Синтез олигонуклеотидных праймеров и гидролизуемых зондов

Создание рекомбинантных ДНК

Трансформация лабораторных штаммов, создание экспрессионных штаммов

Трансфекция и поддержание клеточных линий млекопитающих (человек, мыши)

Выделение РНК, ДНК, электрофорез в агарозном геле и ПААГ

Выделение органелл

ПЦР (включая ПЦР в реальном времени и цифровую капельную ПЦР)

Секвенирование (капиллярное, NGS)

Блоттинг (вестерн, нозерн, саузерн)

Иммутоцитохимический анализ

Сортинг единичных клеток и проточная цитометрия

Выделение и анализ белков (хроматография, масс-спектрометрия)

Программирование в R

СТИПЕНДИИ И ГРАНТЫ (руководитель)

• Конкурс 2017 года «Проведение исследований научными группами под руководством молодых ученых» Президентской программы исследовательских проектов (РНФ), реализуемых ведущими учеными, в том числе молодыми учеными; проект «Молекулярно-генетические технологии направленного редактирования митохондриальной ДНК человека» (2017-2020)
• Конкурсный отбор научных проектов, выполняемых научными коллективами исследовательских центров и (или) научных лабораторий образовательных организаций высшего образования (Государственное задание); проект "Функциональная оценка модифицированной митохондриальной ДНК, не подверженной формированию делеций" (2017-2019)
• Российский фонд фундаментальных исследований; проект «Манипуляция уровнем гетероплазмии митохондриальных ДНК в клетках человека, используя систему CRISPR/Cas9» (2015-2016)
• Программа "Исследования и разработки по приоритетным направлениям развития научно-технологического комплекса России на 2014-2020 годы"; проект «Разработка метода генной терапии наследственной оптической нейропатии Лебера» (2014-2016)
• Программа "Исследования и разработки по приоритетным направлениям развития научно-технологического комплекса России на 2014-2020 годы"; проект «Разработка тест-системы на основе технологии секвенирования следующего поколения для молекулярной диагностики митохондриальных патологий» (2014-2015)
• Программа "Исследования и разработки по приоритетным направлениям развития научно-технологического комплекса России на 2007-2013 годы"; проект «Разработка методики анализа единичных клеток прокариот в проточных микрореакторах для исследования токсичности и антимикробного действия химических соединений» (2013)
• Программа "Научные и научно-педагогические кадры инновационной России" на 2009 - 2013 годы; проект «Изучение изменчивости митохондриальных ДНК адипоцитов при метаболическом синдроме» (2012-2013)
• Программа "Научные и научно-педагогические кадры инновационной России" на 2009 - 2013 годы; проект «Роль стероидных гормонов в дифференцировке Т-клеток памяти: молекулярно-генетический и иммуно-морфологический аспекты» (2012-2013)
• Программа Президиума РАН «Фундаментальные науки – медицине» на 2011 год; проект «Развитие современных методов диагностики наследственных митохондриальный оптических нейропатий в России» (2011)
• Диплом III степени конкурса научно-популярных статей молодых исследователей за статью «Митохондрии: жизнь в клетке и её последствия», при поддержке Президиума Сибирского Отделения Российской Академии Наук (2010)
• FEBS Youth Travel Award for participation in FEBS Advanced Lecture Series “Mitochondria in life, death and disease”, Aussois, France (2009)
• Грант мэрии г. Новосибирска молодым ученым «Разработка новых методов молекулярной диагностики редких наследственных заболеваний органов зрения» (2008-2009)
• Именная стипендия для аспирантов от администрации Новосибирской области (2007-2008)

ИССЛЕДОВАТЕЛЬСКИЙ ОПЫТ

• Ведущий научный сотрудник, Центр геномных исследований, Институт живых систем, БФУ им. И. Канта, Калининград (январь 2019 — настоящее время)
• Заведующий лабораторией молекулярно-генетических технологий, БФУ им. И. Канта, Калининград (Май 2012 — Декабрь 2018)
• Научный сотрудник, Уральский научно–практический центр радиационной медицины, Челябинск (Февраль 2011 – Ноябрь 2011)
• Младший научный сотрудник, Институт химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН, Новосибирск (Сентябрь 2009 – Январь 2011)
• Лаборант, Институт цитологии и генетики СО РАН (Сентябрь 2006 — Август 2009)

ПРЕПОДАВАТЕЛЬСКИЙ ОПЫТ

Балтийский федеральный университет имени Иммануила Канта, Калининград, Россия

Доцент Института живых систем

(Сентябрь 2016 – Май 2017)

Доцент кафедры молекулярной физиологии и биофизики Химико-биологического института (Сентябрь 2014 – Август 2016)

Доцент кафедры терапии и кафедры фундаментальной медицины Медицинского института (Февраль 2013 – Июнь 2014)

Челябинский государственный университет, Челябинск, Россия

Старший преподаватель кафедры радиационной биологии биологического факультета (Сентябрь 2011 – Июль 2012)

Новосибирский государственный университет, Новосибирск, Россия

Приглашенный преподаватель на факультет естественных наук (Ноябрь 2010)

ЧЛЕНСТВО

Российское общество биохимиков и молекулярных биологов

ЗНАНИЕ ЯЗЫКОВ

• Русский (родной язык)
• Английский (Intermediate)

ПУБЛИКАЦИИ

Scopus/Web of Science

Mikhaylova. A.G., Mikhailova, A.A., Ushakova, K., Tretiakov, E., Yurchenko, A., Zazhytska, M., Knorre, D.A., Zdobnov, E., Fleischmann, Z., Annis, S., Franco, M., Wasko, K., Kunz, W.S., Mazunin, I., Nikolaev, S., Reymond, A., Khrapko, K., Gunbin, K., Popadin, K. Mitochondrial mutational spectrum provides an universal marker of cellular and organismal longevity. bioRxiv. (DOI: 10.1101/589168)

Skuratovskaia, D., Litvinova, L., Zatolokin, P., Vulf, M., Popadin, K., Mazunin, I. From normal to obesity and back: the dynamics of mtDNA level suggest the causative link (2019) Cells (submitted, Minor Revisions)

Skuratovskaia, D., Zatolokin, P., Vulf, M., Mazunin, I., Litvinova, L. Interrelation of chemerin and TNF-α with mtDNA copy number in adipose tissues and blood cells in obese patients with and without type 2 diabetes (2019) BMC Medical Genomics (DOI: 10.1186/s12920-019-0485-8)

Litvinova, L., Zatolokin, P., Vulf, M., Mazunin, I., Skuratovskaia, D. The relationship between the mtDNA copy number in insulin-dependent tissues and markers of endothelial dysfunction and inflammation in obese patients (2019) BMC Medical Genomics (DOI: 10.1186/s12920-019-0486-7)

Bykov, R.A., Yudina, M.A., Gruntenko, N.E., Zakharov, I.K., Voloshina, M.A., Melashchenko, E.S., Danilova, M.V., Mazunin, I.O., Ilinsky, Y.Y. Prevalence and genetic diversity of Wolbachia endosymbiont and mtDNA in Palearctic populations of Drosophila melanogaster (2019) BMC Evolutionary Biology (DOI: 10.1186/s12862-019-1372-9)

Verechshagina, N., Nikitchina, N., Yamada, Y., Harashima, H, Tanaka, M., Orishchenko, K., Mazunin, I. Future of human mitochondrial DNA editing technologies (2019) Mitochondrial DNA Part A: DNA Mapping, Sequencing, and Analysis, 30(2), pp. 214-221

Mazunin I. Human mitochondrial genome surgery (2018) Genes & Cells (DOI: 10.23868/201811030)

Verechshagina, N.A., Konstantinov, Y.M., Kamenski, P.A., Mazunin, I.O. Protein and nucleic acid import into mitochondria (2018) Biochemistry (Moscow), 83(6), pp. 643-661

Mazunin, I.O., Volodko, N.V. Leber hereditary optic neuropathy (2018) Vestnik Oftalmologii, 134(2), pp. 92-97

Skuratovskaia, D.A., Sofronova, J.K., Zatolokin, P.A., Popadin, K.Y., Vasilenko, M.A., Litvinova, L.S., Mazunin, I.O. Additional evidence of the link between mtDNA copy number and the body mass index (2018) Mitochondrial DNA Part A: DNA Mapping, Sequencing, and Analysis, 29(8), pp. 1240-1244

Skuratovskaia, D.A., Sofronova, J.K., Zatolokin, P.A., Vasilenko, M.A., Litvinova, L.S., Mazunin, I.O. The association of the mitochondrial DNA OriB variants with metabolic syndrome (2017) Biochemistry (Moscow) Supplement Series B: Biomedical Chemistry, 63 (6), pp. 533-538.

Sofronova, J.K., Ilinsky, Y.Y., Orishchenko, K.E., Chupakhin, E.G., Lunev, E.A., Mazunin, I.O. Detection of mutations in mitochondrial DNA by droplet digital PCR (2016) Biochemistry (Moscow), 81 (10), pp. 1031-1037.

Orishchenko, K.E., Sofronova, J.K., Chupakhin, E.G., Lunev, E.A., Mazunin, I.O. Delivery Cas9 into mitochondria (2016) Genes & Cells, XI (2), pp. 100-105

Toshchakov, S.V., Korzhenkov, A.A., Samarov, N.I., Mazunin, I.O., Mozhey, O.I., Shmyr, I.S., Derbikova, K.S., Taranov, E.A., Dominova, I.N., Bonch-Osmolovskaya, E.A., Patrushev, M.V., Podosokorskaya, O.A., Kublanov, I.V. Complete genome sequence of and proposal of Thermofilum uzonense sp. nov. a novel hyperthermophilic crenarchaeon and emended description of the genus Thermofilum (2015) Standards in Genomic Sciences

Mazunin, I.O., Levitskii, S.A., Patrushev, M.V., Kamenski, P.A. Mitochondrial matrix processes (2015) Biochemistry (Moscow), 80 (11), pp. 1418-1428.

Patrushev, M.V., Mazunin, I.O., Vinogradova, E.N., Kamenski, P.A. Mitochondrial fission and fusion (2015) Biochemistry (Moscow), 80 (11), pp. 1457-1464.

Sokhonevich, N.A., Yurova, K.A., Gutsol, A.A., Khaziakhmatova, O.G., Mazunin, I.O., Litvinova, L.S. Effects of Immunoregulatory Cytokines (IL-2, IL-7, and IL-15) on Expression of Gfi1 and U2afll4 Genes in T Cells at Different Stages of Differentiation (2015) Bulletin of Experimental Biology and Medicine, 4 p.

Patrushev, M.V., Kamenski, P.A., Mazunin, I.O. Mutations in mitochondrial DNA and approaches for their correction (2014) Biochemistry (Moscow), 79 (11), pp. 1151-1160.

Mozheĭ, O.I., Zatolokin, P.A., Vasilenko, M.A., Litvinova, L.S., Kirienkova, E.V., Mazunin, I.O. Evaluating the mitochondrial dna copy number in leukocytes and adipocytes from metabolic syndrome patients: pilot study (2014) Molecular Biology, 48 (4), pp. 677-681.

Litvinova, L.S., Kirienkova, E.V., Mazunin, I.O., Vasilenko, M.A., Fattakhov, N.S. Pathogenesis of insulin resistance in metabolic obesity (2014) Biochemistry (Moscow) Supplement Series B: Biomedical Chemistry, 8 (3), pp. 192-202.

Litvinova, L.S., Mazunin, I.O., Gutsol, A.A., Sokhonevich, N.A., Khaziakhmatova, O.G., Kofanova, K.A. Dose-response effect of steroid hormones on Gfi1 and U2af1l4 gene expression in T lymphocytes at different stages of differentiation (2013) Molecular Biology, 47 (4), pp. 572-580.

Sukernik, R.I., Volodko, N.V., Mazunin, I.O., Eltsov, N.P., Dryomov, S.V., Starikovskaya, E.B.

Mitochondrial genome diversity in the tubalar, even, and ulchi: Contribution to prehistory of native siberians and their affinities to native americans (2012) American Journal of Physical Anthropology, 148 (1), pp. 123-138.

Sukernik, R.I., Volodko, N.V., Mazunin, I.O., Eltsov, N.P., Starikovskaya, E.B. The genetic history of Russian old settlers of polar northeastern Siberia (2010) Russian Journal of Genetics, 46 (11), pp. 1386-1394.

Mazunin, I.O., Volodko, N.V., Starikovskaya, E.B., Sukernik, R.I. Mitochondrial genome and human mitochondrial diseases (2010) Molecular Biology, 44 (5), pp. 665-681.

Mazunin, I.O. Modern concepts of the miotochondrial structure and functions (2010) Russian Journal of Genetics, 46 (9), pp. 1100-1101.

Eltsov, N.P., Volodko, N.V., Starikovskaya, E.B., Mazunin, I.O., Sukernik, R.I. The role of natural selection in the evolution of mitochondrial haplogroups in Northeastern Eurasia (2010) Russian Journal of Genetics, 46 (9), pp. 1105-1107.

Volodko, N.V., Starikovskaya, E.B., Mazunin, I.O., Eltsov, N.P., Naidenko, P.V., Wallace, D.C., Sukernik, R.I. Mitochondrial Genome Diversity in Arctic Siberians, with Particular Reference to the Evolutionary History of Beringia and Pleistocenic Peopling of the Americas (2008) American Journal of Human Genetics, 82 (5), pp. 1084-1100.

УСТНЫЕ ДОКЛАДЫ

Мазунин И.О. Биологическая роль митохондрий. Технологии манипуляции уровнем гетероплазмии митохондриальной  ДНК. КАРМ-2018. Москва, 29 ноября – 2 декабря, 2018

Мазунин И.О. Создание клеток с заданными свойствами и функциями. Балтийский симпозиум по иммунологии, молекулярной и регенеративной медицины. Калининград, 22-23 ноября 2018

Мазунин И.О. Технологии удаления мутантных мтДНК как часть процедуры цитоплазматической замены. XXVIII Ежегодная международная конференция РАРЧ «Репродуктивные технологии сегодня и завтра». Уфа, 5-8 сентября, 2018

Мазунин И.О. Mitochondrial Genome Surgery. Международная конференция Хромосома 2018, Новосибирск, 20-24 августа, 2018

Мазунин И.О. Hacking the human mitochondrial genetic code. Механизмы регуляции функций органелл эукариотической клетки. Иркутск, 22-24 мая, 2018 - пленарный доклад (DOI:10.31255/978-5-94797-318-1-63-64)

Мазунин И.О. Современные инструменты в генетической хирургии. Гибридные технологии и биомедицинские приложения. Калининград, 21-27 августа 2016

Мазунин И.О. На пути к редактированию геномов органелл. Гибридные технологии и биомедицинские приложения. Калининград, 24-30 августа 2015

Мазунин И.О. Митохондриальный геном, в норме и патологии. Научная школа по молекулярной и клеточной биологии, биотехнологии и молекулярным аспектам фундаментальной медицины. ОМКБ ИХБФМ СО РАН, Новосибирск, 1-2 сентября, 2010

Мазунин И.О. Новые данные по структуре и функциям митохондрий. Международная конференция Хромосома 2009, Новосибирск, 31 августа – 6 сентября, 2009

ПАТЕНТЫ

Можей О.И., Королева Ю.А., Мазунин И.О. (2015) Способ молекулярной диагностики митохондриальных патологий на основе технологии пиросеквенирования. Патент на изобретение № 2633752

Орищенко К.Е., Мазунин И.О. (2015) Генетическая конструкция на основе системы редактирования генома CRISPR/Cas9, кодирующая нуклеазу cas9, специфически импортируемую в митохондрии клеток человека. Патент на изобретение № 2634395

Орищенко К.Е., Мазунин И.О., Верещагина Н.А., Никитчина Н.А. (2016) Генетическая конструкция pMitoAsCpf1, кодирующая нуклеазу AsCpf1 с детерминантной импорта в митохондрии клеток человека. Патент на изобретение № 2662994

Мазунин И.О. Mодификации структуры направляющей нуклеазу SpCas9 молекулы РНК для обеспечения импорта в митохондрии клеток (Заявка отправлена на рассмотрение о выдачи патента)

Мазунин И.О. Генетические конструкции, кодирующие направляемые в митохондрии клеток человека нуклеазы Cas9-BE4-Gam и Cas9-ABE 7.10 (Заявка отправлена на рассмотрение о выдачи патента)