation Induced by Autologous Non-T Cells Is a Response to Apoptotic Cells Processed by Dendritic Cells].

   15. Joncker NT, Marloie MA, Chernysheva A, Lonchay C, Cuff S, Klijanienko J, Sigal-Zafrani B, Vincent- Salomon A, Sastre X, Lantz O. Int J Cancer. 2006 Mar 1;118(5):1205-14 [Antigen-independent accumulation of activated effector/memory T lymphocytes into human and murine tumors].

  1. Бережной А.Е., Закеева И.Р., Кибардин А.В., Чернышева А.Д., Моисеенко В.М., Данилов А.О., Демидов Л.В., Барышников А.Ю., Гнучев Н.В., Георгиев Г.П., Ларин С.С. (2006) Анализ экспрессии молекул HLA-E в клетках меланомы человека. Российский Биотерапевтический Журнал, 2006; 5(3): 66-71

17. Бережной А.Е., Чернышева А.Д., Закеева И.Р., Данилова А.Б., Данилов А.О., Моисеенко В.М., Geraghty D., Гнучев Н.В., Георгиев Г.П., Кибардин А.В., Ларин C.C. (2009) Индукция экспрессии молекулы HLA-E на поверхности опухолевых клеток интерфероном-гамма приводит к защите опухолевых клеток от цитотоксического действия лимфоцитов. Вопросы онкологии. 55: 224-229.