Нина Ш.

биоинформатик, интерпретатор данных NGS

Работу с полной или частичной занятостью, стажировку.

Последнее обновление резюме 13.11.2025
Адрес Новосибирск, Russian Federation
Электронная почта Заблокировано
Телефон Заблокировано
Соцсеть или сайт Заблокировано
Согласие на обработку данных Я подтверждаю, что ознакомлен(а) и даю свое согласие на обработку и передачу моих персональных данных в соответствии с <a href="https://drive.google.com/file/d/12zJUA7g0y1JCem41g5dtUCiwv0H9NbjL/view?usp=sharing">Политикой в области обработки и обеспечения безопасности персональных данных</a> и настоящим <a href="https://drive.google.com/file/d/1JtzC6jo4YwG8lUk2uH3VQQvTGmM9pGQC/view?usp=sharing">Согласием на передачу персональных данных</a>

Опыт

Digital Genomics
Интерпретатор данных NGS
Июн 2024 - Окт 2025
Анализ данных полноэкзомного и полногеномного секвенирования ДНК, поиск причин наследственных заболеваний у пациентов (в форматах моно, дуо и трио), скрининг на носительство патогенных и вероятно патогенных вариантов. Классификация вариантов согласно критериям ACMG, использование баз данных (Gnomad, Clinvar, Decipher, Omim, Ensebml, HPO, GTEx Portal и др.), чтение научной литературы на английском языке, подготовка аналитических отчётов (заключений) по результатам проведенного анализа
Институт цитологии и генетики Сибирского отделения Российской академии наук
Младший научный сотрудник
Июн 2023 - Июл 2024
Лаборатория молекулярной генетики человека. Постановка ПЦР, секвенирование по Сэнгеру, интерпретация данных секвенирования (поиск патогенных вариантов). Рестрикционный анализ. Исследование микроРНК, ассоциированных с нарушением липидного обмена, в жировой ткани пациентов (выделение микроРНК, ОТ-ПЦР, количественная ПЦР). Написание научных статей
MyGenetics
Клинический биоинформатик
Май 2023 - Май 2025
Анализ данных NGS (разработка биоинформатического пайплайна для таргетных панелей и полногеномного секвенирования, интерпретация данных), разработка панелей для генетического тестирования (поиск, аннотация генов и вариантов), статистическая обработка данных, составление баз данных для продуктов компании, тестирование продуктов, написание технических заданий
Digital Genomics
Интерпретатор данных NGS
Авг 2022 - Мар 2023
Анализ данных полноэкзомного/полногеномного секвенирования ДНК, поиск причин наследственных заболеваний у пациентов, классификация вариантов согласно критериям ACMG, использование баз данных (Gnomad, Clinvar, Decipher, Omim, Ensebml, HPO, GTEx Portal и др.), чтение научной литературы на английском языке, подготовка заключений по результатам проведенного анализа
Институт молекулярной биологии им. В.А. Энгельгардта РАН
Младший научный сотрудник
Окт 2021 - Авг 2022
Лаборатория пролиферации клеток. Работа с клеточными культурами и вирусами in vitro (приготовление сред, пассаж клеток, заморозка и разморозка клеток, MTT-тест, титрование вирусов на разных типах клеток), иммуноферментный анализ, выделение РНК, метод проточной цитометрии. Чтение и написание научных статей. Область исследования - онкология, вирусология, иммунология (онколитические вирусы, глиобластома, рак молочной железы).
International Federation of Medical Students Associations
Помощник врача
Авг 2021 - Сен 2021
Стажировка в Греции в качестве помощника врача по обмену для студентов-медиков: ежедневное посещение пациентов отделения вместе с наставником, опрос пациентов и их семей с целью получения информации о состоянии их здоровья и истории болезни, диагностика заболеваний, интерпретация результатов анализов, выполнение лечебных процедур, а также наблюдение и ассистирование во время операций
Институт цитологии и генетики СО РАН
Лаборант-исследователь
Сен 2019 - Июн 2021
Выделение ДНК, дизайн праймеров, ПЦР, рестрикционный анализ, аннотация данных NGS, электрофорез, статистический анализ, анализ литературных данных, написание научных статей

Образование

Новосибирский национальный исследовательский государственный университет (НГУ)
Лечебное дело
Сен 2015 - Июн 2021
Институт медицины и психологии В. Зельмана, Лечебное дело.
Специальность: Врач-лечебник

В чем вы сильны?

  • Интерпретация данных секвенирования ДНК (WGS, WES), поиск причин наследственных заболеваний;
  • Анализ литературы на английском и русском языках. Профильные области: генетика, медицина, молекулярная биология;
  • Работа с базами данных (Gnomad, Clinvar, Decipher, Omim,
    Ensebml, HPO, GTEx Portal и др.);
  • Биоинформатическая обработка данных NGS (таргетных панелей, WGS) с использованием Bash, Python, R;
  • Разработка панелей для генетического тестирования;
  • Статистическая обработка данных;
  • Написание научных статей.

Расскажите о себе что-нибудь еще: публикации, конференции, хобби

Соавтор статей, опубликованных в журналах из перечня ВАК:

  • С.В. Михайлова, Д.Е. Иванощук, Н.С. Широкова, Е.В. Шахтшнейдер. Полиморфизм гена APOA5 у пациентов с первичной гиперлипидемией. Комплексные проблемы сердечно-сосудистых заболеваний. 2020 Т. 9, №2, C. 38-44. DOI: 10.17802/2306-1278-2020-9-2-38-44.
  • Широкова Н.С., Михайлова С.В., Иванощук Д.Е., Шахтшнейдер Е.В. Гены аполипопротеинов APOA5 и APOH как регуляторы метаболизма липопротеинов. Атеросклероз. №3 С. 53-60. DOI: 10.15372/ATER20200307.
  • Михайлова С.В., Иванощук Д.Е., Широкова Н.С., Орлов П.С., Бейркдар А., Шахтшнейдер Е.В. Анализ ассоциации вариантов генов аполипопротеинов APOA2, APOA5 и APOH с гиперлипидемией. Атеросклероз. 2023. Т. 19. №1. С. 6-18. DOI: 52727/2078-256X-2023-19-1-6-18.
  • Бейркдар А., Иванощук Д. Е., Тузовская О. В., Широкова Н. С., Каштанова Е. В., Полонская Я. В., Рагино Ю. И., Шахтшнейдер Е. В. Expression analysis of microRNA and lncRNA in visceral adipose tissue of obese and non-obese individuals. Vavilovskii zhurnal genetiki i selektsii. 2025. Т. 29 №3, С. 448–457. DOI: 10.18699/vjgb-25-48
  • Колесникова И.С., Широкова Н.С., Кушнаренко В.С., Пантелеева Н.В., Мамчиц А.А., Межевалова А.С., Полуновский В.В. Оценка частот генетического варианта LCT rs4988235 (-13910 C > T), связанного с непереносимостью лактозы, в Российской Федерации. Анализ риска здоровью. 2024. №4, С. 135-144. DOI: 10.21668/health.risk/2024.4.12