Елена З.

Биоинформатик, начинающий биоинформатик, биостатистик
Ищу интересную наукоёмкую работу в биоинформатике.

Занятость:  полная занятость

График работы: гибкий график, полный день, удаленная работа

Последнее обновление резюме 12.10.2021
Адрес Москва, Russian Federation
Электронная почта Заблокировано
Телефон Заблокировано

Опыт

ФГБНУ НЦПЗ
Младший научный сотрудник
Янв 2016 - Текущий
Клеточная работа. Получение первичных культур из биопсии назального нейроэпителия человека. Получение нейросфер, дифференцировка в нейроны.
Экспериментальная работа. Разработка новых протоколов. Участие в грантах РНФ.
ФГБНУ НЦН, Отдел исследований мозга
Младший научный сотрудник
Окт 2011 - Окт 2017
Экспериментальная работа в клеточном блоке, анализ научной литературы, участие в написании научных статей и тезисов для конференций. Работа с животными (мыши и крысы).
Тема научной работы: "Влияние йонов меди на выживаемость зернистых нейронов мозжечка крыс в условиях окислительного стресса и глюкозного голодания". Участие в грантах РФФИ.

Образование

НИУ ВШЭ
Факультет компьютерных наук, программа "Анализ данных в биологии и медицине"
Сен 2020 - Текущий
Обучение основным навыкам необходимым биоинформатику: интенсивное обучение программированию на языках Python и R, прикладная статистика, молекулярная биология, сравнительная геномика, практическая биоинформатика.
Защитила на отлично курсовую работу по теме “Отличия альтернативного сплайсинга между слоями коры головного мозга человека”, в которой была проведена обработка транскриптомных данных (из базы SRA), анализ альтернативного сплайсинга, анализ функционального обогащения.
Первый Московский государственный медицинский университет им. И.М. Сеченова
Лечебный факультет
Сен 2008 - Июн 2014

В чем вы сильны?

Имеется опыт работы на высокопроизводительном сервере ОС Linux, написание скриптов на языках Python 3, R, обработка, анализ и визуализация (IGV)  геномных и транскриптомных данных, а также статистическая обработка и визуализация в среде разработки Rstudio. 

Имею базовые знания и навыки в области методов машинного обучения.

В начале 2021 года окончила курс "NGS data analysis", где получила ряд практических навыков:
Анализ качества и обработка прочтений секвенирования, сборка геномов de novo, транскриптомные сборки de novo, SNV-calling, анализ данных РНК-секвенирования и дифференциальная экспрессия, анализ метилирования (BS), общая схема анализа single cell sequencing.

Участвовала в выполнении работ по грантам фондов РФФИ и РНФ.
 
Большой опыт работы в “мокрой” лаборатории (клеточная биология). 

Сейчас прохожу обучение по программе магистратуры “Анализ данных в биологии и медицине” в ВШЭ.

Расскажите о себе что-нибудь еще: публикации, конференции, хобби

Публикации с моим участием:
  • Zelenova, E.A.; Kondratyev, N.V.; Lezheiko, T.V.; Tsarapkin, G.Y.; Kryukov, A.I.; Kishinevsky, A.E.; Tovmasyan, A.S.; Momotyuk, E.D.; Dashinimaev, E.B.; Golimbet, V.E.  TH9. NEUROSPHERES-DERIVED CELLS FROM HUMAN OLFACTORY EPITHELIUM FOR MASS NEURONAL CELL COLLECTION FOR PSYCHIATRY RESEARCH, European Neuropsychopharmacology, Volume 51, 2021, Page e199, ISSN 0924-977X, https://doi.org/10.1016/j.euroneuro.2021.08.184.
  • Zelenova, E.A.; Kondratyev, N.V.; Lezheiko, T.V.; Tsarapkin, G.Y.; Kryukov, A.I.; Kishinevsky, A.E.; Tovmasyan, A.S.; Momotyuk, E.D.; Dashinimaev, E.B.; Golimbet, V.E. Characterisation of Neurospheres-Derived Cells from Human Olfactory Epithelium. Cells 2021, 10, 1690. https://doi.org/10.3390/cells10071690
  • Isaev, N., Genrikhs, E., Aleksandrova, O. P., Zelenova, E., and Stelmashook, E. Glucose deprivation stimulates cu2+ toxicity in cultured cerebellar granule neurons and cu2+-dependent zinc release. Toxicology Letters 250 (2016), 29–34. 
  • Stelmashook, E. V., Genrikhs, E. E., Aleksandrova, O. P., Amelkina, G. A., Zelenova, E. A., and Isaev, N. K. Nmda-receptors are involved in cu2+/paraquat-induced death of cultured cerebellar granule neurons. Biochemistry (Moscow) 81, 8 (2016), 899–905. 
  • Stelmashook, E. V., Genrikhs, E. E., Kapkaeva, M. R., Zelenova, E. A., and Isaev, N. K. N-acety-l-cysteine in the presence of cu2+ induces oxidative stress and death of granule neurons in dissociated cultures of rat cerebellum. Biochemistry (Moscow) 82, 10 (2017), 1176–1182. 
  • Стельмашук, Е. В., Генрихс, Е. Е., Александрова, О. П., Амелькина, Г. А., Зеленова, Е. А., and Исаев, Н. К. Nmda-рецепторы вовлечены в гибель культивированных зернистых нейронов мозжечка, вызванную совместным действием cu2+ и параквата. Биохимия 81, 8 (2016), 1140–1147.
  • Стельмашук, Е. В., Генрихс, Е. Е., Александрова, О. П., Зеленова, Е. А., Хаспеков, Л. Г., and Исаев, Н. К. Антиоксидант тимохинон снижает гибель культивированных зернистых нейронов мозжечка, вызванную совместным действием Сu2+ и параквата. In Фундаментальные и прикладные проблемы нейронаук: функциональная асимметрия, нейропластичность нейродегенерация Материалы Второй Всероссийской конференции с международным участием Под редакцией М. А. Пирадова, С. Н. Иллариошкина и В. Ф. Фокина Москва (2016), vol. 10 of В, ДекАрт Москва, pp. 713–718.
  • Стельмашук, Е. В., Генрихс, Е. Е., Капкаева, М. Р., Зеленова, Е. А.,  Исаев, Н. К. N-АЦЕТИЛЦИСТЕИН В ПРИСУТСТВИИ cu2+ ВЫЗЫВАЕТ ОКИСЛИТЕЛЬНЫЙ СТРЕСС И ГИБЕЛЬ ЗЕРНИСТЫХ НЕЙРОНОВ В ДИССОЦИИРОВАННЫХ КУЛЬТУРАХ МОЗЖЕЧКА КРЫС. Биохимия 82, 10 (2017), 1530–1537.
  • Стельмашук, Е. В., Ивашкин, Е. Г., Генрихс, Е. Е., Зеленова, Е. А., Хаспеков, Л. Г., and Исаев, Н. К. Механизм защиты 5-(n-этил-n-изопропил) амилоридом культивированных зернистых нейронов мозжечка от цинк/каинатной токсичности.  Фундаментальные проблемы нейронаук. Функциональная асимметрия. Нейропластичность. Нейродегенерация (2014), Научный мир МОСКВА, pp. 827–831.