ДНК/РНК:
Уверенное владение методами молекулярной биологии (ПЦР, рестрикция, лигирование, трансформация, выделение нуклеиновых кислот, электрофорез нуклеиновых кислот).
Создание генетических конструкций с использованием методов молекулярного клонирования.

Белки:
Подбор условий для экспрессии белков, выделение и очистка белков.
SDS PAAG, вестерн-блот.

Клеточные культуры:
Работа с эукариотическими клеточными культурами (ведение культур, криоконсервация, трансфекция, трансдукция).

Анализ данных:
Большой опыт работы с биологическими базами данных (Pubmed, NCBI, UniProtKB, PDB)
Уверенный пользователь UCSF Chimera, OriginPro
Python, R

Спектроскопия, микроскопия:
УФ-спектрометрия, флуориметрия
Флуоресцентная микроскопия, конфокальная микроскопия

Хроматография:
ИОХ, гель-фильтрация

Практики, стажировки:

• Летняя школа анализа биомедицинских данных, МФТИ, 2022
  Проект по изучению сайтов рекомбинации и реассортации в геноме вируса гриппа А типа H7N7 на основе анализа первичной структуры геномов.
• В рамках производственной практики в лаборатории микробиологического анализа ВО ЦКВ АО "Мосводоканал" освоены такие микробиологические техники, как культивирование роста микроорганизмов, выделение чистых  культур микроорганизмов, подсчет и идентификация микроорганизмов (оксидазный и люциферазный тесты).

Публикации

1. Mamontova AV, Simonyan TR, Bogdanov AM. Mol Biol (Mosk). 2022;56(6):1039-1043.

2. Simonyan, T.R.; Protasova, E.A.; Mamontova, A.V.; Shakhov, A.M.; Lukyanov, K.A.; Maksimov, E.G.; Bogdanov, A.M. A Single Fluorescent Protein-Based Indicator with a Time-Resolved Fluorescence Readout for Precise pH Measurements in the Alkaline Range. Int. J. Mol. Sci. 2022, 23, 12907. https://doi.org/10.3390/ijms232112907

3. Mamontova, A.V., Simonyan, T.R., Lukyanov, K.A. et al. Circular Permutants of BrUSLEE Protein as Fluorescent pH Indicators. Russ J Bioorg Chem 48, 850–853 (2022).

4. Recombinant Cathepsin L of Tribolium castaneum and Its Potential in the Hydrolysis of Immunogenic Gliadin Peptides. Dvoryakova Elena A., Klimova Maria A., Simonyan Tatiana R., Dombrovsky Ivan A., Serebryakova M., Tereshchenkova Valeriia F., Dunaevsky Yakov E., Belozersky Mikhail A., Filippova Irina Y., Elpidina Elena N. 2022. International Journal of Molecular Sciences, MDPI (Basel, Switzerland), v. 23, № 13, p. 7001

5. Amino acid residue at the 165th position tunes EYFP chromophore maturation. A structure-based design. Computational and Structural Biotechnology Journal. N. V. Pletneva, E. G. Maksimov, E. A. Protasova, A. V. Mamontova, T. R. Simonyan, R. H. Ziganshin, K. A. Lukyanov, L. Muslinkina, S. Pletnev, A. M. Bogdanov, V. Z. Pletnev. 2021 May. 19: 2950-2959.

6. Prolamine-cleaving peptidases. Design and synthesis of peptidomimetics for their search and study. Filippova I.Yu., Elpidina E.N., Sokolenko N.I., Tereshchenkova V.F., Vorotnikova E.A., Simonyan T. R., Dunaevsky Ya.E., Belozersky M.A. // Acta Naturae. 2017, № Special issue, p. 124

Конференции

1. Precise measurements of intracellular pH using the single fluorescent protein-based probe and fluorescence lifetime readout T.R. Simonyan, E.A. Protasova, A.V. Mamontova, A.M. Shakhov, K.A. Lukyanov, E.G. Maksimov, A.M. Bogdanov. Focus on Microscopy 2022 – Online. 2022 April 10-13. Oral presentation.

2. FLIM indicators for quantitative measurement of рН. T.R. Simonyan, A. V. Mamontova, K. A. Lukyanov, A. M. Bogdanov. 8th International Symposium on Sensor Science (session Nano(bio)Sensors and Bioelectronics). Online. 2021 May 17-28. Poster presentation.

3. Genetically encoded probe for calcium imaging in lifetime domain. T. Simonyan, A. Mamontova, A. Shakhov, K. Lukyanov, A. Bogdanov. mmc2021: Microscience Microscopy Congress 2021. Online. 2021 July 5-9. Oral presentation.

4. The study of the properties of mutant forms of cathepsin L Tribolium castaneum. Simonyan T. R., Dvoryakova E. N. XXVI International Scientific Conference of Students, Postgraduates and Young Scientists "Lomonosov - 2019", Lomonosov Moscow State University, Russia. Oral presentation.

5. Comparative analysis of the efficiency of hydrolysis of highly selective peptide substrates of cysteine peptidases of the papain family. Simonyan T. R., Dvoryakova E. A. XXIV International Scientific Conference of Students, Postgraduates and Young Scientists "Lomonosov - 2017", Lomonosov Moscow State University, Russia. Oral presentation.

Дополнительные мероприятия

Участвовала в программе Формула БИОТЕХ 2018, организованной Научным парком МГУ им. М. В. Ломоносова и компанией «Иннопрактика». В составе команды работала над проектом компании SPLAT по поиску новых пептидаз – кандидатов для включения в состав продуктов Oral Care