Сергей П.

Биоинформатик-программист

Работа на половину ставки, желательно с возможностью работать удаленно. Интересны проекты и возможность публикаций в области genomics-исследований.

Последнее обновление резюме 13.12.2019
Адрес Москва, Russian Federation
Электронная почта Заблокировано
Телефон Заблокировано

Опыт

ООО "СоюзСемСвекла"
Биоинформатик
Окт 2016 - Текущий
Генетика растений, SNP-коллинг, GWAS-исследования, администрирование Unix-систем.
Лаборатория молбиологии и вычислительной генетики ИОГен РАН
Специалист
Июл 2014 - Текущий
Разработка алгоритмов аннотации и построения геномных графов вариаций.

Образование

МФТИ
Кафедра биоинформатики, ФБМФ
Дек 2019 - Текущий
Аспирантура на кафедре биоинформатики Московского Физико-Технического института

В чем вы сильны?

Технические навыки: C#, Python, многопоточное программирование на CUDA и MPI, есть навыки работы с алгоритмами машинного обучения. Трехлетний стаж администрирования вычислительного кластера под Unix-системой.

Опыт биоинформатической работы: анализ NGS-данных, SNP-коллинг, работа над GWAS-проектами, разработка алгоритмов  для анализа изоформ, разработка алгоритмов для аннотации генома. 

Расскажите о себе что-нибудь еще: публикации, конференции, хобби

Публикации: Petrov S., Uroshlev L, Kasyanov A., et al.(2018) «An efficient algorithm for mapping of reads to a genome graph using an index based on hash tables and dynamic programming».  Biophysics, 2018;63(3):311–317.

Конференции: BIATA-17, ECCMB-18, MCCMB-19, ВОГИС-19, тема устных докладов и постеров - алгоритмы на геномных графах.