Александр Ш.

Молекулярный биолог, биоинформатик
 
 
Последнее обновление резюме 21.04.2024
Адрес Москва, Russian Federation
Электронная почта Заблокировано
Телефон Заблокировано

Опыт

ФГБУ "ЦСП"
Аналитик, аннотатор
Июл 2019 - Май 2020
Написание ТЗ для пайплайнов обработки данных NGS. Аннотирование геномов человека.
ООО "Онкобокс"
Аналитик
Дек 2017 - Июн 2019
Аналитика в области молекулярной биологии. Ручная сборка баз данных с SNP,
ассоциированными с онкологическими заболеваниями и баз данных с информацией об испытаниях противораковых препаратов. Работа с TCGA и clinicaltrials.gov. Парсинг данных на python. Визуализация биохимических сигнальных путей на python.
АО "Вектор бест"
Продакт-менеджер (реактивы и оборудование для ПЦР)
Авг 2017 - Дек 2017
Установка детектирующих амплификаторов Biorad, инсталляция ПО для проведения ПЦР, подключение амплификаторов к лабораторной информационной системе. Обучение персонала лабораторий работе с ПО и с наборами реактивов для ПЦР.
НИИ Общей генетики им. Вавилова РАН
Младший научный сотрудник
Янв 2016 - Авг 2017
Иммуноблотинг тяжелых белков. ПЦР, ПЦР в реальном времени. NGS Ion Torrent.
ФГБУ «ЦМИКЭЭ» Росздравнадзора
Специалист-эксперт
Янв 2015 - Янв 2016
Экспертиза испытаний и регистрация на территории РФ медицинских изделий,
предназначенных для диагностики in vitro.
Институт медико-биологических проблем РАН
Младший научный сотрудник
Окт 2011 - Янв 2016
Исследования цитотоксических свойств наноматериалов. Работа на проточном
цитофлуориметре. Культуральная работа с клетками человека.
НИИ Центр "Биоинженерия" РАН
Лаборант (студент дипломник)
Окт 2010 - Июн 2011
Генетическая трансформация высших растений, работа с тканями растений в культуре.
Культивирование трансгенных микроорганизмов (агробактерия). Приготовление
культуральных сред для культивирования каллусных и нормальных тканей растений.

Образование

Институт медико-биологических проблем Российской академии наук, Москва
Институт медико-биологических проблем Российской академии наук, Москва
Окт 2011 - Май 2015
Аспирантура
Рязанский государственный агротехнологический университет им. П. А. Костычева, Рязань
Рязанский государственный агротехнологический университет им. П. А. Костычева, Рязань
Окт 2006 - Май 2011
Факультет биотехнологии и ветеринарной медицины

В чем вы сильны?

Навыки:

-Метод проточной цитометрии

-Культуральная работа с тканями высших растений

-Работа с генетически модифицированными бактериями

-Флуоресцентные клеточные зонды

-Культуральная работа с клетками человека

-ПЦР в реальном времени

-Секвенирование ДНК (NGS Ion Torrent)

-Обучение персонала мед. лабораторий (ПЦР)

-Установка оборудования и ПО (ПЦР)

-Обработка NGS

-Linux

-SQLite

-MongoDB

-Python (Pandas, Open-cravat (python-фреймворк для функционального аннотирования генотипа человека), Apache Airflow, Django Framework)

-PLINK

-Ensembl VEP

-Git

 

Расскажите о себе что-нибудь еще: публикации, конференции, хобби