Ангелина К.

Биоинформатик/Data engineer

Бакалавр направления "Программная инженерия".
Профессиональные интересы включают: интегрированный анализ больших данных, подходы машинного обучения, облачные вычисления в медицинской сфере.

Последнее обновление резюме 15.04.2024
Адрес Москва, Russian Federation
Электронная почта Заблокировано
Телефон Заблокировано
Соцсеть или сайт Заблокировано

Опыт

Армянский Институт Биоинформатики, Объединенный Институт Ядерных Исследований
Биоинформатик
Июн 2022 - Текущий
Интегрированный анализ мультиомиксных данных в гематоонкологии/Полногеномный анализ ломких сайтов человека
Были исследованы регуляторные механизмы и процессы, лежащие
в основе двух типов рака крови - DLBCL и LAML. Я использовала библиотеки регрессии на Python, такие как statsmodels OLS, GLM, scipy.pearsonr, пакет R arules для поиска ассоциативных правил, Enrichr, GeneTrail2 и TCGA. Работа с NGS данными, включая CpG-острова, ReMap ChIP-seq, Atac-seq, места репликациии MIDAS, используя Biopython, RepeatMasker и алгоритмы машинного обучения: PCA, XGBoost, LogisticRegression и Ensemble model (KNeighbors, LinearSVC, GaussianNB, RandomForest).
Ветеринарная станция Новосибирской области (с. Усть-Тарка)
Full-stack разработчик
Фев 2022 - Июн 2022
Проектирование информационной системы для ветеринарной аптеки. Полученные навыки: создание веб-приложений с использованием HTML5/CSS, JavaScript (JQuery), PHP и MySQL. https://github.com/lateNighter/DemetraIS

Образование

UC Davis, online
Distributed Computing with Spark SQL
Июл 2023 - Авг 2023
https://coursera.org/share/eb67a6b3b7be9775388da38ee858acb3
World Health Organization, online
Ethics and Governance of Artificial Intelligence for Health
Июн 2023 - Июл 2023
https://drive.google.com/file/d/1LdTmSaWIlj3VIIKHmO3gBjgQomfLrrbX/view?usp=sharing
Университет Дубна
Школа технологического предпринимательства
Окт 2022 - Июл 2023
Менеджмент в области управления проектами, 240ч. Повышение квалификации
Armenian Bioinformatics Institute, online
OMICSS Guide (Биоинформатика)
Мар 2022 - Июн 2022
Изучено: Molecular Biology, Statistics and R, NGS, Experimental Techniques.
Университет Дубна, ОИЯИ
Международная школа аналитики Больших данных
Окт 2021 - Июн 2023
Big data analytics, 594h. Повышение квалификации
Изучены: Machine Learning, Distributed Data Processing, Computer Vision, NLP
Государственный Университет "Дубна"
Программная инженерия, Бакалавр, с отличием
Сен 2019 - Июл 2023
Изучены: Algorithms and Data Structures, Information Systems Design,
Databases, Object-oriented Programming, Mobile Development, Software Testing.

В чем вы сильны?

Биоинформатика: Nextflow, Snakemake, SAMtools, BEDtools, Biopython, TCGA, NCBI Genome Browser, Enrichr, GeneTrail2

Машинное обучение: NumPy, Pandas, Scikit learn, Matplotlib, Seaborn, Tensorflow, PySpark, spaCy, NLTK, SciPy, statsmodels 

Data engineering: PostgreSQL, Oracle, MS SQL Server, Apache NiFi, Grafana, Power BI, Pentaho DI, InfluxDB, OpenMetadata, Cassandra, Spark, Databricks, Mode analytics.

Языки программирования: Python, R, C#, Java, C++

DevOps: Git, Bash, Docker, Serverless Backend in Yandex Cloud 

Языки: Английский (свободный, IELTS - C1), Немецкий (A1)

 

Расскажите о себе что-нибудь еще: публикации, конференции, хобби

Награды
11/2023 Лауреат I степени Всероссийской научно-практической конференции имени Жореса Алферова, Центр поддержки некоммерческих организаций "ОПОРА"
За результаты исследовательского проекта "Интегрированный анализ мультиомиксных данных в гематоонкологии".
[публикация]
10/2023 Финалист программы стипендий, Благотворительный фонд "Система"
Представила проект по разработке приложения для поддержки психического здоровья для сети медицинских центров МЕДСИ.
05/2022 Победившая команда Хакатона, ОЭЗ "Дубна"
Разработали информационную систему для мониторинга измерений физических детекторов. Автоматизировала создание PDF-отчетов и сконфигурировала SMTP-сервер.
10/2021 1-е место на круглом столе "Цифровые платформы: новые возможности в бизнесе, образовании, здравоохранении и культуре", Государственный университет Дубна с докладом "Цифровые платформы, изменившие туризм".
03/2019 1-е место в городской олимпиаде по информатике, Сибирский государственный университет телекоммуникаций и информационных наук

Предпринимательство

Участие в нескольких акселераторах Сколково со стартапом в области психологии (разработка веб-приложения дневника с использованием computer vision, speech-to-text и бессерверной архитектурой в облаке), работа в команде.

Общественная деятельность
06/2023 Курс международного волонтера, АНО Goodsurfing
Обучение способам помощи обществу в международных волонтерских организациях, например, в ООН, НПО, рабочих лагерях, Европейском корпусе солидарности.
2022 Волонтерский поисково-спасательный отряд, Дубна
Помогала в поиске пропавших людей, включая информационную поддержку, подготовку объявлений об исчезновении, освоение навыков ориентирования.
2019-2021 Организация культурных мероприятий в университете.