Артем А.
Биолог, начинающий биоинформатикВ данный момент ищу работу на полный день в области клинической биоинформатики для получения опыта и реализации полученных при обучении навыков на практике. Хотел бы работать с данными NGS, включая как геномные исследования и интерпретацию различных вариантов у пациентов, так и транскриптомику.
Последнее обновление резюме | 05.12.2022 |
Адрес | Санкт-Петербург, Russian Federation |
Электронная почта | Заблокировано |
Телефон | Заблокировано |
Соцсеть или сайт | Заблокировано |
Опыт
лаборант-исследователь
Образование
ИТМО
Санкт-Петербургский государственный университет
В чем вы сильны?
Имею классический биологический бэкграунд и широкие представления о различных областях биологии и методах. Умею работать с литературой и технической документацией и быстро осваиваться в новых для себя областях.
Имею базовые навыки программирования на Python и R, а также написания bash скриптов и работы в командной строке. Есть опыт работы с библиотеками numpy, pandas, matplotlib, seaborn, scikit-learn, scanpy на Python и ggplot2, dplyr, DESeq2, limma в R. Кроме того знаком с Docker, Snakemake и git.
В ходе обучения получил навыки обработки данных NGS для медицинской генетики, анализа дифференциальной экспрессии генов в транскриптомике, анализа ChIP-seq данных в эпигенетических исследованиях. Также имею опыт филогенетического анализа.
Расскажите о себе что-нибудь еще: публикации, конференции, хобби
Имею трехлетний опыт работы в "мокрой" лаборатории. Изучаю экспрессию генов методом гибридизации in situ в процессах регенерации, эмбрионального развития и бесполого размножения у кольчатых червей. В ходе работы изучал гены-маркеры стволовых клеток (vasa, piwi, pl10, nanos, pumilio, tudor, bruno), а также гены, кодирующие транскрипционные факторы, важные для паттернирования и установления плана строения тела животных (Hox, ParaHox, Pax, brachyury). Результаты неоднократно докладывались на конференциях и в данный момент готовятся к публикации.