Дмитрий Т.
Биоинформатик с опытом работыИнтересные проекты с возможностью карьерного роста. Основное требование - возможность работать из Москвы. Предпочтительно фулл-тайм, но рассматриваю и неполную занятость.
Последнее обновление резюме | 16.09.2022 |
Адрес | Москва, Russian Federation |
Электронная почта | Заблокировано |
Телефон | Заблокировано |
Опыт
Senior Bioinformatican
2) Работа клиническим биоинформатиком, интерпретация результатов молекулярного типирования опухоли.
3) Создание и развитие научно-технической базы и пайплайна для анализа коротких прочтений фрагментов вирусной и бактериальной РНК. Координация команды по развитию модуля, планирование задач.
Образование
Математическая биология, биоинформатика
В чем вы сильны?
1. Развитые профессиональные навыки - использование актуальных научно-технических инструментов в области биоинформатики и машинного обучения:
- Навыки программирования: Python (sklearn, pandas, numpy, xgboost, catboost, keras, tensorflow, scipy, seaborn, matplotlib, plotly и другие), R, bash
- Работа с NGS (контроль качества (MultiQC), работа с данными экспрессий РНК: дифференциальная экспрессия, анализ обогащения по функциональной принадлежности (GSEA). Кластеризация и выделение экспрессионных подтипов, создание прогностических моделей, интерпретация результатов коллинга соматических мутаций, альтераций, вирусов.
- Онкологическая биоинформатика: молекулярное типирование ЖКТ-опухолей; плоскоклеточные раки; глубокое изучение экспрессии онкогенных вирусов.
- Микробиом опухоли и анализ 16S -секвенирования: оценка индексов разнообразия, таксономический состав и связь с опухолевым микроокружением.
- Структурная биоинформатика: молекулярное моделирование, в т.ч. молекулярный докинг, молекулярная динамика, высокопроизводительный скрининг, создание QSAR моделей (пакет программ Schrodinger, Autodock, USCF Chimera, VMD, GROMACS, сервисы SIB), с биологическими базами данных (PDB, KEGG, OMIM, Uniprot, NCBI, PubMed, EMBL, GenBank, Pfam, Drugbank, ChemBL, ZINC и другие)
- Использование вспомогательных средств: docker, git, cwl, aws и тд
2. Гибкость, быстрая адаптация - работал во множестве проектов разной специфики, с полным карьерным треком можно ознакомиться в резюме на hh - https://hh.ru/applicant/resumes/view?resume=c1c0ce23ff06016a2a0039ed1f444a53353561
3. Исполнительность и высокая личная ответственность.
4. Лидерские качества, умение управлять командой, находить компромиссы и рационально распределять задачи.
Расскажите о себе что-нибудь еще: публикации, конференции, хобби
Начинал карьеру как инженер химико-технологического оборудования, в магистратуре увлекся структурной биоинформатикой и молекулярной биологией. Часть публикаций/тематических работ можно найти здесь - https://www.researchgate.net/scientific-contributions/Dmitry-Tychinin-2197529188