Елизавета В.

Биоинформатик

Интересуют проекты и частичная занятость.

Последнее обновление резюме 10.01.2025
Адрес Москва, Russian Federation
Электронная почта Заблокировано
Телефон Заблокировано
Соцсеть или сайт Заблокировано

Опыт

National Laboratory Astana
Биоинформатик, аналитик данных
Май 2024 - Июл 2024
Проектная работа в лаборатории метагенома человека.
-Анализ метагеномных данных: альфа-разнообразие, бета-разнообразие, relative abundance, LefSe анализ.
-Анализ изменения микробиома пациентов с ревматическим артритом с результатами иммунологического исследования, клинических данных. Сравнение с контрольной группой.
-Корреляционных анализ изменения уровня цитокинов с приёмом пробиотиков.
-Python, R (MaAslin2), Galaxy (LefSe)
ФГБУ ФНКЦ ФХМ ФМБА России, лаборатория молекулярной патофизиологии
Биоинформатик
Авг 2023 - Текущий
-Анализ метаболомных и липидомных данных (ГХ-МС, ВЭЖХ-МС). Основное направление исследований - воспалительные заболевания кишечника.
-Статистический анализ: тест Манна-Уитни, критерий Краскела-Уоллиса, поправка на множественное сравнение Бонферрони, FDR, корреляционный анализ, PCA, OPLS-DA
-Поиск критерия для оценки риска возникновения ВЗК: ROC-анализ
-Визуализация результатов: boxplots, heatmap, кластеризация
-Работа с базой данных: European Genome-Phenome Archive
-Python (pandas, matplotlib, seaborn, sklearn, scipy), bash, R
-Работа на вычислительном кластере
ДС БАРС
Инженер-программист
Авг 2023 - Авг 2023
Тестирование ПО
National center for Biotechnology, Лаборатория геномики растений и биоинформатики
Биоинформатик-стажер
Июл 2023 - Авг 2023
-Обработка данных секвенирования по Сэнгеру
-Сборка генома хлоропласта тюльпанов
-Выравнивание на референсную последовательность
-Определение вида тюльпана по маркерам: its, rbcl
-Филогенетический анализ
-BLAST, Geneious, SeqMan, MEGA
КОНВЕЛС Автоматизация, ООО
Инженер-исследователь физик программист
Ноя 2022 - Июл 2023
-Расчёт коэффициентов поглощения, колибровочных коэффициентов, точности измерительных устройств (плотномеров, уровнемеров, сигнализаторов уровня, толщиномеров), времени усреднения устройств.
-Моделирование физических процессов (гамма излучение, обратное гамма излучение) с использованием Python.
-Моделирование потоков газа (воздуха и различных смесей) в трубопроводе в Solidworks Flow Simulation для расчёта расхода газа (моделирование работы расходомера).
-Написание и редактирование алгоритмов для ПО уровнемера, плотномера, толщиномера, калийметра.
-Использование фильтра скользящего среднего и фильтра Калмана.
-Моделирование работы сканирующих триангуляционных лазерных датчиков.
ФГБУН институт радиотехники и электроники имени В. А. Котельникова Российской академии наук
Исследователь-радиофизик
Фев 2019 - Июн 2021
-Исследование воздействия импульсных электромагнитных помех на устойчивость работы электронных автоколебательных систем.
-Моделирование колебаний осциллятора Ван-дер-Поля на Matlab. Анализ влияния внешних электромагнитных импульсов на меандр колебаний. Получение аналитических формул.
-Моделирование колебаний кольцевого генератора, используя Matlab. -Использование модели Шихмана-Ходжеса для моделирования транзисторов. -Анализ влияния электромагнитных импульсов на кольцевые генераторы.

Образование

Институт Биоинформатики
Алгоритмическая биоинформатика 2.0
Сен 2024 - Дек 2024
Курс повышения квалификации
Итоговый проект: "Поиск фазовых вариаций в геномах на основе длинных прочтений"
ВШЭ
Летняя школа по кардиогенетике
Авг 2024 - Авг 2024
Проект: поиск полиморфизмов, ассоциированных с кардиологическими заболеваниями, создание кардиопанели
Томский государственный университет
Анализ омиксных данных
Дек 2023 - Дек 2023
Курс повышения квалификации
МГУ им. М.В.Ломоносова
Аспирантура Физического факультета, Биофизика
Окт 2023 - Текущий
Тема диссертации: "Электронный парамагнитный резонанс бактериальных биомолекулярных комплексов"
ТГУ, Лаборатория анализа метагеномов Skoltech
Анализ бактериальных метагеномов
Сен 2023 - Окт 2023
Курс повышения квалификации
Томский государственный университет
Введение в биоинформатику
Сен 2023 - Сен 2023
Курс повышения квалификации
Skoltech
Высокопроизводительные методы анализа генома
Сен 2023 - Дек 2023
Курс профессиональной переподготовки, вольный слушатель

Итоговый проект: Анализ дифференциальной экспрессии генов
МГУ им. М.В.Ломоносова
Магистратура Физического факультета, Физика конденсированных сред и сложных систем
Сен 2021 - Июн 2023
Магистерская диссертация: http://genphys.phys.msu.ru/rus/diploma/diploma2023/2023_VorobievaEA.pdf
МГУ им. М.В.Ломоносова
Бакалавриат Физического факультета, Физика, Кафедра общей физики
Сен 2017 - Июн 2021
Бакалаврская ВКР: http://genphys.phys.msu.ru/rus/diploma/diploma2021/2021_VorobievaEA.pdf

В чем вы сильны?

Выполняла проекты по статистическому анализу метаболома, липидома и метагенома, анализу дифф экспрессии, написание скриптов для оптимизации работы с vsftools, plink и для форматирования данных для seurat

Расскажите о себе что-нибудь еще: публикации, конференции, хобби

SPIN-код: 9906-7633
AuthorID: 1233147
Scopus Author ID: 57209433661
ResearcherID: HSG-0587-2023