Евгения Б.

Биоинформатик

Ищу работу на полный день, желательно в коммерческой сфере. Рассматриваю переезд в другой город. 




Последнее обновление резюме 19.04.2018
Адрес Kazan, Russian Federation
Электронная почта Заблокировано
Соцсеть или сайт Заблокировано

Опыт

Казанский (Приволжский) федеральный университет, OpenLab "Омиксные технологии"
Младший научный сотрудник
Апр 2014 - Текущий
Анализ данных секвенирования следующего поколения. Разработка и чтение курса "Биоинформатика" студентам факультета информатики.
Казанский (Приволжский) федеральный университет, кафедра генетики
Инженер
Сен 2012 - Мар 2014
Разработка и чтение курса "Дополнительные главы математики" студентам-биологам.
Казанский (Приволжский) федеральный университет, Центр им. Бодуэна де Куртенэ
Младший научный сотрудник
Сен 2010 - Авг 2013
В Центре мной были освоены методы оценки корреляций между генетическим, лингвистическим и географическим компонентами этнического разнообразия европейских народов на основе маркеров Y-хромосомы и мтДНК.

Образование

Казанский (Приволжский) федеральный университет
Генетик-специалист
Сен 2006 - Июн 2011
Исследовательская работа посвящена оценке генетического и лингвистического разнообразия этносов Российской Федерации.

В чем вы сильны?

Технические навыки: уверенные знания в области молекулярной биологии и биологических баз данных. Опыт программирования: bash, R, python (базовые навыки). Анализ омиксных данных: контроль качества данных NGS, shotgun и 16S метагеномика (MetaPhlAn, ChocoPhlAn, QIIME, mothur), RNA-seq, microarrays (TopHat, cufflinks), сборка и аннотация геномов прокариот (mira, newbler, SPAdes, prokka), поиск вариантов в геномах человека (samtools, GATK, annovar), анализ GWAS (plink). Графические редакторы: GIMP, Inkscape.

Знание языков: русский язык (родной), английский язык (чтение профессиональной литературы), немецкий язык (начальный уровень).




Расскажите о себе что-нибудь еще: публикации, конференции, хобби

Основные направления работы:

Генетическое разнообразие этносов России. Целью исследования является установление профилей генетической вариабельности, характерных для различных народов Российской Федерации, на основе частот аллелей и генотипов клинически значимых генов (фенотипические профили: онкологический, кардиологический, фармакогенетический, нутригенетический, спортивный). Частоты аллелей и генотипов устанавливаются на основе данных высокопроизводительного полноэкзомного секвенирования ДНК представителей более 10 народов РФ.

Функциональный и таксономический анализ микробных сообществ. Исследованы особенности состава метагеномов различных природных и антропогенных сообществ (в том числе микробиота кишечника человека), полученных методами таргетного и шотган-секвенирования.

Публикации в профиле LinkedIn: https://www.linkedin.com/in/eugenia-boulygina-969ab859