Софья Д.

Начинающий биоинформатик и молекулярный биолог

Ищу работу для биоинформатика. Желательно удаленную и с гибким графиком.

Последнее обновление резюме 02.05.2022
Адрес Казань, Russian Federation
Электронная почта Заблокировано
Телефон Заблокировано
Соцсеть или сайт Заблокировано

Опыт

PCR News
Автор
Янв 2022 - Текущий
Пишу новостные заметки по научным статьям. Профиль автора: https://pcr.news/author/sofya-dubovskova/
Лаборатория Фармакологии "Герофарм"
Стажер-исследователь
Июл 2021 - Авг 2021
Культивирование адгезионных и суспензионных культур клеток
млекопитающих (приготовление среды, замена среды, пассирование, разморозка, подсчет клеток в Countess Automated Cell Counter). Иммуноферментный анализ. Количественная ПЦР в реальном времени с пробоподготовкой.
НИЛ "Экстремальная Биология" КФУ
Практикант-аналитик
Апр 2021 - Текущий
Обработка данных NGS РНК. Linux command line programs (FastQC, FASTXToolkit, rRNAdust, Trimmomatic, BWA, HISAT2, BEDTools), bash basics, Python v. 3 (os, sys, Biopython), R v. 4 (dplir, ggplot2, edgeR, ClusterProfiler, chromVAR, TSSr).
НИЛ "Генные и клеточные технологии" КФУ
Практикант-исследователь
Фев 2020 - Мар 2021
Культивирование адгезионных культур клеток млекопитающих (приготовление среды, замена среды, пассирование, подсчет клеток в камере Горяева). Приготовление компетентных клеток E. coli методом теплового шока, электрофорез плазмидной ДНК в агарозном геле.

Образование

Казанский (Приволжский) Федеральный Университет
Институт Фундаментальной Медицины и Биологии
Сен 2018 - Текущий
Бакалавриат по направлению Биология.

В чем вы сильны?

GitHub

Программирование на Python v. 4 (модули sys, os, Biopython). Пишу скрипты для анализа текстовых данных и их конвертирования в другие форматы.

Работа в командной строке Linux, основы bash (программы fastqc, FASTX-Toolkit, trimmomatic, rRNAdust, BWA, hisat2, bedtools, samtools).

Программирование на R v. 4 (пакеты ggplot2, factoextra, edgeR, ClusterProfiler, chromVAR, TSSr).

Расскажите о себе что-нибудь еще: публикации, конференции, хобби

Ссылка на портфолио.

Конференции

  • Международный молодежный научный форум «Ломоносов-2022»: «Оценка влияния интерферона-γ, CpG-ODN 1826 и их сочетания на транскприпционный паттерн макрофагов Mus musculus».
  • 64-я Всероссийская Научная Конференция МФТИ: «Проверка гипотезы о синергетическом индуцировании Ifn-γ и CpG-ODN-1826 классической активации макрофагов мыши».

Олимпиады

  • «Мегаолимпиада ИТМО»: победитель по «Молекулярной биологии».
  • «Я магистрант КФУ»: призер по «Биологии»
  • «Я профессионал»: призер по «Биологии», «Экологии» и «Биоинженерии и биоинформатике».

Другое

  • Победительница конкурса стендовых докладов секции «Генетика» итоговой научно-образовательной конференции КФУ.
  • Участница конкурса научно-популярных статей «Био/Мол/Текст». Статья «Стволовые клетки: эпигенетический бьютиблог».
  • Участница воркшопа SCAMT Workshop Week, проект “Complete random project in genomics”.