Никита С.
биоинформатикРаботу для совмещения с обучением в аспирантуре
Последнее обновление резюме | 11.01.2023 |
Адрес | Moscow, Russian Federation |
Электронная почта | Заблокировано |
Телефон | Заблокировано |
Соцсеть или сайт | Заблокировано |
Опыт
Институт Молекулярной Генетики Национального исследовательского центра «Курчатовский институт», г. Москва
Биоинформатик
Биоинформатик
Апр 2021
- Текущий
Моя работа заключалась в кластеризации генетических данных методами машинного обучения. В
своей работе я:
1) настроил базу данных MySQL для хранения результатов кластеризации и администрировал ее
2) написал код Python, считывающий исходные данные, проводящий их кластеризацию,
записывающий результаты кластеризации в базу данных MySQL, а также эмпирическим путем
находил наиболее оптимальные параметры алгоритмов кластеризации
3) применил такие методы кластеризации как k-means, DBSCAN, HDBSCAN, spectral clustering, affinity propagation, hierarchy
4) при дальнейшей обработке данных работал с биоинформатическим программным обеспечением
Plink, SNPeff, Haploview
5) проводил статистический обсчет (тесты Хи-квадрат) получаемых результатов и интерпретировал их.
Также в рамках решения другой задачи использовал методы классификации (Деревья решений, Случайный лес)
своей работе я:
1) настроил базу данных MySQL для хранения результатов кластеризации и администрировал ее
2) написал код Python, считывающий исходные данные, проводящий их кластеризацию,
записывающий результаты кластеризации в базу данных MySQL, а также эмпирическим путем
находил наиболее оптимальные параметры алгоритмов кластеризации
3) применил такие методы кластеризации как k-means, DBSCAN, HDBSCAN, spectral clustering, affinity propagation, hierarchy
4) при дальнейшей обработке данных работал с биоинформатическим программным обеспечением
Plink, SNPeff, Haploview
5) проводил статистический обсчет (тесты Хи-квадрат) получаемых результатов и интерпретировал их.
Также в рамках решения другой задачи использовал методы классификации (Деревья решений, Случайный лес)
Образование
Российский национальный исследовательский медицинский университет им. Н.И. Пирогова, Москва
медико-биологический, Медицинская биохимия
медико-биологический, Медицинская биохимия
Авг 2017
- Июл 2022
В чем вы сильны?
- Языки программирования: Python, R, Javascript
- Реляционные БД: MS SQL Server, MySQL
- Нереляционные БД: Redis
- ML & Big data: Sklearn, NumPy, Pandas, openCV, TensorFlow
- Специализированное программное обеспечение: Plink, SNPeff, Haploview, Cytoscape, Knime, AutoDocker
- Иностранные языки: английский (свободный), французский (базовый)