За последние 5 лет мною проведено широкомасштабное исследование способности около 150 штаммов лактобацилл и бифидобактерий различных видов синтезировать ГАМК in vitro. Подробное исследование других аспектов синтеза ГАМК бактериями кишечной микробиоты, что включало в себе изучение синтеза ГАМК в динамике, изучение оперонной организации генов синтеза ГАМК у основных видов лактобацилл и бифидобактерий, изучение экспрессии этих генов в различных условиях и изучение наличия генов синтеза ГАМК у основных родов кишечной микробиоты, позволило опубликовать фундаментальную статью в 2016 году, которая, на сегодняшний день была процитирована130 раз (Yunes et al., 2016).
В 2017 году опубликовали работу по разработанному методу мультилокусного секвенирования, основанного на определении полиморфизма в выбранных генах домашнего хозяйства (Poluektova et al., 2017).
Участвовал в разработке препарата, основанного на штаммах лактобацилл и бифидобактерий с изученными свойствами, для лечения депрессивных расстройств. В 2019 году была опубликована статья, в которой показан эффект разработанного штамма на грызунах (Yunes et al., 2019).
За последние три года, участвовал в разработке метода для анализа состава микробиома кишечника на основе систем токсин-антитоксин (Klimina et al., 2020) а также анализировали микробиоту кишечника крыс, подвергших десинхронозу (Klimina et al., 2019). За последние два года участвовал в написании двух обзоров: один, посвящённых бактериальным метаболитам коррелирующими с депрессивными расстройствами (Averina et al., 2020), и другой посвящённый бактериальным генам, по которым можно отбирать психобиотики (Poluektova et al., 2021). Также написали вместе с Незаметдиновой В.З. обзорную статью, в котором просуммирвали наши результаты серии экспериментов, посвящённых PFNA оперону у бифидобактерий (Nezametdinova et al., 2021).
В заключение, за последние 5 лет, я писал и участвовал в написании десяти статьей, которые были опубликованы в рейтинговых международных индексированных журналах; участвовал в более чем десяти конференциях в России и за рубежом в т.ч. на международных конгрессах в Венгрии, Ирландии и Марокко, на которых докладывали результаты наших исследований; являюсь соавтором двух патентов на разработанные штаммы.

Список публикаций

• Nezametdinova, V. Z., Yunes, R. A., Dukhinova, M. S., Alekseeva, M. G., & Danilenko, V. N. (2021). The Role of the PFNA Operon of Bifidobacteria in the Recognition of Host’s Immune Signals: Prospects for the Use of the FN3 Protein in the Treatment of COVID-19. International Journal of Molecular Sciences, 22(17), 9219. Q=1 , IF=5.9
• Poluektova, E., Yunes, R., & Danilenko, V. (2021). The Putative Antidepressant Mechanisms of Probiotic Bacteria: Relevant Genes and Proteins. Nutrients, 13(5), 1591. Q=1 , IF=4.5
• Averina, O. V., Zorkina, Y. A., Yunes, R. A., Kovtun, A. S., Ushakova, V. M., Morozova, A. Y., ... & Chekhonin, V. P. (2020). Bacterial metabolites of human gut microbiota correlating with depression. International Journal of Molecular Sciences, 21(23), 9234 Q=1 , IF=4.5
• Klimina, K. M., Voroshilova, V. N., Poluektova, E. U., Veselovsky, V. A., Yunes, R. A., Kovtun, A. S., ... & Danilenko, V. N. (2020). Toxin-Antitoxin Systems: A Tool for Taxonomic Analysis of Human Intestinal Microbiota. Toxins, 12(6), 388. Q=1 , IF=4
• Shur, K. V., Zakharevich, N. V., Akimova, N. I., Yunes, R. A., Frolova, S. G., Maslov, D. A., & Danilenko, V. N. (2019). Draft Genome Sequences of Mycobacterium tuberculosis Clinical Isolates from the Ural Region of Russia That Carry the pks15/1 Gene. Microbiology Resource Announcements, 8(49). Q=1 , IF=0.88
• Yunes, R.A., Poluektova, E.U., Vasileva, E.V., Odorskaya, M.V., Marsova, M.V., Kovalev, G.I. & Danilenko, V. N. (2019). A Multi-strain Potential Probiotic Formulation of GABA-Producing Lactobacillus plantarum 90sk and Bifidobacterium adolescentis 150 with Antidepressant Effects. Probiotics & Antimicro. Prot., (), 1-7. Q= , IF=
• Klimina, K. M., Batotsyrenova, E. G., Yunes, R. A., Gilyaeva, E. H., Poluektova, E. U., Kostrova, T. A., ... & Ivanov, M. B. (2019). The effects of desynchronosis on the gut microbiota composition and physiological parameters of rats. BMC microbiology, 19(1), 160. Q=3 , IF=4
• Poluektova, E. U., Yunes, R. A., Epiphanova, M. V., Orlova, V. S., & Danilenko, V. N. (2017). The Lactobacillus rhamnosus and Lactobacillus fermentum strains from human biotopes characterized with MLST and toxin-antitoxin gene polymorphism. Archives of microbiology, 199(5), 683-690. Q=3 , IF=1.88
• Yunes, R. A., Poluektova, E. U., Dyachkova, M. S., Klimina, K. M., Kovtun, A. S., Averina, O. V., ... & Danilenko, V. N. (2016). GABA production and structure of gadB/gadC genes in Lactobacillus and Bifidobacterium strains from human microbiota. Anaerobe, 42, 197-204. Q=2 , IF=2.7

Выступления на конференциях

• Yunes R.A., PFNA Operon of Bifidobacteria: Role in Adaptation to the Host, 2nd international conference on immunology and vaccines, Онлайн, 6-7 августа 2021.
• Yunes R.A., the PFNA Operon of Bifidobacteria and its Role in Adaptation to the Host Immune System, INTERNATIONAL HUMAN MICROBIOME CONSORTIUM CONGRESS 2021, г. Барселона, Испания, 27-29 июня 2021.
• Yunes A., Role of PFNA Operon of Bifidobacteria in Species-specific Adaptation to Host's Immune System, INTERNATIONAL CONFERENCE ON BENEFICIAL MICROBES, г. Ростов-на-Дону, 1-6 июня 2021.
• Yunes, R.A. et al. The antidepressant effect of GABA producing lactobacilli and bifidobacteria. Oral presentation delivered at the 7th Mediterranean Neuroscience Conference in Marrakesh, Morocco, 23th-27th june 2019.
• Yunes, R.A. et al. Selection of psychobiotics among Lactobacillus and Bifidobacterium strains isolated from the human gut. Poster presentation at the International Human Microbiome Consortium in Killarney, Ireland, 26th-28th june 2018.
• Yunes, R.A. et al. Development of psychobiotics to treat depression in patients with type 2 diabetes. Oral presentation delivered at the 10th International Scientific Conference in Minsk, Belarus, 7th june 2017.
• Yunes, R.A. et al. Development of psychobiotics for the treatment of depression and anxiety. Oral presentation at the Russian-Chinese scientific conference on medical microbiology and clinical mycology 14-16 june 2016.
• Yunes, R.A. et al. Gamma-Aminobutyric Acid Producing Lactobacillus and Bifidobacterium strains Isolated From the Human Body – candidates for Future Psychobiotics. Oral presentation delivered at the International Scientific Conference Probiotics And Prebiotics in Budapest, Hungary, 23th-25th june 2015.