Навыки работы в мокрой биологии, презентация результатов работы на научных конференциях, доклады, подготовка публикаций, иллюстрирование, написание обзоров, коммуникативные навыки, организация коммуникации между разными группами исследователей внутри проекта

Публикации:
Общее число статей в научных журналах (российские и зарубежные): 10

Статьи (2009-2021):
1. Valouev I.A., Fominov G.V., Sokolova E.E., Smirnov V.N., Ter-Avanesyan M.D. Elongation factor eEF1B modulates functions of the release factors eRF1 and eRF3 and the efficiency of translation termination in yeast. BMC Molecular Biology 2009, 10: 60 https://doi.org/10.1186/1471-2199-10-60 (Impact factor: 2.57)
2. Moshkovskii S.A., Sokolova E.E., Karpova M.A., Pyatnitskiy M.A., Archakov A.I., Brattseva E.V., Kubanova A.A. Proteome and cytokine serum profiling to diagnose a mycosis fungoides. Proteomics: Clinical Applications 2011, 5 (7-8), 432-439. https://doi.org/10.1002/prca.201000165 (Impact factor: 2.489)
3. Feng T, Yamamoto A, Wilkins SE, Sokolova E, Yates LA, Münzel M, Singh P, Hopkinson RJ, Fischer R, Cockman ME, Shelley J, Trudgian DC, Schödel J, McCullagh JS, Ge W, Kessler BM, Gilbert RJ, Frolova LY, Alkalaeva E, Ratcliffe PJ, Schofield CJ, Coleman ML. Optimal Translational Termination Requires C4 Lysyl Hydroxylation of eRF1. Molecular Cell 2014, 53(4):645-54 http://dx.doi.org/10.1016/j.molcel.2013.12.028 (Impact factor: 14.714)
4. Denis Susorov, Tatiana Mikhailova, Alexander Ivanov, Elizaveta Sokolova, and Elena Alkalaeva. Stabilization of eukaryotic ribosomal termination complexes by deacylated tRNA. Nucleic Acids Research 2015, 43(6): 3332–3343 https://doi.org/10.1093/nar/gkv171 (Impact factor: 11.561)
5. Ivanov, A., Mikhailova, T., Eliseev, B., Yeramala, L., Sokolova, E., Susorov, D., Alkalaeva, E. PABP enhances release factor recruitment and stop codon recognition during translation termination. Nucleic Acids Research 2016, 44(16): 7766–7776 https://doi.org/10.1093/nar/gkw635 (Impact factor: 11.561)
6. А.С. Кущенко, Т.В. Михайлова, Е.Е. Соколова, Е.З. Алкалаева. Роль фактора инициации трансляции eIF3j в распознавании 3’-контекста стоп кодонов эукариот. Acta Naturae 2017, 2:42 (Impact factor: 2)
7. Ivanov A., Shuvalova E., Egorova T., Shuvalov A., Sokolova E., Bizyaev N., Shatsky I., Terenin I., Alkalaeva E. PABP-interacting proteins, PAIP1 and PAIP2, affect translation termination. Journal of Biological Chemistry 2019, 294, 8630 - 8639 https://doi.org/10.1074/jbc.RA118.006856 (Impact factor: 4.238)
8. Tatiana Egorova, Elizaveta Sokolova, Ekaterina Shuvalova, Vera Matrosova, Alexey Shuvalov, Elena Alkalaeva. Fluorescent toeprinting to study the dynamics of ribosomal complexes. Methods 2019, 162-163, 54-59. http://dx.doi.org/10.1016/j.ymeth.2019.06.010 (Impact factor: 3.812)
9. Соколова Е.Е., Власов П.К., Егорова Т.В., Шувалов А.В., Алкалаева Е.З. Влияние А/G-состава 3'-контекстов стоп-кодонов на терминацию трансляции у эукариот. Молекулярная биология 2020, 54, 5, 837 – 848 https://doi.org/10.31857/S0026898420050080 (Impact factor: 1.023)
10. Elizaveta Sokolova, Tatiana Egorova, Alexey Shuvalov, Elena Alkalaeva. Eukaryotic ribosome recognizes 3′ context and stimulates stop codon readthrough. Preprint, 2021. https://doi.org/10.1101/2021.04.18.440353

Руководство/участие в научных проектах:

Грант РНФ (2019-2021 гг.) 19-74-10078 «Роль 3'-НТО мРНК в терминации трансляции эукариот» (исполнитель)
Грант РНФ (2019-2021 гг.) 19-14-00349 «Реконструкция мультифакторного комплекса терминации трансляции человека» (исполнитель)
Грант РНФ (2014-2018 гг.) 14-14-00487 «Стабилизация конформации рибосомных комплексов для обеспечения эффективной терминации трнасляции эукариот» (исполнитель)
Грант РФФИ (2016-2017 гг.) 16-34-00494 «Роль фактора eIF3 и его субъединиц в распознавании 3'- контекста стоп кодонов эукариот» (руководитель)
Грант РФФИ (2015-2017 гг.) 15-04-08174 «Молекулярный механизим активации трансляции эукариот полиА-связывающим белком PABP» (исполнитель)

Участие в конференциях и симпозиумах:

The 38th FEBS Congress. Saint Petersburg, Russia, 6–11 July 2013
Постерное сообщение: Role of the stop codon context in eukaryotic translation termination E. Sokolova and E. Alkalaeva

EMBO Conference Series: Protein Synthesis and Translational Control EMBL Advanced Training Centre. Heidelberg, Germany, 08 - 12 September 2013
Постерное сообщение: The influence of stop codon 3’-context on competition between termination factors and supressor tRNAs Elizaveta Sokolova, Boris Eliseev, Peter Vlasov, Elena Alkalaeva

EMBO Workshop Recoding: Reprogramming genetic decoding. Killarney, Ireland, 13 – 18 May 2014
Постерное сообщение: mRNA context dependent changes of release factors activity in eukaryotes Elizaveta Sokolova, Tatyana Mikhaylova, Denis Susorov, Alexander Ivanov, Elena Alkalaeva

VI Съезд биохимиков Росси, Сочи, Дагомыс, октябрь 2017
Постерное сообщение: Роль фактора инициации трансляции eIF3j в распознавании 3’-контекста стоп кодонов эукариот А.С. Кущенко, Т.В. Михайлова, Е.Е. Соколова, Е.З. Алкалаева

EMBO Conference Series: Protein Synthesis and Translational Control EMBL Advanced Training Centre. Heidelberg, Germany, 06 – 09 September 2017
Постерное сообщение: Modulation of translation termination in eukaryotes: an interplay of stop codon context and eIF3 Elizaveta Sokolova, Tatiana Mikhailova, Artyom Kushenko, Elena Alkalaeva

The 43rd FEBS Congress. Prague, Chech, 7–12 July 2018
Постерное сообщение: Eukaryotic ribosome discriminates 3’ context and determines efficiency of stop codon readthrough E. Sokolova, T. Egorova, A. Schuvalov, E. Alkalaeva

Postgenome. Kazan, Russia, October 29 – November 02, 2018
Устный доклад: Механизм влияния 3’ контекстов стоп кодонов на сквозное прочтение у эукариот Е.Е. Соколова, Т.В. Егорова, А.В. Шувалов, Е.З. Алкалаева

VII Съезд ВОГиС. Санкт-Петербург, Россия, 18-22 июня 2019
Постерное сообщение: Новые факторы, модулирующие эффект контекста стоп кодона на терминацию трансляции у эукариот. Е. Соколова, А. Шувалов, Т. Егорова, И. Торопыгин, Е. Алкалаева.