Екатерина М.
биоинформатик и не только| Последнее обновление резюме | 01.08.2022 |
| Адрес | Москва, Russian Federation |
| Электронная почта | Заблокировано |
Опыт
IT-компания «BostonGene»
Младший биоинформатик
Младший биоинформатик
Июл 2021
- Июл 2022
Работала в отделе молекулярного анализа тканей. Отвечала за анализ микробиомной составляющей образцов колоректальной аденокарциномы, поиск связанных бактериальных биомаркеров.
Образование
Московский физико-технический институт (МФТИ)
Бакалавриат
Бакалавриат
Сен 2018
- Июн 2022
Специальность – биотехнология. Базовая кафедра – Кафедра физико-химической биологии и биотехнологии ИБХ РАН. 1ое место в рейтинге по курсу. Защитила диплом на тему «Изучение роли микробиомных сообществ в образцах аденокарциномы толстой кишки и их связь с микроокружением опухоли» на оценку «отлично»
В чем вы сильны?
- В области биоинформатики много работала с языками Python 3, R, Bash; c алгоритмами и структурами данных, методами биостатистики.
- Я проводила анализ данных РНК-секвенирований, WES, WGS; составляла и анализировала генные и мутационные сигнатуры; проводила анализ дифференциальной экспрессии генов.
- В течение года я занималась анализом микробиомных данных, поиском бактериальных биомаркеров с помощью таких пакетов, как LEfSe, phyloseq.
- Библиотеки под рукой: pandas; numpy; matplotlib; scikit-learn; DESeq2; gseapy; fgsea.
- Владею основами языков C++ и JavaScript, применяла Docker.
______________
Имею и опыт работы в "мокрых" лабораториях.
- Имею навыки работы с лабораторной посудой, реактивами и современными приборами. Я проводила титрование, центрифугирование, хроматографию, спектрофотометрический анализ активности ферментов, выделение и очистку белков, ПЦР.
- Занималась дизайном плазмид и плазмидной трансфекцией, рестрикцией.
- Изготавливала и анализировала гистологические срезы (работала на микротоме, микроскопе), окрашивала клетки и ткани.
- Использовала метод флуоресцентной микроскопии (включая конфокальную микроскопию).
- Работала с клеточными культурами, применяла метод проточной цитометрии.
Расскажите о себе что-нибудь еще: публикации, конференции, хобби
Участвовала в 3 конференциях с публикацией тезисов (2020-2022). Заняла второе место в Конкурсе научных работ 64-ой всероссийской конференции МФТИ (ноябрь, 2021).
В 2021-2022 годах участвовала в написании патента о методе анализа микробиомных данных, полученных из данных РНК секвенирования.
Являюсь
- победителем Всероссийской студенческой олимпиады "Я профессионал" по биотехнологии (2021-2022),
- призёром Всероссийской студенческой олимпиады "Я профессионал" по биоинженерии и биоинформатике
Люблю изучать иностранные языки, на данный момент знаю английский на свободном уровне, испанский на продвинутом, японский, французский и португальский на начальном.