Елена З.
Биоинформатик, начинающий биоинформатик, биостатистикИщу интересную наукоёмкую работу в биоинформатике.
Занятость: полная занятость
График работы: гибкий график, полный день, удаленная работа
Последнее обновление резюме | 12.10.2021 |
Адрес | Москва, Russian Federation |
Электронная почта | Заблокировано |
Телефон | Заблокировано |
Опыт
ФГБНУ НЦПЗ
Младший научный сотрудник
Младший научный сотрудник
Янв 2016
- Текущий
Клеточная работа. Получение первичных культур из биопсии назального нейроэпителия человека. Получение нейросфер, дифференцировка в нейроны.
Экспериментальная работа. Разработка новых протоколов. Участие в грантах РНФ.
Экспериментальная работа. Разработка новых протоколов. Участие в грантах РНФ.
ФГБНУ НЦН, Отдел исследований мозга
Младший научный сотрудник
Младший научный сотрудник
Окт 2011
- Окт 2017
Экспериментальная работа в клеточном блоке, анализ научной литературы, участие в написании научных статей и тезисов для конференций. Работа с животными (мыши и крысы).
Тема научной работы: "Влияние йонов меди на выживаемость зернистых нейронов мозжечка крыс в условиях окислительного стресса и глюкозного голодания". Участие в грантах РФФИ.
Тема научной работы: "Влияние йонов меди на выживаемость зернистых нейронов мозжечка крыс в условиях окислительного стресса и глюкозного голодания". Участие в грантах РФФИ.
Образование
НИУ ВШЭ
Факультет компьютерных наук, программа "Анализ данных в биологии и медицине"
Факультет компьютерных наук, программа "Анализ данных в биологии и медицине"
Сен 2020
- Текущий
Обучение основным навыкам необходимым биоинформатику: интенсивное обучение программированию на языках Python и R, прикладная статистика, молекулярная биология, сравнительная геномика, практическая биоинформатика.
Защитила на отлично курсовую работу по теме “Отличия альтернативного сплайсинга между слоями коры головного мозга человека”, в которой была проведена обработка транскриптомных данных (из базы SRA), анализ альтернативного сплайсинга, анализ функционального обогащения.
Защитила на отлично курсовую работу по теме “Отличия альтернативного сплайсинга между слоями коры головного мозга человека”, в которой была проведена обработка транскриптомных данных (из базы SRA), анализ альтернативного сплайсинга, анализ функционального обогащения.
Первый Московский государственный медицинский университет им. И.М. Сеченова
Лечебный факультет
Лечебный факультет
Сен 2008
- Июн 2014
В чем вы сильны?
Имеется опыт работы на высокопроизводительном сервере ОС Linux, написание скриптов на языках Python 3, R, обработка, анализ и визуализация (IGV) геномных и транскриптомных данных, а также статистическая обработка и визуализация в среде разработки Rstudio.
Имею базовые знания и навыки в области методов машинного обучения.
В начале 2021 года окончила курс "NGS data analysis", где получила ряд практических навыков:
Анализ качества и обработка прочтений секвенирования, сборка геномов de novo, транскриптомные сборки de novo, SNV-calling, анализ данных РНК-секвенирования и дифференциальная экспрессия, анализ метилирования (BS), общая схема анализа single cell sequencing.
Участвовала в выполнении работ по грантам фондов РФФИ и РНФ.
Большой опыт работы в “мокрой” лаборатории (клеточная биология).
Сейчас прохожу обучение по программе магистратуры “Анализ данных в биологии и медицине” в ВШЭ.
Расскажите о себе что-нибудь еще: публикации, конференции, хобби
Публикации с моим участием:
- Zelenova, E.A.; Kondratyev, N.V.; Lezheiko, T.V.; Tsarapkin, G.Y.; Kryukov, A.I.; Kishinevsky, A.E.; Tovmasyan, A.S.; Momotyuk, E.D.; Dashinimaev, E.B.; Golimbet, V.E. TH9. NEUROSPHERES-DERIVED CELLS FROM HUMAN OLFACTORY EPITHELIUM FOR MASS NEURONAL CELL COLLECTION FOR PSYCHIATRY RESEARCH, European Neuropsychopharmacology, Volume 51, 2021, Page e199, ISSN 0924-977X, https://doi.org/10.1016/j.euroneuro.2021.08.184.
- Zelenova, E.A.; Kondratyev, N.V.; Lezheiko, T.V.; Tsarapkin, G.Y.; Kryukov, A.I.; Kishinevsky, A.E.; Tovmasyan, A.S.; Momotyuk, E.D.; Dashinimaev, E.B.; Golimbet, V.E. Characterisation of Neurospheres-Derived Cells from Human Olfactory Epithelium. Cells 2021, 10, 1690. https://doi.org/10.3390/cells10071690
- Isaev, N., Genrikhs, E., Aleksandrova, O. P., Zelenova, E., and Stelmashook, E. Glucose deprivation stimulates cu2+ toxicity in cultured cerebellar granule neurons and cu2+-dependent zinc release. Toxicology Letters 250 (2016), 29–34.
- Stelmashook, E. V., Genrikhs, E. E., Aleksandrova, O. P., Amelkina, G. A., Zelenova, E. A., and Isaev, N. K. Nmda-receptors are involved in cu2+/paraquat-induced death of cultured cerebellar granule neurons. Biochemistry (Moscow) 81, 8 (2016), 899–905.
- Stelmashook, E. V., Genrikhs, E. E., Kapkaeva, M. R., Zelenova, E. A., and Isaev, N. K. N-acety-l-cysteine in the presence of cu2+ induces oxidative stress and death of granule neurons in dissociated cultures of rat cerebellum. Biochemistry (Moscow) 82, 10 (2017), 1176–1182.
- Стельмашук, Е. В., Генрихс, Е. Е., Александрова, О. П., Амелькина, Г. А., Зеленова, Е. А., and Исаев, Н. К. Nmda-рецепторы вовлечены в гибель культивированных зернистых нейронов мозжечка, вызванную совместным действием cu2+ и параквата. Биохимия 81, 8 (2016), 1140–1147.
- Стельмашук, Е. В., Генрихс, Е. Е., Александрова, О. П., Зеленова, Е. А., Хаспеков, Л. Г., and Исаев, Н. К. Антиоксидант тимохинон снижает гибель культивированных зернистых нейронов мозжечка, вызванную совместным действием Сu2+ и параквата. In Фундаментальные и прикладные проблемы нейронаук: функциональная асимметрия, нейропластичность нейродегенерация Материалы Второй Всероссийской конференции с международным участием Под редакцией М. А. Пирадова, С. Н. Иллариошкина и В. Ф. Фокина Москва (2016), vol. 10 of В, ДекАрт Москва, pp. 713–718.
- Стельмашук, Е. В., Генрихс, Е. Е., Капкаева, М. Р., Зеленова, Е. А., Исаев, Н. К. N-АЦЕТИЛЦИСТЕИН В ПРИСУТСТВИИ cu2+ ВЫЗЫВАЕТ ОКИСЛИТЕЛЬНЫЙ СТРЕСС И ГИБЕЛЬ ЗЕРНИСТЫХ НЕЙРОНОВ В ДИССОЦИИРОВАННЫХ КУЛЬТУРАХ МОЗЖЕЧКА КРЫС. Биохимия 82, 10 (2017), 1530–1537.
- Стельмашук, Е. В., Ивашкин, Е. Г., Генрихс, Е. Е., Зеленова, Е. А., Хаспеков, Л. Г., and Исаев, Н. К. Механизм защиты 5-(n-этил-n-изопропил) амилоридом культивированных зернистых нейронов мозжечка от цинк/каинатной токсичности. Фундаментальные проблемы нейронаук. Функциональная асимметрия. Нейропластичность. Нейродегенерация (2014), Научный мир МОСКВА, pp. 827–831.