Ксения К.

молекулярный биолог

Ищу позицию аспиранта либо научного сотрудника с возможностью соискательства на кандидатскую ученую степень в области молекулярной биологии / биотехнологии.

Последнее обновление резюме 15.05.2025
Адрес Одинцово, Russian Federation
Электронная почта Заблокировано
Телефон Заблокировано

Опыт

ООО "Научно-производственное объединение ТН-Биотех"
Научный сотрудник
Авг 2024 - Апр 2025
- разработка протоколов выделения и очистки ДНК из различных образцов (объектов окружающей среды; культур бактерий, грибов; крови человека);
- постановка PCR, real-time PCR; полногеномной амплификации (WGA);
- подготовка библиотек ДНК для платформы Oxford Nanopore Technologies, эксплуатация секвенатора MinION в потоковом режиме;
- подготовка библиотек ДНК для платформы Genolab M (GeneMind), эксплуатация секвенатора Genolab M в потоковом режиме;
- анализ результатов секвенирования (интерпретация данных);
- написание СОП, отчетов о НИР, НИОКР;
- работа с базами данных;
- работа с информационно-аналитическими системами научного цитирования,

- обучение и организация работы младшего персонала;
- формирование технических заданий на приобретение оборудования, пластика, реагентов для проведения молекулярных исследований, приемка и оценка соответствия комплектации и показателям качества;
- участие в проведении собеседований кандидатов на вакантные должности;
- ведение учета информационных и материальных потоков.
НИИ Аджиномото-Генетика
Инженер-исследователь
Апр 2024 - Авг 2024
- получение штаммов-продуцентов целевых соединений на основе клеток Pantoe ananatis.
- методы "мокрой" биологии: PCR, выделение ДНК, постановка молекулярного клонирования (Red-зависимая рекомбинация фага лямбда);
- работа с бактериальными штаммами;
- написание отчетов
ФГБУ НМИЦ онкологии им. Н.Н. Блохина Минздрава России
Младший научный сотрудник
Окт 2018 - Мар 2024
- методы "мокрой" биологии: PCR, цифровая капельная PCR, подготовка библиотек ДНК для таргетного секвенирования (клинический экзом; NextSeq 550);
- ИФА, SDS-PAGE, вестерн-блот;
- подбор условий наработки и выделения рекомбинантного белка (ПО Design-Expert);
- выделение и очистка рекомбинантного белка (аффинная хроматография, гель-фильтрация);
- написание СОП, отчетов о НИР, НИОКР, научных публикаций (https://istina.msu.ru/profile/KonoplinaKM/);
- аннотация вариантов по результатам секвенирования на NextSeq 550 (vcf-файлы, ПО OpenCravat)

Образование

Российский технологический университет МИРЭА (ранее – Московский технологический университет)
Магистратура по направлению «Биотехнология», Институт тонких химических технологий им. М. В. Ломоносова
Сен 2016 - Июл 2018
Тема выпускной работы:
Оптимизация условий продукции рекомбинантного белка в клетках эукариот (CHO и High Five)
- планирование экспериментов по оптимизации продукции целевого белка
- проведение экспериментов
- обработка результатов

В чем вы сильны?

Выделение ДНК

Методы: коммерческие наборы; разработка протоколов для различных образцов.

Материал: опухолевая ткань, ткани животных, кровь, бактериальные культуры, культуры грибов, метагеномные образцы объектов окружающей среды.

 

ПЦР: классическая PCR, real-time PCR, цифровая капельная PCR (BioRad), полногеномная амплификация.

 

Методы работы с белками: наработка белка, хроматографическая очистка (Akta Avant; аффинная хроматография, гель-фильтрация); ИФА, вестерн-блот.

 

Секвенирование

Подготовка библиотек для таргетного секвенирования (панель зондов Agilent), полно- и метагеномного секвенирования, 16S-секвенирования; эксплуатация в потоковом режиме секвенаторов: NextSeq 550 (Illumina), Genolab M (GeneMind), MinION (Oxford Nanopore Technologies).

Анализ результатов секвенирования: аннотация vcf-файлов таргетного секвенирования опухолевых клеточных линий (ПО OpenCravat).

 

Работа с клеточными культурами

Прокариоты, культуры клеток млекопитающих.

Культивирование, трансформация (электропорация, трансфекция) клеток.

Агробактериальная трансформация растительных тканей.

 

Прочее

Оптимизация условий наработки и выделения белка методом статистического планирования эксперимента (ПО Design-Expert).

Написание СОП, отчетов, научных публикаций.

Обучение, организация и контроль работы младшего персонала.

 

Английский язык C1

Французский язык A2

Расскажите о себе что-нибудь еще: публикации, конференции, хобби

Статьи

  1. Коноплина К. М., Мальченкова, А. А., Калинина, Н. А., Пинюгина, М. В., Кособокова, Е. Н., Косоруков, В. С. Определение циркулирующей опухолевой ДНК сингенной модели меланомы B16-F10 в плазме мышей линии С57BL6 // Российский биотерапевтический журнал. – 2024. – Т. 23. – № 1. – С. 19-27.
  2. Kosobokova E. N., Kalinina N. A., Konoplina K. M., Malchenkova A. A., Evdokimova A. E., Piniugina M. V., Khan I. I., Kislyak I. A., Basharina A. A., Grishanina A. N., Rudakova A. A., Varaksa P. O., Baryshnikova M. A., Pokrovsky V. S., Bogush T. A., Kosorukov V. S. Human Metastatic Melanoma Cell Lines Panel for in vitro and in vivo Investigations // Journal of Molecular Pathology. – 2024. – Vol. 5, No. 1. – P. 11-27.
  3. Коноплина К. М., Кособокова Е. Н., Косоруков В. С. Актуальные подходы к оценке биологической активности иммуноцитокинов в условиях in vitro // Российский биотерапевтический журнал. – 2022. – Т. 21. – № 3. – С. 10-22.
  4. Konoplina, K. M., Kosobokova, E. N., Sheshukova, E. V., Pinyugina, M. V., Malchenkova, A. A., Kosorukov, V. S. Optimization of Agrobacterium-Mediated Transient Expression of Immunocytokine Based on Human Interferon-α-2b and Anti-HER2 Antibody in Nicotiana Benthamiana // Moscow University Chemistry Bulletin. – 2020. – Vol. 75, No. 5. – P. 280-285.
  5. Кособокова, Е. Н., Шешукова, Е. В., Пинюгина, М. В., Коноплина, К. М., Косоруков, В. С. Разработка технологии получения слитного белка на основе моноклонального гуманизированного антитела против опухолевого антигена HER2 и интерферона-а-2b человека из Nicotiana benthamiana // Биотехнология. – 2019. – Т. 35. – № 2. – С. 49-57.

 

Конференции

  1. Коноплина К. М. Модель обнаружения циркулирующей опухолевой ДНК в плазме мышей линии С57Bl6 как сингенной модели меланомы B16F10 / К. М. Коноплина, А. А. Мальченкова, Н. А. Калинина, М. В. Пинюгина, Е. Н. Кособокова // Сб. тр. XI Междунар. науч.-практ. конф. «Молекулярная диагностика 2023», Москва, 14-16 ноября 2023 г. – М.: АО "Сайенс Медиа Проджектс". – С. 56-57.
  2. Коноплина К. М. Изучение влияния состава раствора для агроинфильтрации на уровень Agrobacterium-опосредованной транзиторной экспрессии иммуноцитокина / К. М. Коноплина, Е. Н. Кособокова, А. А. Мальченкова, В. С. Косоруков // Молекулярная генетика, микробиология и вирусология. – 2021. – Т. 39. - № 1-2. – С. 32-32.
  3. Мальченкова А. А. Поиск оптимальных условий для наработки интерферона-альфа2b человека в растениях Nicotiana benthamiana / А. А. Мальченкова, К. М. Коноплина // Фундаментальная наука и клиническая медицина: материалы научной конференции, Санкт-Петербург, 24 апреля 2021 года. Том XXIV. – С-Пб.: ООО «Издательский дом «Сциентиа», 2021. – С. 731-732.
  4. Коноплина К.М. Оптимизация условий продукции рекомбинантного белка в клетках СНО / К. М. Коноплина, И. П. Чемоданова, Л. В. Верховская, И. Л. Тутыхина, Н. С. Шастина, М. М. Шмаров // Биотехнология в растениеводстве, животноводстве и ветеринарии: Сборник тезисов XVIII Всероссийской конференции молодых ученых, посвященной памяти академика РАСХН Георгия Сергеевича Муромцева, Москва, 19-20 апреля 2018 г. – М.: ФГБНУ «Всероссийский научно-исследовательский институт сельскохозяйственной биотехнологии», 2018. – С. 248-250.

 

Профиль в google.scholar:

   https://scholar.google.ru/citations?user=Ii_7N2IAAAAJ&hl=ru

Уникальный идентификатор в Web of Science (Researcher ID):

   https://www.webofscience.com/wos/author/record/ABI-7475-2020

Уникальный идентификатор в Scopus (Author ID):

   http://www.scopus.com/authid/detail.url?authorId=57209615218

Уникальный идентификатор в Elibrary (Author ID):

   http://elibrary.ru/author_items.asp?authorid=1079272

Уникальный идентификатор в ORCID (ORCID ID):

   https://orcid.org/0000-0003-0130-2628