Полина Б.

Клинический биоинформатик, интерпретатор данных NGS

Ищу удаленную работу

Последнее обновление резюме 23.01.2024
Адрес Белград, Serbia
Электронная почта Заблокировано
Телефон Заблокировано
Соцсеть или сайт Заблокировано

Опыт

Институт биоинформатики
Преподаватель курса по клинической интерпретации данных NGS
Ноя 2023 - Дек 2023
Разработала и преподавала курс повышения квалификации для врачей и биологов по клинической интерпретации данных NGS.
Digital Genomics
Интерпретатор данных NGS
Апр 2022 - Текущий
С помощью анализа данных NGS, помогаю выявить причины наследственных заболеваний. Использую базы данных gnomAD, ClinVar, Decipher, OMIM и другие, чтобы анализировать генетические данные в соответствии с критериями ASMG и модификациями ClinGen. Каждую неделю я помогаю поставить диагноз 10-15 пациентам. Также пишу аналитические отчеты по результатам проведенного анализа, чтобы врачи-генетики и молекулярные биологи могли принимать информированные решения на основе моих выводов.
НИИ медицинской генетики (Томск)
Врач-ординатор лабораторной генетики
Сен 2020 - Июн 2022
Работала в лаборатории геномики орфанных болезней. Выделяла ДНК из венозной крови и оценивала качество ДНК для последующего NGS-анализа. Была ответственна за подготовку ДНК-библиотек для секвенирования панелей генов. Участвовала в интерпретации результатов и помощи в постановке диагноза пациентам с наследственными заболеваниями.
НИИ медицинской генетики (Томск)
Лаборант-исследователь
Апр 2019 - Июн 2020
Работала в лаборатории популяционной генетики. Анализировала данные экзомного секвенирования и находила соматические вариации (SNV, CNV) в атеросклеротических бляшках. Для этого я использовала лучшие практики GATK и готовила подходящий пайплайн. Кроме того, я применяла свои знания в командной строке и языке R для улучшения анализа данных. Одним из результатов работы стала публикация.

Образование

Институт биоинформатики
Программа переподготовки по биоинформатике для биологов
Сен 2022 - Апр 2023
Томский национальный исследовательский медицинский центр
Ординатура по направлению Лабораторная генетика
Сен 2020 - Июн 2022
Сибирский государственный медицинский университет
Медико-биологический факультет, медицинская биохимия
Сен 2014 - Июл 2020

В чем вы сильны?

Я специалист в области биохимии и генетики человека. У меня есть опыт работы как в научной лаборатории, так и в биотехнологической компании. Я знаю, как выделить чистую ДНК, принципы всех технологий секвенирования и отличаю FASTA от FASTQ. Закончила программу Института Биоинформатики, где в выпускном проекте устанавливала связь фенотипа и генотипа у мышей и человека по терминам HPO. Интересуюсь геномной биоинформатикой и орфанными заболеваниями. Разработала и преподаю в Институте биоинформатики курс по клинической интерпретации данных NGS.

Расскажите о себе что-нибудь еще: публикации, конференции, хобби

Публикации:

  • Alexei A. Sleptcov, Alexei A. Zarubin, Polina M. Bogaychuk, Mikhail S. Kuznetsov, Boris N. Kozlov, Maria S. Nazarenko,
    Human exome sequence data in support of somatic mosaicism in carotid atherosclerosis / Data in Brief. 2021 https://doi.org/10.1016/j.dib.2021.107656