Анастасия Б.
Разработчик Python, начинающий биоинформатикРабота на полный день, разработка биоинформатического ПО, возможность сделать научную публикацию или даже защитить кандидатскую на основе моей работы приветствуется.
В целом я хочу погрузиться в область life science, биоинформатики и хемоинформатики.
| Последнее обновление резюме | 23.12.2023 |
| Адрес | Санкт-Петербург, Russian Federation |
| Электронная почта | Заблокировано |
| Телефон | Заблокировано |
Опыт
Инженер
Создание базы данных на PostgreSQL и веб-сервиса на FastApi+Redis с нуля.
Ведущий разработчик
Дизайн базы данных на PostgreSQL и веб-сервиса на FastApi+Redis с нуля. Создание полноценного ETL процесса с помощью Apache Airflow.
Инженер
Разработка микросервисов по поиску научных работников на FastAPI, небольшие задачи, связанные с natural language processing.
Разработчик .NET, Python
• Осень 2016 – написание логики ETL + вебсервиса для портала отображенния генетических данных из разных источников. C#, ASP.NET MVC, Entity Framework, Microsoft SQL.
• 2017-2018 – создание ETL процесса для заполнения химико-фармакололгической БД из >60разных источников. Talend Studio for Data Integration + Java, Virtuoso Triple Store.
• 2019 – миграция существующего ETL процесса на C# с Windows-based платформы на Docker+Linux.
• 2019 – официальный переход в разработку на Python
• 2020 – разработка ETL процесса для базы данных для медиков на KNIME
• 2020 – интеграция между CVAT – Computer Vision Annotation Tool и бесплатным облачным хранилищем Clowder. Python + Django.
Здесь можно посмотреть код – я делала всю backend часть https://github.com/opencv/cvat/issues/3009
• 2021 – помощь в создании NLP алгоритма для обработки финансовых данных.
• 2021 – создание ETL процесса для обработки генетических данных. Python + Apache AirFlow, OrientDB, PostgreSQL.
• 2021-2022 – помощь в разработке data imputation алгоритма для базы данных фармокологических свойств веществ с помощью библиотек Sci Kit Learn и Pytorch.
fullstack программист Microsoft .NET
fullstack программист Microsoft .NET
Образование
Факультет Романо-Германской Филологии
Воронежский Государственный Университет, Факультет Компьютерных Наук
В чем вы сильны?
Я неплохо знаю Python, и могу делать самые разные задачи от веб-разработки до data science. Сейчас самостоятельно подтягиваю знания в области генной инженерии и NGS. Я так же дипломированный технический переводчик и свободно говорю по-английски.
Список технологий, с которыми я работала - ниже:
- Python, NumPy, Pandas, Matplotlib, Seaborn, Streamlit, SK Learn, Pytorch, Django, Flask, SQLAlchemy, Anaconda, Pip, JetBrains PyCharm, Jupyter Notebook
- Git, GitFlow, SourceTree, TortoiseGit
- Docker, Oracle VM VirtualBox
- SQL, Oracle SQL, PostgreSQL, Oracle SQL Developer, DBeaver
- Java, Eclipse, JetBrains IntelliJ IDEA
- C#, Visual Basic .NET, WinForms, ADO.NET, Entity Framework, LINQ, Visual Studio, Visual Studio Code
- Talend Data Integration, Knime
- Virtuoso Triple Store, Protege, RDFS, N-Triples, Open Biomedical Ontologies (OBO), Turtle, RDF/RDFa, SPARQL, Web Ontology Language
- JavaScript, KnockoutJS, AngularJS 1.5, Browser Dev tools, Google Postman
Расскажите о себе что-нибудь еще: публикации, конференции, хобби
В 2018 году я посетила летнюю школу по биоинформатике. Пробовала поступить на годовую программу института биоинформатики, хотя у меня не получилось.
Я так же стремлюсь самостоятельно закрыть пробелы своих знаний в области биоинформатики.
Пройденные курсы и сертификаты:
Big Data и Data Science: перейди на новый уровень https://stepik.org/cert/1612490
Биотехнологии: генная инженерия https://stepik.org/cert/1567563
Введение в Linux https://stepik.org/cert/1605813
Введение в NGS https://stepik.org/cert/1598130
Ликбез по дискретной математике https://stepik.org/cert/295865
Введение в Data Science и машинное обучение https://stepik.org/cert/220874
Молекулярная биология и генетика https://stepik.org/cert/103350
Программирование на Python https://stepik.org/cert/108390