Кирилл П.
Опытный биотехнолог и микробиолог, уверенный биоинформатикИщу постоянную работу на полную ставку (предпочтительно, Москва). Также интересны возможности участия в в различных проектах качестве биоинформатика в удалённом формате (возможно, как частичная занятость).
| Последнее обновление резюме | 27.08.2025 |
| Адрес | Пущино, Russian Federation |
| Электронная почта | Заблокировано |
| Телефон | Заблокировано |
| Соцсеть или сайт | Заблокировано |
Опыт
Старший научный сотрудник
Изучение функциональной роли алкан монооксигеназ штамма Rhodococcus qingshengii X5 (нокаут генов, создание экспрессионных векторов, анализ ферментативной активности).
Филогенетический анализ разнообразия алкан монооксигеназ.
Характеристика функциональных профилей бактериальных сообществ пылевых частиц на основе ДНК-баркодирования.
Научный сотрудник
Анализ бактериальных биосурфактантов и оценка их роли в деградации углеводородов.
Разработка подходов для получения микробных консорциумов с высокой деградативной активностью.
Оценка стратегий биоремедиации для ликвидации углеводородных загрязнений.
Реализован ряд прикладных проектов для биотехнологических компаний, включающих анализ образцов почвы и воды, экспертизу биопрепаратов, составление рекомендаций по проведению биоремедиационных мероприятий.
Инженер
Лаборант
Образование
Аспирант
Тема диссертации: «Биологические поверхностно-активные вещества, продуцируемые микроорганизмами-нефтедеструкторами родов Pseudomonas и Rhodococcus».
Разработаны и оптимизированы протоколы для выделения и характеристики бактериальных биосурфактантов, изучены их физико-химические свойства.
Разработаны и валидированы методы полупромышленного получения биомассы штаммов — компонентов биопрепарата «МикроБак» для ремедиации нефтезагрязнённых почв.
Определены оптимальные условия для краткого и длительного хранения биопрепарата.
Значительную часть исследований выполнял в лаборатории биологии плазмид Института биохимии и физиологии микроорганизмов РАН, г. Пущино
Студент
В чем вы сильны?
Лабораторные навыки
- Выделение и культивирование бактерий
- Анализ ферментативной активности
- Тонкослойная и колоночная хроматография
- Выделение НК
- Электрофорез (агарозный, ПААГ)
- ПЦР
- Молекулярное клонирование
Биоинформатические навыки
- Программирование на Python и R
- Визуализация данных (matplotlib, seaborn)
- Работа в командной строке, на удалённом сервере
- Сборка и аннотация бактериальных геномов
- Работа с биологическими базами данных
- Филогенетический анализ
Опыт руководства магистерскими и дипломными работами, патентного поиска и подачи патентов, рецензирования публикаций, подготовки технических заданий и технико-экономических обоснований, организации закупок, публичных выступлений и презентаций.
Выполненные в качестве руководителя гранты
- РНФ, конкурс малых отдельных научных групп, 2023-2024. «Функционирование алкан монооксигеназных систем alkB-типа психротрофного штамма Rhodococcus erythropolis Х5»
- РФФИ, «Мой первый грант», 2016-2017. «Изучение особенностей метаболизма психротрофных микроорганизмов-нефтедеструкторов родов Rhodococcus и Pseudomonas при росте на углеводородных субстратах в условиях низких положительных температур»
- Программа «У.М.Н.И.К.», 2012-2013. «Микробные биосурфактанты для биоремедиации грунтов, загрязненных углеводородами нефти»
Расскажите о себе что-нибудь еще: публикации, конференции, хобби
Соавтор 12 (за последние 5 лет) статей в рецензируемых научных журналах, 4 патентов.
Избранные публикации:
-
K.V. Petrikov, A.A. Vetrova, A.A. Ivanova, O.I. Sazonova, I.Yu. Pozdnyakova-Filatova. Generalization of classification of AlkB family alkane monooxygenases from Rhodococcus (sensu lato) group based on phylogenetic analysis and genomic context comparison // Int J Mol Sci. 2025. V. 26. No 4. 1713. 10.3390/ijms26041713
-
K.V. Petrikov, A.A. Rejepova, I.Yu. Pozdnyakova-Filatova. The AlkB1 alkane monooxygenase of Rhodococcus qingshengii strain X5 is not required for growth on alkanes // Microbiology. 2024. V. 93. No 5. P. 691–695. 10.1134/S0026261724604901
-
A.A. Vetrova, A.A. Ivanova, K.V. Petrikov, O. Gavrichkova, M.V. Korneykova, O.I. Sazonova. Antibiotic resistance as a functional characteristic of urban dust particles’ microbial communities // Biology. 2024. V. 13. No 12. 1022. 10.3390/biology13121022
-
Mullaeva, S.A., Delegan, Ya.A., Streletskii, R.A., Sazonova, O.I., Petrikov, K.V., Ivanova, A.A., Dyatlov, I.A., Shemyakin, I.G., Bogun A.G., Vetrova, A.A. Pseudomonas veronii strain 7–41 degrading medium-chain n-alkanes and polycyclic aromatic hydrocarbons. // Sci Rep. 2022. V. 12. 20527. 10.1038/s41598-022-25191-5
-
O. I. Sazonova, O. Gavrichkova, A. A. Ivanova, K. V. Petrikov, R. A. Streletskii, D. A. Sarzhanov, M. V. Korneykova, A. I. Novikov, V. I. Vasenev, K. V. Ivashchenko, M. V. Slukovskaya, A. A. Vetrova. Polycyclic aromatic hydrocarbon-degrading bacteria in three different functional zones of the cities of Moscow and Murmansk // Microorganisms. 2022. V. 10. No 10. 1979. 10.3390/microorganisms10101979
В настоящее время продолжаю удалённо участвовать в проекте лаборатории анализа метагеномов, Сколтех, продолжающем тему выпускной работы Института Биоинформатики: Анализ геномных локусов защитных систем BREX- и RM‑типов для поиска новых и комплементарных систем.
Дополнительные ссылки
GitHub github.com/KirPetrikov/
CoLab R-3D293-00000-IU71X
ORCHID 0000-0003-4126-6537
Google Scholar ZpJsVkIAAAAJ
WoS ResearcherID JBJ-6877-2023
Scopus AuthorID 55700999300
ResearchGate https://www.researchgate.net/profile/Kirill-Petrikov