Мария С.
ГенетикПостоянная работа с полной занятостью в области популяционной/эволюционной/молекулярной генетики
Последнее обновление резюме | 27.12.2022 |
Адрес | Москва, Russian Federation |
Электронная почта | Заблокировано |
Телефон | Заблокировано |
Опыт
Лаборант-исследователь
Младший научный сотрудник
Младший научный сотрудник
Образование
Московская государственная академия ветеринарной медицины и биотехнологии им. К.И. Скрябина
В чем вы сильны?
Работа с оборудованием генетической лаборатории: (автоматическая станция выделения нуклеиновых кислот, амплификатор, генетический анализатор). Работа с биологическим материалом: выделение нуклеиновых кислот с использованием готовых коммерческих наборов вручную и с помощью роботизированной станции выделения НК, постановка полимеразной цепной реакции, электрофорез. Методы генетического анализа: фрагментный анализ ПЦР-продуктов (STR), анализ длин рестрикционнных фрагментов (RFLP), капиллярный электрофорез.
Биоинформатический анализ данных ДНК-типирования: расчет основных популяционных характеристик, кластерный анализ, анализ молекулярной дисперсии (AMOVA). Филогенетический анализ. Анализ данных полиморфизма SNP-маркеров: полногеномные ассоциативные исследования (GWAS), поиск функциональных генов, ответственных за проявление количественных признаков.
Математическое моделирование: корреляционный, регрессионный, дисперсионный анализ, анализ главных компонент, разработка линейных моделей, метод наилучшего линейного несмещенного прогноза (BLUP), оценка генетических тенденций.
Владение R: хорошее знание синтаксиса и базовых алгоритмов. Выполнение большинства задач статистической обработки данных, получения популяционно-генетических характеристик, моделирования генетических процессов, визуализации результатов. Написание несложных скриптов для профессиональных нужд (в основном для подготовки данных к анализу).
Написание научных статей: работа с мировой научной литературой, формулирование цели и задач исследования, обобщение выводов.
Владение английским языком на уровне Independent user (B1): свободное чтение, анализ и перевод профессиональной литературы, написание статей, официальная переписка на английском языке.
Расскажите о себе что-нибудь еще: публикации, конференции, хобби
Соискатель ученой степени кандидата биологических наук по специальности "Генетика" ФГБНУ ИОГен РАН.
Ответственный исполнитель темы государственного задания №АААА-А19-119052190018-3 по направлению "Изучение генетической и геномной компонент изменчивости многоплодия у овец романовской породы на основе BLUP-процедуры и GWA-анализа" в 2020-2021 гг.
Основной исполнитель проекта РНФ № 21-76-10038 Тема: «Изучение генетической структуры и идентификация генов, участвующих в процессах регуляции фенотипического проявления мясных, откормочных и воспроизводительных качеств закрытой популяции свиней материнских пород». Сроки выполнения проекта – 2021 – 2022 гг.
Список публикаций:
Kabanov, A.; Melnikova, E.; Nikitin, S.; Somova, M.; Fomenko, O.; Volkova, V.; Kostyunina, O.; Karpushkina, T.; Martynova, E.; Trebunskikh, E. Weighted Single-Step Genomic Best Linear Unbiased Prediction Method Application for Assessing Pigs on Meat Productivity and Reproduction Traits. Animals 2022, 12(13), 1693. https://doi.org/10.3390/ani12131693
Сомова М.М., Мельникова Е.Е., Филимонов П.А., Каштанов С.Н. Генетические тенденции размеров тела и репродуктивных качеств в популяции серебристого соболя (Martes zibellina). Ветеринария, зоотехния и биотехнология, 2022, №4.
Melnikova, E.; Kabanov, A.; Nikitin, S.; Somova, M.; Kharitonov, S.; Otradnov, P.; Kostyunina, O.; Karpushkina, T.; Martynova, E.; Sermyagin, A.; Zinovieva, N. Application of Genomic Data for Reliability Improvement of Pig Breeding Value Estimates. Animals 2021, 11, 1557. https://doi.org/10.3390/ani11061557
С. Н. Каштанов, М. В. Шитова, М. М. Сомова, П. А. Филимонов, О. Ю. Тютеньков, А. А. Ходырева, Г. Р. Свищева, И. Г. Мещерский, Ю. А. Столповский, В. В. Рожнов Идентификация популяций соболя (Мartes Zibellina L.) южной части ареала вида. Генетика. 2021. Т. 57. № 10. С. 1–11.
Сомова М.М., Мельникова Е.Е., Никитин С.А. Взаимосвязь показателей воспроизводства овцематок и скорости развития молодняка у овец романовской породы. Зоотехния. 2020. №8. С. 12-16
Сомова М.М., Харзинова В.Р., Сермягин А.А., Костюнина О.В., Мельникова Е.Е., Шеламова Н.Н., Алдобаев А.М., Зиновьева Н.А. Обоснованность сохранения ливенской породы свиней с точки зрения уникальности генофонда современной популяции. Зоотехния. 2019. № 10. С. 10-15.
Каштанов С.Н., Столповский Ю.А., Мещерский И.Г., Свищева Г.Р., Вепрев С.Г., Сомова М.М., Шитова М.В., Мещерский С.И., Рожнов В.В. Таксономический статус и генетическая идентификация соболя Алтая (Martes Zibellina averini Bazhanov, 1943). Генетика. 2018. Т. 54. № 11. С. 1327-1337.
Каштанов С.Н., Сомова М.М., Николаева Э.А. Особенности формирования генетической структуры соболя (martes zibellina l.) в доместицированной среде Кролиководство и звероводство. 2018. № 3. С. 11-14.