Никита С.

биоинформатик

Работу для совмещения с обучением в аспирантуре

Последнее обновление резюме 11.01.2023
Адрес Moscow, Russian Federation
Электронная почта Заблокировано
Телефон Заблокировано
Соцсеть или сайт Заблокировано

Опыт

Институт Молекулярной Генетики Национального исследовательского центра «Курчатовский институт», г. Москва
Биоинформатик
Апр 2021 - Текущий
Моя работа заключалась в кластеризации генетических данных методами машинного обучения. В
своей работе я:
1) настроил базу данных MySQL для хранения результатов кластеризации и администрировал ее
2) написал код Python, считывающий исходные данные, проводящий их кластеризацию,
записывающий результаты кластеризации в базу данных MySQL, а также эмпирическим путем
находил наиболее оптимальные параметры алгоритмов кластеризации
3) применил такие методы кластеризации как k-means, DBSCAN, HDBSCAN, spectral clustering, affinity propagation, hierarchy
4) при дальнейшей обработке данных работал с биоинформатическим программным обеспечением
Plink, SNPeff, Haploview
5) проводил статистический обсчет (тесты Хи-квадрат) получаемых результатов и интерпретировал их.

Также в рамках решения другой задачи использовал методы классификации (Деревья решений, Случайный лес)

Образование

Российский национальный исследовательский медицинский университет им. Н.И. Пирогова, Москва
медико-биологический, Медицинская биохимия
Авг 2017 - Июл 2022

В чем вы сильны?

  • Языки программирования: Python, R, Javascript
  • Реляционные БД: MS SQL Server, MySQL
  • Нереляционные БД: Redis
  • ML & Big data: Sklearn, NumPy, Pandas, openCV, TensorFlow 
  • Специализированное программное обеспечение: Plink, SNPeff, Haploview, Cytoscape, Knime, AutoDocker
  • Иностранные языки: английский (свободный), французский (базовый)