Александр Ш.

Я начинающий биоинформатик и проектировщик тест систем

Я ищу работу молекулярного биолога и биоинформатика с обучением. Моя мечта - работа по разработке тестов при помощи ПЦР (PCR, qPCR и ddPCR) и секвенирования на NGS.  

 

Последнее обновление резюме 17.12.2021
Адрес Пущино, Russian Federation
Электронная почта Заблокировано
Телефон Заблокировано
Соцсеть или сайт Заблокировано

Опыт

BIOMARKER-RU LLC
Молекулярный биолог
Мар 2021 - Янв 2022
Мои обязанности:
• Разработка молекулярных методов диагностики рака молочной железы. Для диагностики используется ПЦР в реальном времени, капельное цифровое ПЦР и ДНК-белковые взаимодействия.
• практические навыки электрофореза нуклеиновых кислот (в агарозном геле) и белков (в полиакриламидном геле);
• гель-док электрофореза для нуклеиновых кислот и белков;
• Выделение белков при помощи Magnetic Beads
• Создание протоколов методов
• Организационный обязанности: инвентаризация, поиск и закупка необходимых реактивов и оборудования. Организация рабочего места, отладка и калибровка приборов (ПЦР). Проверка договоров между моей компанией и другими организациями. Организация собраний и экспериментов. Написание отчётов.
ИТЭБ РАН
Старший лаборант-исследователь с высшим образованием
Окт 2020 - Сен 2024
Я нахожусь на 1/10 ставки. Мои обязанности те же самые, что и для аспирантуры: уход за лабораторными мышами. Обработка научных данных конфокальной микроскопии.
ГБС РАН
Младший научный сотрудник
Дек 2019 - Ноя 2020
Мои обязанности: Описание морфологический признаков сортов яблони. Корреляционный и факторный анализ между морфологическими и биохимическими признаками яблони.
СИФИБР СО РАН
Младший научный сотрудник
Сен 2018 - Сен 2019
я вместе с должностью ведущего инженера совмещал полставки младшего научного сотрудника (биохимик и физиолог растений) в СИФИБР СО РАН. Мои обязанности: Мои обязанности:
• извлечение флавоноидов из растений и их идентификация с помощью газовой и высокоэффективной жидкостной хроматографии;
• извлечение липоксигеназы из Tríticum aestívum;
• определение активности липоксигеназы Tríticum aestívum;
• извлечение и идентификация хлорофиллов и других пигментов;
• определение характеристик дыхания и фотосинтеза растений по GFS-3000;
• экстракция и идентификация аскорбатпероксидазы, дегидроаскорбатредуктазы и глутатионредуктазы;
• анализ углеводов яблок;
• идентификация по аскорбиновой кислоте и общей кислотности;
• строительство камер выращивания растений со светодиодными лампами;
• посадка, сбор и уход за растениями;
• сопоставление, управление, анализ и представление данных испытаний;
• победа и участие в гранте "умник"
* Плюс анализ статьей и написание диссертации.
СИФИБР СО РАН
Ведущий инженер
Ноя 2012 - Июл 2020
Мои обязанности:
• извлечение флавоноидов из растений и их идентификация с помощью газовой и высокоэффективной жидкостной хроматографии;
• извлечение липоксигеназы из Tríticum aestívum;
• определение активности липоксигеназы Tríticum aestívum;
• извлечение и идентификация хлорофиллов и других пигментов;
• определение характеристик дыхания и фотосинтеза растений по GFS-3000;
• экстракция и идентификация аскорбатпероксидазы, дегидроаскорбатредуктазы и глутатионредуктазы;
• анализ углеводов яблок;
• идентификация по аскорбиновой кислоте и общей кислотности;
• строительство камер выращивания растений со светодиодными лампами;
• посадка, сбор и уход за растениями;
• сопоставление, управление, анализ и представление данных испытаний;
• победа и участие в гранте "умник"

Образование

Иркутский государственный университет
Специальность биолог
Сен 2008 - Июн 2013
Специальность "биолог", но по списку прослушанных предметов моя специальность больше подходит под специальность молекулярный биолог согласно новым стандартам.

В чем вы сильны?

Мои сильные стороны - это поиск и принятие нестандартных решений для стоящих перед мной проблем. Стремление к автономии и созданию дружной среды (людей) вокруг меня. Свободное владение английским языком и любовь к его изучению.

Расскажите о себе что-нибудь еще: публикации, конференции, хобби

Список публикаций:

Rudikovskaya Е.G., Dudareva L.V., Shishparenok А.А., Osipova S.V., Stavitskaya Z.O., Rudikovskii А.V. (2019) Peculiarities of the accumulation of photoprotective compounds by fruit of the Siberian crabapple, Malus domestica Borkh. and their hybrids growing in conditions of Eastern Siberia. Scientia Horticulturae, 253, 303-308.

DOI: 10.1016/j.scienta.2019.04.034

Permyakova M. D., Permyakov A. V., Osipova S. V., Pshenichnikova T. A., Shishparenok A. A., Rudikovskaya E. G., Rudikovsky A. V., Verkhoturov V. V., Börner A. (2017) Chromosome regions associated with the activity of lipoxygenase in the genome D of Triticum aestivum L. under water deficit. Russian Journal of Plant Physiology, 64(1), 28-40.

DOI: 10.1134/S1021443717010113

Osipova S., Permyakov A., Permyakova M., Pshenichnikova T., Verkhoturov V., Rudikovsky A., Rudikovskaya E., Shishparenok A., Doroshkov A., Börner A. (2016) Regions of the bread wheat D genome associated with variation in key photosynthesis traits and shoot biomass under both well watered and water deficient conditions. J Appl Genetics, 57, 151–163.

DOI 10.1007/s13353-015-0315-4

Rudikovskaya E. G., Dudareva L.V., Shishparenok A. A., Rudikovskii A. V. (2015) Peculiarities of polyphenolic profile of fruits of the Siberian crab apple and its hybrids with Malus Domestica Borkh. Acta Physiol Plant, 37, 238.

DOI 10.1007/s11738-015-1993-6

Rudikovskaya E. G., Dudareva L. V., Shishparenok A. A., Mitanova N. B., Petrova I. G., Rudikovskii A. V. (2014) PHENOLIC COMPOSITION OF Malus baccata FRUIT. Chemistry of Natural Compounds, 50(4), 739-740.

DOI: 10.1007/s10600-014-1069-7

Stolbikova A.V., Shishparenok A.A., Rudikovsky A.V., Rudikovskaya E.G., Dudareva L.V. (2018) Possible participation of gibberellins in the formation of dwarf forms of the Siberian apple tree Malusbaccata (L.) Borkh. in the conditions of forest-steppe ecotone. Siberian Forest Journal, 1, 59–64. (Столбикова А. В., Шишпаренок А. А., Рудиковский А. В., Рудиковская Е. Г., Дударева Л. В. (2018) Возможное участие гиббереллинов в образовании карликовых форм яблони сибирской Malusbaccata (L.) Borkh. в условиях лесостепного экотона. Сибирский лесной журнал. - 2018. - № 1. - С. 59–64.)

DOI: 10.15372 / SJFS20180106

Osipova S.V., Permyakov A.V., Permyakova M.D., Rudikovsky A.V., Rudikovskaya E.G., Shishparenok A.A., Doroshkov A.V., Börner A. (2016) QTL analysis of the response to water deficit in D-genome introgression lines of bread wheat. Eur Cereals Genet Co-op Newslet, 26-34.

 Permyakova M.D., Permyakov A.V., Osipova S.V., Shishparenok A.A., Rudikovskaya E.G. (2016) Chromosomal regions in genome D of Triticum aestivum L. associated with the activity of different lipoxygenase forms under drought. Eur Cereals Genet Co-op Newslet, 140-144.

Börner A., Agacka-Mołdoch M., Batalova G.I., Cárdenas D.R., Castellanos T., Castro A.M., Chesnokov Yu.V., Dell A.M., Diaz de Leon J.L., Doroshkov A.V., Gerard G.S., Gimenez D., Kouria P., Ling J., Lohwasser U., Lori G., Muqaddasi Q.H., Nagel M., Osipova S.V., Perello L., Permyakov A.V., Permyakova M.D., Pinto F., Pshenichnikova T.A., Qualset C.O., Rehman Arif M.A., Ricci M.E., Röder M.S., Rojas-Hernandez A., Rudikovskaya E.G., Rudikovsky A.V., Shishparenok , Simón M.R., Verchoturov V.V., Zanke Chr., Zaynali Nezhad K. (2016) Items from Germany. Annual Wheat Newsletter, 62, 5-11.

 Khasnatinov M.A., Danchinova G.A., Koverzina A.S., Shishparyonok A.A., Lyapunov A.V., Shulunov S.S., Abmed D., Bata J., Tserennorov D., Otgonbaator D. (2011) Characterization of the rickettsia of the Baikal region and Mongolia based on the analysis of genome fragments. National priorities of Russia, 2(5), 157. (Хаснатинов М.А., Данчинова Г.А., Коверзина А.С., Шишпарёнок А.А., Ляпунов А.В., Шулунов С.С., Абмэд Д., Бата Ж., Цэрэнноров Д., Отгонбаатор Д. (2011) Характеристика риккетсий Прибайкалья и Монголии на основе анализа фрагментов генома. Национальные приоритеты России, 2(5), 157.)

https://cyberleninka.ru/article/n/harakteristika-rikketsiy-pribaykalya-i-mongolii-na-osnove-analiza-fragmentov-genoma

Список конференций:

Shishparenok A.A., Rudikovskaya E.G., Dudareva L.V., Kustov V.A., Rudikovsky A.V. Features of the accumulation of sugars in the fruits of various species of Malus grown in the conditions of the city of Irkutsk (Southern Baikal). Proceedings of the fourth all-Russian conference of young scientists with international participation named “Biodiversity: Global and Regional Processes” (June 23–27, 2016), Ulan-Ude, pp. 223-224. (Шишпаренок А.А., Рудиковская Е.Г., Дударева Л.В., Кустов В.А., Рудиковский А.В. Особенности накопления сахаров в плодах разных видов Malus, выращенных в условиях г. Иркутска (Южного Прибайкалья). Материалы IV Всероссийской конференции молодых ученых с международным участием «Биоразнообразие: глобальные и региональные процессы» (23–27 июня 2016 г.), Улан-Удэ, С. 223-224.)

 Shishparenok A.A. CONTENT OF ASCORBIC ACID IN APPLE FRUITS OF THE SIBERIAN CRABAPPLE, THE DOMESTIC APPLE AND THEIR HYBRIDS GROWN IN SIBERIAN CONDITIONS. All-Russian scientific conference with international participation named “Modern aspects of structural and functional plant biology: from molecules to ecosystems” September 28-30, 2017. Oryol (Shishparenok A.A. CONTENT OF ASCORBIC ACID IN APPLE FRUITS OF THE SIBERIAN CRABAPPLE, THE DOMESTIC APPLE AND THEIR HYBRIDS GROWN IN SIBERIAN  CONDITIONS. Всероссийская  научная конференция c международным участием. «Современные аспекты структурно-ункциональной биологии растений: от молекул до экосистем» 28-30 сентября 2017 года. г.Орел.)

Stolbikova A. V., Rudikovsky A. V., Shishparenok A. A., Rudikovskaya E. G., Dudareva L. V. Physiological and biochemical aspects of the formation of dwarfism of Malus baccata (L.) Borkh. in the forest-steppe ecotone. Problems of Studying and Preserving the Flora of Eurasia: Materials of the second all-Russian conference with the participation of foreign scientists, dedicated to the memory of L.V. Bardunov (1932–2008), Doctor of Biological Sciences, Professor, and Honored Scientist of the Russian Federation (Irkutsk, Kyren, September 11–15, 2017). - Irkutsk: Publishing House of the Institute of Geography. V. B. Sochava SB RAS, 2017. - S. 207–211.

 Rudikovskaya E.G., Shishparenok A.A., Rudikovskii A.V., Osipova S.V., Dudareva L.V. Particularities of the accumulation of phenolic compounds and ascorbic acid in the fruit of the Siberian crabapple and its hybrids with Malus domestica L. Abstract Book.1st International Apple Symposium. Yangling, Shaanxi, China. October 10-16, 2016. P. 65.

Permyakova M.D., Permyakov A.V., Osipova S.V., Pshenichnikova T.A., Shishparenok A.A., Rudikovskaya E.V., Rudikovsky A.V., Verkhoturov V.V., Berner A. Genetic regulation of the activity of various forms of wheat lipoxygenase in water deficiency. Materials of the all-Russian scientific conference with international participation named “Factors of plant and microorganism resistance in extreme natural conditions and anthropogenic environment” (September 12-15, 2016), Irkutsk, pp. 248-249. (Пермякова М.Д., Пермяков А.В., Осипова С.В., Пшеничникова Т.А., Шишпаренок А.А., Рудиковская Е.В., Рудиковский А.В., Верхотуров В.В., Бернер А. Генетическая регуляция активности разных форм липоксигеназы пшеницы при водном дефиците. Мат-лы Всероссийской научной конференции с международным участием “Факторы устойчивости растений и микроорганизмов в экстремальных природных условиях и техногенной среде“ (12-15 сентября 2016 г), Иркутск, С. 248-249.)

Osipova S. V., Permyakov A. V., Permyakova M. D., Pshenichnikova T. A., Verkhoturov V. V., Rudikovsky A. V., Rudikovskaya E. G., Shishparenok A. A., Doroshkov A. V., Börner A. QTL analysis of the response to water deficit in D-genome introgression lines of bread wheat. EWAC 2015 : Book of Abstracts of the International Conference (Lublin, Poland, 24–29 May 2015). – P. 5.

Permyakova M.D., Permyakov A.V., Osipova S.V., Shishparenok A.A., Rudikovskaya E.G., Verkhoturov V.V., Pshenichnikova T.A., Börner A., Lohwasser U. The genetic mapping of QTLs associated with the activity of different lipoxygenase form in genome D of Triticum aestivum under drought. EWAC 2015 : Book of Abstracts of the International Conference (Lublin, Poland, May 24–29, 2015). – P. 45.

Мои хобби: 

Я в свободное время изучаю английский язык и выращиваю лабораторных мышей.