Екатерина Д.
биоинформатик в области медицинской генетики и нейробиологииУдаленная работа в области обработки биоинформатических данных для точной медицины и научных исследований
| Последнее обновление резюме | 04.01.2022 |
| Адрес | Москва, Russian Federation |
| Электронная почта | Заблокировано |
| Телефон | Заблокировано |
Опыт
Genetico
Стажер-биоинформатик
Стажер-биоинформатик
Янв 2022
- Фев 2022
Обзор биоинформатических инструментов для анализа и интерпретации вариантов митохондриальной ДНК с использованием данных WGS (Использованные программные средства: Mutserve, Mutect2, Freebayes, HaplotypeCaller, Mity, VEP, ANNOVAR, HmtNote)
Semantic Hub
Аналитик
Аналитик
Июн 2020
- Янв 2021
Осуществляла статистический анализ медицинских данных, полученных с помощью обработки естественного языка, и визуализацию пути пациента для 5 крупных проектов по орфанным и распространенным заболеваниям
Исследовательский центр клеточной биологии г. Монпелье, Франция (CRBM CNRS)
Стажер в лаборатории структурной биоинформатики
Стажер в лаборатории структурной биоинформатики
Июл 2019
- Авг 2019
Анализ и сравнение большинства современных предикторов влияния мутаций на структуру белка
(Использованные программные средства: BLAST, PyMOL, HTML, API)
(Использованные программные средства: BLAST, PyMOL, HTML, API)
OncoUnite, и.ц. Сколково
Стажер в лаборатории онкобиоинформатики в области персонализированной медицины
Стажер в лаборатории онкобиоинформатики в области персонализированной медицины
Июл 2018
- Авг 2018
Разработала приложение для распознавания канцерогенных мутаций в ДНК пациентов (Использованные программные средства: FastQC, SAMtools, Biopython, Pandas)
Образование
Сколтех
Магистрант в области биотехнологии
Магистрант в области биотехнологии
Сен 2020
- Текущий
Научный руководитель: Филипп Хайтович
Тематика исследований: Транскриптомный и липидомный анализ данных
мозга человека, подкрепленный открытыми данными фМРТ
Тематика исследований: Транскриптомный и липидомный анализ данных
мозга человека, подкрепленный открытыми данными фМРТ
РГГУ
Бакалавр в области интеллектуальных систем
Бакалавр в области интеллектуальных систем
Сен 2016
- Июл 2020
Научный руководитель: Виктор Финн
Тематика исследований в области персонализированной медицины: Программные средства увеличения полноты предсказания ДСМ-метода для диагностики заболеваний поджелудочной железы
Тематика исследований в области персонализированной медицины: Программные средства увеличения полноты предсказания ДСМ-метода для диагностики заболеваний поджелудочной железы
В чем вы сильны?
Биоинформатика:
— Анализ омиксных данных: геномики, липидомики, транскриптомики (DNA-seq, RNA-seq, в меньшей степени: ChIP-Seq, ATAC-Seq, Hi-C)
— Работа на удаленном сервере и взаимодействие с серверами биоинформатических баз данных и тулов (GenBank, BLAST и т.д.)
Языки программирования:
- Свободное владение: Python, AQL
- Продвинутый уровень: Bash, C#, Lisp, SQL, LaTeX
- Элементарное владение: R, UML, HTML
Иностранные языки:
— Английский язык (сертификат IELTS, уровень профессионального владения языком— C1)
— Немецкий язык, французский язык (продвинутый уровень B1)