Антон Э.
Медицинский биоинформатикИщу работу на полный день или с частичной занятостью, удаленную работу. Желательна релокация в Москву.
| Последнее обновление резюме | 22.05.2022 |
| Адрес | Симферополь, Russian Federation |
| Электронная почта | Заблокировано |
| Телефон | Заблокировано |
Опыт
Военный Инновационный Технополис «ЭРА»
Старший оператор
Старший оператор
Июл 2021
- Текущий
-Разработка алгоритма анализа данных полноэкзомного секвенирования для определения HLA-генотипа в высоком разрешении;
-Разработка клеточного продукта для терапии острой лучевой болезни
-Разработка клеточного продукта для терапии острой лучевой болезни
Образование
Российский национальный исследовательский медицинский университет им. Н.И. Пирогова
Медико-биологический факультет, Медицинская биоинформатика (магистр)
Медико-биологический факультет, Медицинская биоинформатика (магистр)
Сен 2020
- Июл 2021
Медицинская академия имени С.И. Георгиевского ФГАОУ ВО «КФУ им. В.И. Вернадского»
Лечебное дело
Лечебное дело
Сен 2012
- Июл 2020
В чем вы сильны?
- Медицинская интерпретация генетических вариантов согласно международным рекомендациям ACMG/AMP
- Работа с медико-биологическими базами данных (gnomAD, OMIM, ClinGen, Decipher, Cosmic, PharmGKB)
- Работа с командной строкой (Bash)
- Разработка алгоритмов анализа DNA- и RNA-Seq данных
- Анализ данных NGS (GATK4, FastQC, Trimmomatic, BWA, picard, DeepVariant, ENSEMBL-VEP, ANNOVAR)
- Визуализация и анализ выравнивания (MEGA, JalView, BLAST)
- Определение HLA-генотипа в высоком разрешении на основании SNP array, WES и WGS данных (с использованием коротких и длинных ридов)
- Поиск опухоль-ассоциированных HLA-аллелей и определение потери гетерозиготности (HLA LOH)
- Определение предрасположенности к аутоиммунным заболеваниям и фармакокинетики лекарственных препаратов на основании HLA-генотипа
- Программирование R (анализ и визуализация данных)
- Проведение филогенетического анализа
- Составление пайплайнов на Bash/WDL
- Знаком с принципами работы секвенаторов
- Свободное чтение профессиональной литературы на английском.
Расскажите о себе что-нибудь еще: публикации, конференции, хобби
- Свидетельство о государственной регистрации программы для ЭВМ № 2022610812 Российская Федерация. HLA-test : № 2021682125 : заявл. 28.12.2021 : опубл. 17.01.2022 / А. А. Эсибов, И. В. Маркин, О. В. Калюжная [и др.] ; заявитель Федеральное государственное автономное учреждение «Военный инновационный технополис «ЭРА». – EDN ZKEVGB. Elibrary: https://elibrary.ru/item.asp?id=47785073
- Принята на публикацию статья: "Современные клеточные продукты для лечения костномозговой формы острой лучевой болезни" в журнал "Радиационная биология"
- Принята на публикацию статья: "Методы HLA-генотипирования в клинической диагностике: от антител к нанопорам" в журнал "Генетика"