Vladimir K.

Биоинформатик, data scientist

Сейчас развиваюсь в области анализа данных и машинного обучения. Заинтересован в проектах как по структурной, так и по геномной/эволюционной биоинформатике, а также в омиксных исследованиях и хемоинформатике.

 

Рассматриваю вакансии с релокацией или удаленно, в том числе как PhD студент

Последнее обновление резюме 12.10.2022
Адрес Kokshetau, Kazakhstan
Электронная почта Заблокировано
Соцсеть или сайт Заблокировано

Опыт

Научно-исследовательский институт гигиены, профпатологии и экологии человека (ФГУП «НИИ ГПЭЧ» ФМБА России)
Младший научный сотрудник
Июл 2020 - Сен 2022
Работа на Linux-сервере, работа с NGS данными, программирование на Python, машинное обучение, докинг
Первый Московский государственный медицинский университет им. И.М. Сеченова
Младший научный сотрудник
Апр 2017 - Дек 2019
Математическое моделирование динамики биополимеров, обработка полученных данных, методы статистики, работа на удалённом Linux-сервере, работа в Schrodinger
Петербургский институт ядерной физики
Старший лаборант
Окт 2013 - Июн 2016
Математическое моделирование динамики биополимеров, обработка полученных данных, методы статистики, работа на удалённом Linux-сервере, работа в GROMACS.

Затем микробиологические методы: ПЦР, электрофорез, обратная транскрипция

Образование

Санкт-Петербургский государственный политехнический университет, Санкт-Петербург
Биофизика
Авг 2014 - Июн 2016
Санкт-Петербургский государственный политехнический университет, Санкт-Петербург
Биофизика
Авг 2010 - Июн 2014

В чем вы сильны?

Хорошо знаком с молекулярной динамикой и методами докинга, занимался drug design. Имею знания в R и Python. 

Сейчас активно изучаю машинное обучение и анализ данных

Расскажите о себе что-нибудь еще: публикации, конференции, хобби

Публикации и участия в конференциях

  • Moldogazieva, N. T., Ostroverkhova, D. S., Kuzmich, N. N., Kadochnikov, V. V., Terentiev, A. A., & Porozov, Y. B. (2020). Elucidating binding sites and affinities of ERα agonists and antagonists to human alpha-fetoprotein by in silico modeling and point mutagenesis. International journal of molecular sciences, 21(3), 893.
  • Островерхова Д.С., Кадочников В.В., Молдогазиева Н.Т., Порозов Ю.Б. «Связывание альфа-фетопротеина человека с эстрогенами и антиэстрогенами: изучение с помощью молекулярного моделирования и докинга» //Международный конгресс "Биотехнология: состояние и перспективы развития", c. 335-337 - 2019
  • Кадочников В.В., Ильясов И.Р., Щапин И.Ю., Белобородов В.Л., Порозов Ю.Б. «Оценка антирадикальных свойств флавоноидов in silico»//XXV Симпозиум «Биоинформатика и компьютерное конструирование лекарств» - 2019
  • Kadochnikov V.V., Ilyasоv I.R., Beloborodov V.L., Porozov Y.B. «Radical-catching activity of flavonoids»//Sechenov International Biomedical Summit IET, p. 43 - 2018
  • Кадочников В.В., Ильясов И.Р., Белобородов В.Л., Порозов Ю.Б. «Радикал-улавливающая активность флавоноидов: компьютерное моделирование и экспериментальные данные»// Х Симпозиум «Фенольные соединения: фундаментальные и прикладные аспекты», Вып. 10 - 2018
  • Кадочников В.В., Ильясов И.Р., Белобородов В.Л., Порозов Ю.Б. «Антирадикальная активность флавоноидов»//VII Конгресс молодых ученых - 2018
  • Шандыбина Н.Д., Кадочников В.В,, Каява А.В., Порозов Ю.Б. «Алгоритм и математическая модель верификации кросс-бета амилоидных структур», XXIII Симпозиум «Биоинформатика и компьютерное конструирование лекарств» - 2017
  • Kadochnikov, V., Egorov, V., Shvetsov, A., Kuklin, A., Isaev-Ivanov, V., & Lebedev, D. (2016). Modeling of conformational transitions of fibrillogenic peptide, homologous to beta-domain of human alpha-lactalbumin. Crystallography Reports,61(1).
  • Shvetsov, A. V., Kadochnikov, V. V., Egorov, V. V., Isaev-Ivanov, V. V., Lebedev, D. V., Vasin, A. V., & Tsybalova, L. M. (2015). Conformational flexibility of nonamer ribonucleoprotein complexes from Influenza A virus.The Febs Journal, 282, 371-372.
  • Кадочников В.В., Щвецов А.В., Егоров В.В., Лебедев Д.В «Моделирование конформационных особенностей фибриллогенного пептида» Первая конференция молодых сотрудников и специалистов ПИЯФ - 2014
  • Кадочников В.В., Щвецов А.В., Егоров В.В., Лебедев Д.В. «Моделирование конформационных особенностей фибриллогенного пептида» , Совещание и Молодежная конференция по использованию рассеяния нейтронов и синхротронного излучения в конденсированных средах - 2014
  • Кадочников В.В., Щвецов А.В., Егоров В.В., «Моделирование эффекта малого пептида на стабильность бета-структур», Школа-конференция "Биология — наука 21-го века" - 2014
Патент
Шандыбина Н.Д.,  Кадочников В.В,, Князев С.Н., Порозов Ю.Б. Свидетельство о государственной регистрации программы для ЭВМ // Федеральная служба по интеллектуальной собственности - 2017. - № 2017662295.
Учебно-методическое пособие
Гуреев М.А., Кадочников В.В, Порозов Ю.Б. Молекулярный докинг и его верификация в контексте виртуального скрининга 2018, Университет ИТМО