Роман П.
Биоинформатик в области scRNA-seq и Deep LearningГотов удалённо взяться за анализ ваших данных NanoString Sprint и NGS, в особенности данных NGS мультиомики (транскриптомики (scRNA-seq), протеомики поверхностных белков, ATAC-seq) единичных клеток как 10X Chromium, так и BD Rhapsody, и данных пространственной транскриптомики (10X Visium / GeoMX DSP).
Владею Seurat v5, в том числе WNN, CellChat, pySCENIC, Monocle, scanpy, squidpy, keras.
Готов также оказать услуги по оказанию помощи в подготовке scRNA-seq экспериментов и экспериментов с пространственной транскриптомикой.
Если чего-то нет в списке моих навыков - готов при надобности освоить и применить в работе!
| Последнее обновление резюме | 23.09.2023 |
| Адрес | Новосибирск, Russian Federation |
| Электронная почта | Заблокировано |
| Телефон | Заблокировано |
Образование
НОВОСИБИРСКИЙ ГОСУДАРСТВЕННЫЙ МЕДИЦИНСКИЙ УНИВЕРСИТЕТ
В чем вы сильны?
Мои ключевые интересы лежат в области постановки и анализа данных scRNA-seq и пространственной транскриптомики, а также построения Deep Learning моделей на основе полученных данных.
Первым поставил секвенирование единичных клеток на платформе BD Rhapsody в Новосибирске, все этапы, за исключением секвенирования, проводил сам - от подготовки клеток, до анализа данных.
Владею:
R: Seurat, Monocle, Cell Chat
Python 3: pySCENIC, Pandas, MatPlotLib, NumPy, seaborn, Keras, TensorFlow, GSEApy, bioinfokit
Биоинформатическое ПО: SeqGeq, GraphPad Prism, Cytoscape, nSolver
Другое ПО: Word, Excel, Power Point, Final Cut Pro
Расскажите о себе что-нибудь еще: публикации, конференции, хобби
https://orcid.org/0000-0002-5055-4859