Елена П.

Молекулярный биолог, PhD, специалист по Data Science

Работу в области анализа NGS-данных и разработки диагностических/прогностических панелей с использованием ML-подходов

Последнее обновление резюме 14.09.2022
Адрес Москва, Russian Federation
Электронная почта Заблокировано
Телефон Заблокировано

Опыт

Институт молекулярной биологии им. В.А. Энгельгардта Российской академии наук (ИМБ РАН)
Научный сотрудник
Мар 2022 - Текущий
Лаборатория Постгеномных исследований/ Руководитель гранта РНФ
Институт молекулярной биологии им. В.А. Энгельгардта Российской академии наук (ИМБ РАН)
Старший лаборант-исследователь
Сен 2016 - Мар 2022
Лаборатория Постгеномных исследований, совмещение с написанием кандидатской диссертации
Институт Биологии УНЦ РАН
Младший научный сотрудник
Сен 2015 - Сен 2016
Лаборатория Прикладной микробиологии

Образование


"Школа Анализа Данных"/ Яндекс.Практикум
Ноя 2021 - Авг 2022
Специалист по Data Science

Институт молекулярной биологии им. В.А. Энгельгардта Российской академии наук (ИМБ РАН)
Ноя 2016 - Ноя 2020
Очная аспирантура

Башкирский государственный университет (БашГУ)
Сен 2013 - Июн 2015
Магистратура, Биологический факультет, кафедра "Генетики и фундаментальной медицины"

Башкирский государственный университет (БашГУ)
Сен 2009 - Июн 2013
Бакалавриат, Биологический факультет, кафедра "Генетики и фундаментальной медицины"

В чем вы сильны?

  • Менеджмент научных исследований
  • Идентификация потенциальных маркеров в области молекулярной онкологии на основе анализа RNA-Seq/miRNA-Seq данных и разработкой модели на основе RT-PCR анализа

Расскажите о себе что-нибудь еще: публикации, конференции, хобби

  • К.б.н. по специальности "Молекулярная биология",
  • Руководитель гранта РНФ по разработке персонализированного подхода к лекарственной терапии кастрационно-резистентного рака предстательной железы на основе транскриптомного анализа
  • Специалист в области Data Science (повышение квалификации в Яндекс)

Список публикаций с ведущими позициями:

  1. Pudova EA, Kobelyatskaya AA, Katunina IV, Snezhkina AV, Fedorova MS, Guvatova ZG, Nyushko KM, Alekseev BY, Pavlov VS, Savvateeva MV, Kudryavtsev AA, Krasnov GS, Kudryavtseva AV. Dynamic Profiling of Exosomal microRNAs in Blood Plasma of Patients with Castration-Resistant Prostate Cancer. Front Biosci (Schol Ed). 2022 May 23;14(2):15. doi: 10.31083/j.fbs1402015. PMID: 35730440.
  2. Emelyanova M, Pudova E, Khomich D, Krasnov G, Popova A, Abramov I, Mikhailovich V, Filipenko M, Menshikova S, Tjulandin S, Pokataev I. Platinum-based chemotherapy for pancreatic cancer: impact of mutations in the homologous recombination repair and Fanconi anemia genes. Ther Adv Med Oncol. 2022 Mar 15;14:17588359221083050. doi: 10.1177/17588359221083050. PMID: 35309086; PMCID: PMC8928350.
  3. Kobelyatskaya AA, Pudova EA, Snezhkina AV, Fedorova MS, Pavlov VS, Guvatova ZG, Savvateeva MV, Melnikova NV, Dmitriev AA, Trofimov DY, Sukhikh GT, Nyushko KM, Alekseev BY, Razin SV, Krasnov GS, Kudryavtseva AV. Impact TMPRSS2-ERG Molecular Subtype on Prostate Cancer Recurrence. Life (Basel). 2021 Jun 21;11(6):588. doi: 10.3390/life11060588. PMID: 34205581; PMCID: PMC8234735.
  4. Pudova EA, Krasnov GS, Kobelyatskaya AA, Savvateeva MV, Fedorova MS, Pavlov VS, Nyushko KM, Kaprin AD, Alekseev BY, Trofimov DY, Sukhikh GT, Snezhkina AV, Kudryavtseva AV. Gene Expression Changes and Associated Pathways Involved in the Progression of Prostate Cancer Advanced Stages. Front Genet. 2021 Jan 21;11:613162. doi: 10.3389/fgene.2020.613162. PMID: 33552133; PMCID: PMC7859645.
  5. Pudova EA, Krasnov GS, Nyushko KM, Kobelyatskaya AA, Savvateeva MV, Poloznikov AA, Dolotkazin DR, Klimina KM, Guvatova ZG, Simanovsky SA, Gladysh NS, Tokarev AT, Melnikova NV, Dmitriev AA, Alekseev BY, Kaprin AD, Kiseleva MV, Snezhkina AV, Kudryavtseva AV. miRNAs expression signature potentially associated with lymphatic dissemination in locally advanced prostate cancer. BMC Med Genomics. 2020 Sep 18;13(Suppl 8):129. doi: 10.1186/s12920-020-00788-9. PMID: 32948204; PMCID: PMC7500008.
  6. Pudova EA, Lukyanova EN, Nyushko KM, Mikhaylenko DS, Zaretsky AR, Snezhkina AV, Savvateeva MV, Kobelyatskaya AA, Melnikova NV, Volchenko NN, Efremov GD, Klimina KM, Belova AA, Kiseleva MV, Kaprin AD, Alekseev BY, Krasnov GS, Kudryavtseva AV. Differentially Expressed Genes Associated With Prognosis in Locally Advanced Lymph Node-Negative Prostate Cancer. Front Genet. 2019 Aug 9;10:730. doi: 10.3389/fgene.2019.00730. PMID: 31447885; PMCID: PMC6697060.
  7. Snezhkina AV, Lukyanova EN, Fedorova MS, Kalinin DV, Melnikova NV, Stepanov OA, Kiseleva MV, Kaprin AD, Pudova EA, Kudryavtseva AV. [Novel Genes Associated with the Development of Carotid Paragangliomas]. Mol Biol (Mosk). 2019 Jul-Aug;53(4):613-626. Russian. doi: 10.1134/S0026898419040141. PMID: 31397435.
  8. Pudova EA, Kudryavtseva AV, Fedorova MS, Zaretsky AR, Shcherbo DS, Lukyanova EN, Popov AY, Sadritdinova AF, Abramov IS, Kharitonov SL, Krasnov GS, Klimina KM, Koroban NV, Volchenko NN, Nyushko KM, Melnikova NV, Chernichenko MA, Sidorov DV, Alekseev BY, Kiseleva MV, Kaprin AD, Dmitriev AA, Snezhkina AV. HK3 overexpression associated with epithelial-mesenchymal transition in colorectal cancer. BMC Genomics. 2018 Feb 9;19(Suppl 3):113. doi: 10.1186/s12864-018-4477-4. PMID: 29504907; PMCID: PMC5836836.