Александр Д.
начинающий биоинформатик / опытный молекулярный биологЗдравствуйте, меня зовут Александр Дорохин, я молекулярный биолог и биотехнолог, в настоящий момент заинтересован найти постоянную, долгосрочную позицию в России, с возможностью работать удаленно.
Заинтересован в профессиональном росте и развитие в области биоинформатики и вычислительной биологии.
Автор и преподаватель онлайн-курса: “Анализ данных NGS: практика для начинающих.” https://stepik.org/course/97158/promo - c 2021 по настоящий момент.
Участвовал волонтером в проекте по сборке пластомов de novo - по уточнению на филогенетическом древе Asparagales ранее не секвенированных растений 2020-2022 (fastqc-trimmomatic/bbtools – spades – bwa etc.).
Также в 2019-2021 годах в проекте Ариэльского университета (Израиль «The Role of Mitochondrial Epigenetics in Aging» - сбор дата-сета и обработка данных бисульфитного секвенирования ДНК (R — пакеты Bioconductor etc.).
Последнее обновление резюме | 13.08.2022 |
Адрес | Jerusalem, Israel |
Электронная почта | Заблокировано |
Телефон | Заблокировано |
Соцсеть или сайт | Заблокировано |
Образование
Биологический факультет
(в прошлом МГГУ им. М.А. Шолохова https://mggu-sh.ru/ 2004 - 2009)
Дипломная работа “Регуляция экспрессии гена метионинаминопептидазы Escherichia coli”
В чем вы сильны?
Курсы повышения квалификации:
2019 - «Статистика для биологов» - Институт Биоинформатики (https://bioinf.me/) https://stepik.org/cert/251354
2021 - «Анализ данных NGS: введение в медицинскую и статистическую генетику»
- Институт Биоинформатики (https://bioinf.me/) https://drive.google.com/file/d/1pRHaVFmw43hsgZREPUdQ2kP_JjhBv1RE/view
2022 - «Genomic Data Science» by Johns Hopkins University on Coursera.
https://www.coursera.org/account/accomplishments/specialization/certificate/4G4UQC7NPBVQ
- PROFESSIONAL SOFTWARE for data processing NGS:
pre-proccesing NGS data: fastqc; trimmomatic; bbtools•Alignment: BWA; Bowtie2;
Post-processing short DNA sequence read alignments: Samtools; Qualimap;
Assembly de novo SPADES; GetOrganelle; Unicycler; MIRA
Variant calling: Bcftools; freebayes; VarScan; GATK;
Post-processing VCF-files: Bcftools; vcftools; tabix; • Annotation VCF files: VEP; GWAS; - Entry level programming in R (Bioconductor), python, bash, ssh
- R&D - biotechnological production and molecular biology.
Расскажите о себе что-нибудь еще: публикации, конференции, хобби
Публикации:
1) Speranskaia, A. S., Dorokhin, A. V., Novikova, S. I., Shevelev, A. B., & Valueva, T. A. (2003). Cloning a sequence, coding an SKT1 family protease inhibitor from potato. Genetika, 39(11), 1490-1497.
2) Сперанская A.C., Дорохин A.B., Кузнецова Т.В., Хоменков В.Г., Шевелев А.Б., Валуева Т.А. (2003) Ингибиторы сериновых протеиназ типа Кунитца из картофеля сорта Истринский III Международная конференция «Регуляция роста, развития и продуктивности растений». Минск. - С. 265
3) Сперанская А.С., Дорохин А.В., Новикова С.И., Шевелев А.Б., Валуева Т.А., (2002) Разработка метода клонирования фрагментов ДНК картофеля, кодирующих ингибиторы сериновых протеиназ типа Кунитца V симпозиум по химии протеолитических ферментов : Тез . докл . и стенд . сообщ . Москва. - С . 79.